More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0923 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0923  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 141 aa  279  8.000000000000001e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000477215  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0660  translation initiation factor IF-3  74.26 
 
 		 176 aa  215  2e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000367528  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1253  translation initiation factor IF-3  68.79 
 
 		 144 aa  192  1e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00905146  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1203  translation initiation factor IF-3  68.09 
 
 		 150 aa  190  5e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000877866  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  53.96 
 
 		 173 aa  169  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1613  translation initiation factor IF-3  55.32 
 
 		 145 aa  168  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  56.2 
 
 		 197 aa  167  6e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  51.77 
 
 		 154 aa  165  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  53.57 
 
 		 171 aa  165  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  54.74 
 
 		 207 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  56.3 
 
 		 198 aa  163  5.9999999999999996e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1412  translation initiation factor IF-3  53.57 
 
 		 143 aa  163  6.9999999999999995e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000852308  normal  0.493061 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  52.86 
 
 		 172 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  51.43 
 
 		 165 aa  161  4.0000000000000004e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  55.47 
 
 		 173 aa  159  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2307  translation initiation factor IF-3  49.29 
 
 		 154 aa  159  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00282878  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1249  translation initiation factor IF-3  53.28 
 
 		 174 aa  157  6e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.246001 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  51.47 
 
 		 202 aa  156  9e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3039  translation initiation factor IF-3  49.64 
 
 		 212 aa  155  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271102  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  50 
 
 		 164 aa  155  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314962  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  51.43 
 
 		 164 aa  155  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0724  translation initiation factor IF-3  51.08 
 
 		 194 aa  154  3e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000346718  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25690  translation initiation factor 3  51.82 
 
 		 168 aa  155  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  50.37 
 
 		 202 aa  154  5.0000000000000005e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  50.74 
 
 		 190 aa  154  6e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3052  translation initiation factor IF-3  51.09 
 
 		 182 aa  153  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  50 
 
 		 179 aa  152  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  48.55 
 
 		 166 aa  152  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  47.83 
 
 		 166 aa  151  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3071  translation initiation factor IF-3  51.09 
 
 		 182 aa  152  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427548  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  47.83 
 
 		 166 aa  152  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  49.29 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0522  translation initiation factor IF-3  51.09 
 
 		 193 aa  152  2e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000692532  hitchhiker  0.000000579185 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  48.55 
 
 		 166 aa  152  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1763  translation initiation factor 3  50.38 
 
 		 137 aa  152  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  47.83 
 
 		 166 aa  152  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  47.83 
 
 		 195 aa  151  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  47.83 
 
 		 195 aa  151  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  47.83 
 
 		 195 aa  151  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  47.83 
 
 		 195 aa  151  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2066  translation initiation factor 3  51.08 
 
 		 179 aa  150  4e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.383221  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  48.89 
 
 		 219 aa  150  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  47.83 
 
 		 186 aa  150  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1316  translation initiation factor IF-3  51.49 
 
 		 351 aa  150  5.9999999999999996e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1311  translation initiation factor IF-3  51.11 
 
 		 164 aa  150  7e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000644552  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2418  translation initiation factor IF-3  49.64 
 
 		 196 aa  150  7e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  48.92 
 
 		 227 aa  150  8e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1314  translation initiation factor IF-3  52.14 
 
 		 185 aa  149  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241721  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2139  translation initiation factor IF-3  51.08 
 
 		 177 aa  149  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0045601  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0200  translation initiation factor IF-3  51.43 
 
 		 151 aa  149  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  48.92 
 
 		 243 aa  149  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5473  translation initiation factor IF-3  50.36 
 
 		 204 aa  149  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1218  translation initiation factor IF-3  49.26 
 
 		 173 aa  149  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0326522  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2150  translation initiation factor IF-3  52.14 
 
 		 173 aa  149  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0713  translation initiation factor 3  48.92 
 
 		 249 aa  149  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4742  translation initiation factor IF-3  49.63 
 
 		 176 aa  148  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676759  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11658  translation initiation factor IF-3  50.36 
 
 		 201 aa  148  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1161  translation initiation factor 3  51.11 
 
 		 154 aa  148  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  49.64 
 
 		 238 aa  148  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1301  translation initiation factor 3  49.28 
 
 		 175 aa  148  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.444006  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  49.64 
 
 		 225 aa  148  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 173 aa  147  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0428  translation initiation factor IF-3  47.14 
 
 		 156 aa  147  4e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  47.52 
 
 		 187 aa  147  6e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3169  translation initiation factor IF-3  48.18 
 
 		 277 aa  147  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22440  translation initiation factor 3  48.91 
 
 		 329 aa  147  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2638  translation initiation factor IF-3  52.52 
 
 		 169 aa  146  7e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294805  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0232  translation initiation factor 3  49.26 
 
 		 211 aa  147  7e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.627991  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2385  translation initiation factor IF-3  47.45 
 
 		 192 aa  147  7e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157849  normal  0.289584 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  52.59 
 
 		 190 aa  146  8e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  46.38 
 
 		 195 aa  146  8e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0221  translation initiation factor IF-3  48.92 
 
 		 186 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3542  initiation factor 3  51.08 
 
 		 175 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.407448  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4232  translation initiation factor IF-3  48.89 
 
 		 173 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738998 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0471  translation initiation factor IF-3  51.06 
 
 		 171 aa  146  1.0000000000000001e-34  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.973019  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  51.09 
 
 		 225 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 174 aa  145  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2218  translation initiation factor IF-3  47.86 
 
 		 182 aa  145  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000264089  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1341  translation initiation factor IF-3  51.09 
 
 		 173 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5483  translation initiation factor IF-3  49.64 
 
 		 250 aa  145  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195942  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  49.64 
 
 		 199 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3158  translation initiation factor IF-3  48.57 
 
 		 173 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2109  translation initiation factor IF-3  49.65 
 
 		 219 aa  145  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000273336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  51.09 
 
 		 192 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1103  translation initiation factor IF-3  48.51 
 
 		 233 aa  145  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0433779  normal  0.928932 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0065  translation initiation factor IF-3  49.26 
 
 		 184 aa  144  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  48.91 
 
 		 205 aa  145  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1241  translation initiation factor 3  47.76 
 
 		 170 aa  144  3e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000256408  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  47.41 
 
 		 181 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1477  translation initiation factor 3  48.18 
 
 		 396 aa  144  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0613769  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1875  translation initiation factor IF-3  47.48 
 
 		 239 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.384688 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1480  translation initiation factor IF-3  48.18 
 
 		 356 aa  144  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000187235 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1975  translation initiation factor IF-3  48.92 
 
 		 233 aa  144  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1882  translation initiation factor IF-3  47.48 
 
 		 204 aa  144  6e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0284235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14590  translation initiation factor 3  46.72 
 
 		 401 aa  143  7.0000000000000006e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  48.15 
 
 		 178 aa  143  7.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2908  translation initiation factor IF-3  48.57 
 
 		 185 aa  143  7.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1728  initiation factor 3  49.62 
 
 		 149 aa  143  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00351932  hitchhiker  0.00163995 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6087  Translation initiation factor 3 (IF-3)-like protein  49.64 
 
 		 222 aa  143  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3025  translation initiation factor 3  50.36 
 
 		 238 aa  143  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.335133 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>