More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0788 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0788  ABC transporter related  100 
 
 		 600 aa  1223    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0617  ABC transporter related protein  50.68 
 
 		 611 aa  592  1e-168  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.10554  normal  0.226298 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0759  ABC transporter related  47.59 
 
 		 600 aa  574  1.0000000000000001e-162  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.165063  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3900  ABC transporter related  50.18 
 
 		 568 aa  533  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2355  ABC transporter related  48.09 
 
 		 603 aa  529  1e-149  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.916251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2356  ABC transporter related  43.03 
 
 		 583 aa  472  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1562  ABC transporter related  42.54 
 
 		 605 aa  466  9.999999999999999e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.36588  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2527  ABC transporter related protein  43.34 
 
 		 599 aa  458  1e-127  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0489223 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0122  ABC transporter related  42.38 
 
 		 628 aa  456  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2321  ABC transporter related  40.5 
 
 		 625 aa  434  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100334 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0652  efflux ABC transporter ATP-binding protein  40.13 
 
 		 599 aa  420  1e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0177211  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2624  ABC transporter related  38.45 
 
 		 596 aa  391  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2847  ABC transporter related  39.53 
 
 		 586 aa  390  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.682439 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2654  ABC transporter related  40.07 
 
 		 596 aa  389  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2068  ABC transporter related  41.47 
 
 		 583 aa  384  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561392  normal  0.0697813 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5187  ABC transporter related  39.39 
 
 		 585 aa  363  6e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1383  ATPase  36.66 
 
 		 614 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.267423 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0373  ABC transporter-related protein  35.19 
 
 		 594 aa  350  6e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.257292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29930  ABC transporter protein  35.09 
 
 		 613 aa  327  3e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0292656  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0523  ABC transporter related  32.62 
 
 		 571 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1312  ATPase  36.66 
 
 		 600 aa  309  1.0000000000000001e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4465  ABC transporter related  37.87 
 
 		 585 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269199 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2172  ABC transporter related  33.12 
 
 		 610 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1117  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.38 
 
 		 601 aa  293  5e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1250  ABC transporter, ATP-binding protein/permease, glycan transport  30.22 
 
 		 564 aa  293  6e-78  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0898  phospholipid-lipopolysaccharide ABC transporter  31.21 
 
 		 601 aa  292  1e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14091  hypothetical protein  30.72 
 
 		 599 aa  275  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0591  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.45 
 
 		 564 aa  275  2.0000000000000002e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.234027  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14501  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  30.38 
 
 		 586 aa  264  3e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14231  hypothetical protein  30.12 
 
 		 586 aa  263  6e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1147  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.28 
 
 		 564 aa  263  6e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1272  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.1 
 
 		 564 aa  259  9e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1332  ATPase  29.4 
 
 		 576 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00148661  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3683  ATPase  30.76 
 
 		 603 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01101  hypothetical protein  30.76 
 
 		 611 aa  244  3e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1411  ATPase  30.93 
 
 		 611 aa  244  5e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08650  ABC-type bacteriocin/lantibiotic exporter with N-terminal double-glycine peptidase domain  33.27 
 
 		 606 aa  243  7e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00581  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  28.54 
 
 		 610 aa  234  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.779768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0168  ATPase  31.57 
 
 		 612 aa  229  1e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.334889  normal  0.167658 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01541  hypothetical protein  28.28 
 
 		 552 aa  227  4e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.29572  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3896  ABC transporter related  31.96 
 
 		 626 aa  223  7e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.227189  normal  0.0393821 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3273  ABC transporter related  28.16 
 
 		 607 aa  223  8e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25671  putative ABC transporter  30.04 
 
 		 605 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1128  ABC transporter related protein  30.91 
 
 		 613 aa  209  9e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0198  ATPase  29.01 
 
 		 613 aa  207  6e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.312948  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  34.18 
 
 		 575 aa  203  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3858  ABC transporter-related protein  34.09 
 
 		 589 aa  203  6e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11901  multidrug ABC transporter  29.41 
 
 		 590 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3381  ABC transporter related  27.98 
 
 		 599 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0477637  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  32.07 
 
 		 582 aa  199  1.0000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2965  heavy metal ABC transporter (HMT) family permease/ATP-binding protein  35.06 
 
 		 596 aa  199  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3037  ABC transporter related  35.06 
 
 		 596 aa  199  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752623  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1866  heavy metal ABC transporter (HMT) family permease/ATP-binding protein  35.06 
 
 		 631 aa  197  3e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.024089 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  31.22 
 
 		 588 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4682  ABC transporter related  29.84 
 
 		 597 aa  196  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.582137  normal  0.306509 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  38.97 
 
 		 596 aa  195  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0310  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.58 
 
 		 592 aa  195  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  28.81 
 
 		 578 aa  194  4e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12061  multidrug ABC transporter  29.27 
 
 		 590 aa  193  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3270  ABC transporter related  27.23 
 
 		 594 aa  193  7e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.255104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2121  ABC transporter related  30.46 
 
 		 592 aa  192  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0469837  normal  0.034956 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  28.04 
 
 		 644 aa  192  1e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12051  multidrug ABC transporter  29.53 
 
 		 590 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3988  ABC transporter related  29.41 
 
 		 597 aa  192  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  29.63 
 
 		 592 aa  192  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  31.48 
 
 		 595 aa  191  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2533  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  31.02 
 
 		 590 aa  191  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.611222  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2971  hypothetical protein  26.24 
 
 		 610 aa  191  5e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.570189  normal  0.54511 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0994  ABC transporter related  32.48 
 
 		 652 aa  191  5e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  30.45 
 
 		 585 aa  190  5.999999999999999e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0757  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  27.79 
 
 		 594 aa  190  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00726386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1769  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.28 
 
 		 597 aa  190  5.999999999999999e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.631617  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  30.74 
 
 		 596 aa  189  9e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  42.08 
 
 		 625 aa  189  9e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0276  ABC transporter related  27.88 
 
 		 583 aa  189  9e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1823  ABC transporter related  43.04 
 
 		 586 aa  189  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1719  ABC transporter ATP-binding protein  29.07 
 
 		 616 aa  189  2e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  31.31 
 
 		 578 aa  189  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1110  ATPase  30.04 
 
 		 590 aa  188  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.551514  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  42.15 
 
 		 591 aa  188  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  43.46 
 
 		 596 aa  189  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2309  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.87 
 
 		 582 aa  188  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.928794  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  43.85 
 
 		 603 aa  188  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1395  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.69 
 
 		 610 aa  187  3e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.507365  hitchhiker  0.000128889 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.53 
 
 		 574 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.53 
 
 		 574 aa  187  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.11 
 
 		 596 aa  187  5e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  28.62 
 
 		 601 aa  187  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  28.62 
 
 		 601 aa  187  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0009  ABC transporter related  39.92 
 
 		 597 aa  187  6e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3581  ABC transporter related  35.6 
 
 		 599 aa  186  7e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.689947 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  28.95 
 
 		 618 aa  186  8e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  36.12 
 
 		 585 aa  186  9e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  42.56 
 
 		 619 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1519  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  41.35 
 
 		 581 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2054  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.06 
 
 		 593 aa  186  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0316  ABC transporter related  29.51 
 
 		 607 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  30 
 
 		 575 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4572  ABC transporter, transmembrane region  34.83 
 
 		 546 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1375  ABC transporter related  28.78 
 
 		 651 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>