More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1343 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1343  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
246 aa  490  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.428194  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1180  MotA/TolQ/ExbB proton channel  72.24 
 
 
247 aa  373  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1858  flagellar motor protein  62.45 
 
 
246 aa  315  4e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.403238  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3905  flagellar motor protein  63.27 
 
 
246 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.448269  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1568  flagellar motor protein  63.67 
 
 
246 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.709398  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4336  flagellar motor protein  63.67 
 
 
246 aa  311  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0869231  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1984  chemotaxis motA protein  62.04 
 
 
246 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.258638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3432  flagellar motor protein  61.63 
 
 
246 aa  310  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.228788  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1531  flagellar motor protein  63.27 
 
 
246 aa  310  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.270936  normal  0.422767 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3662  flagellar motor protein  63.27 
 
 
246 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45560  flagellar motor protein  61.63 
 
 
246 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.687243 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2800  flagellar motor protein  62.45 
 
 
246 aa  305  3e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.76835  normal  0.157366 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3866  flagellar motor protein  61.22 
 
 
246 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1970  flagellar motor protein  58.78 
 
 
246 aa  296  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00026  flagellar motor protein  59.75 
 
 
237 aa  295  4e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142899  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2159  flagellar motor protein  54.69 
 
 
246 aa  280  2e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.193133  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1314  flagellar motor protein  48.78 
 
 
246 aa  248  4e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0744  flagellar motor protein  49.39 
 
 
246 aa  247  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2933  flagellar motor protein  48.98 
 
 
246 aa  245  6e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.619192  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1524  chemotaxis MotA protein  47.15 
 
 
248 aa  238  5.999999999999999e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1949  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.57 
 
 
246 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1745  flagellar motor protein  47.13 
 
 
257 aa  230  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1250  flagellar motor protein  47.76 
 
 
245 aa  230  2e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.910285  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1745  flagellar motor protein  46.72 
 
 
257 aa  228  6e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.31 
 
 
254 aa  224  7e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3836  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.49 
 
 
254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0179071 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4079  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.67 
 
 
256 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3027  chemotaxis MotA protein  42.86 
 
 
254 aa  206  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0461  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.86 
 
 
254 aa  207  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.98 
 
 
249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0031  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.16 
 
 
249 aa  199  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4287  chemotaxis motA protein  42.56 
 
 
244 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1385  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.16 
 
 
261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2568  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.16 
 
 
261 aa  182  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.32 
 
 
265 aa  182  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210731  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2472  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.16 
 
 
261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.59 
 
 
260 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00444481  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0147  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.78 
 
 
267 aa  181  1e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2337  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.02 
 
 
257 aa  179  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.516554  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1072  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.04 
 
 
265 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2933  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.08 
 
 
255 aa  177  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4999  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.09 
 
 
254 aa  176  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.567523 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3589  chemotaxis protein MotA  36.89 
 
 
254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0052  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.08 
 
 
265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1376  putative flagellar motor protein (MotA)  34.98 
 
 
254 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0239  hypothetical protein  40.16 
 
 
263 aa  172  3.9999999999999995e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0060835  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1402  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.33 
 
 
266 aa  171  6.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.462015  normal  0.61336 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2017  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.43 
 
 
261 aa  170  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.358452  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3787  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.63 
 
 
254 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146883  normal  0.0197098 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4630  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.21 
 
 
254 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.220987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3734  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.21 
 
 
254 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0165356 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1295  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.62 
 
 
262 aa  169  5e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2359  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.63 
 
 
254 aa  169  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412046  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4599  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.39 
 
 
254 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.666334  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1535  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.44 
 
 
262 aa  167  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0851  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.78 
 
 
260 aa  167  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566101  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.33 
 
 
251 aa  167  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.51 
 
 
265 aa  166  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5469  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.21 
 
 
254 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0653  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.75 
 
 
260 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000451505 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.96 
 
 
277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163416  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3616  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.21 
 
 
254 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.593403  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.07 
 
 
252 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.822271 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31120  flagellar motor component  37.08 
 
 
253 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.229766  normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16780  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.92 
 
 
267 aa  165  8e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000859777  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1717  chemotaxis protein PomA  33.88 
 
 
251 aa  165  8e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.690132  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0968  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.24 
 
 
256 aa  164  8e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.13 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0578  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.29 
 
 
261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0614  flagellar motor protein MotA  34.69 
 
 
264 aa  160  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0355  flagellar motor protein MotA  36.55 
 
 
268 aa  160  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.55 
 
 
262 aa  160  1e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1168  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.73 
 
 
258 aa  160  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000172029  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3423  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.89 
 
 
245 aa  160  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0987  flagellar motor protein MotA  36.99 
 
 
263 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1172  proton conductor component of motor; no effect on switching  33.2 
 
 
257 aa  158  6e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2911  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.7 
 
 
252 aa  158  8e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000718069  normal  0.214195 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1269  chemotaxis protein PomA  34.29 
 
 
254 aa  157  2e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.942425  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0834  flagellar motor protein MotA  37.7 
 
 
253 aa  155  7e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2425  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.47 
 
 
279 aa  154  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000186684  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1660  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.88 
 
 
257 aa  152  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.894652 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2464  flagellar motor protein MotA  36.99 
 
 
263 aa  152  5e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.407079  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2981  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.12 
 
 
276 aa  152  5e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.44999 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0253  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.51 
 
 
262 aa  151  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0255  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.51 
 
 
262 aa  151  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1794  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.68 
 
 
272 aa  150  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2706  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.48 
 
 
266 aa  148  6e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2787  flagellar motor protein PomA  34.69 
 
 
255 aa  148  7e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.315605  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0264  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.82 
 
 
266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1299  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.29 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.458392  normal  0.442571 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0749  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.26 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4621  flagellar motor protein MotA  35.1 
 
 
264 aa  146  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1322  flagellar motor protein PomA  35.51 
 
 
254 aa  146  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2768  flagellar motor protein PomA  34.15 
 
 
255 aa  145  6e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1740  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.25 
 
 
253 aa  144  9e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.793002 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0110  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
259 aa  144  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000377193  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0287  chemotaxis protein MotA (Motility protein A)  33.88 
 
 
260 aa  144  1e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3219  flagellar motor protein PomA  34.29 
 
 
253 aa  144  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2078  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.54 
 
 
257 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.174751  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1278  flagellar motor protein PomA  33.47 
 
 
255 aa  143  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.398192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>