111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2305 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2305  putative regulator  100 
 
 		 77 aa  157  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0521  protein of unknown function DUF397  75 
 
 		 77 aa  123  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3445  hypothetical protein  75.34 
 
 		 78 aa  116  7.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1295  hypothetical protein  75.34 
 
 		 78 aa  116  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.471559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2513  hypothetical protein  68 
 
 		 78 aa  114  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4075  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1230  hypothetical protein  68.42 
 
 		 77 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.375294 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0876  protein of unknown function DUF397  64.47 
 
 		 80 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0567  protein of unknown function DUF397  63.51 
 
 		 95 aa  103  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2090  hypothetical protein  65.75 
 
 		 79 aa  101  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161003  normal  0.0235666 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2231  hypothetical protein  64.38 
 
 		 79 aa  100  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0143015  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1504  protein of unknown function DUF397  64.86 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37900  protein of unknown function (DUF397)  63.89 
 
 		 82 aa  98.2  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4153  protein of unknown function DUF397  63.01 
 
 		 78 aa  95.5  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5736  hypothetical protein  64.47 
 
 		 80 aa  94.4  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.534328 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1969  protein of unknown function DUF397  64.52 
 
 		 76 aa  91.7  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00185784  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5628  hypothetical protein  52 
 
 		 78 aa  88.2  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8470  protein of unknown function DUF397  46.03 
 
 		 92 aa  68.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  46.27 
 
 		 77 aa  67  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  53.45 
 
 		 69 aa  66.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  51.72 
 
 		 67 aa  63.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  50.88 
 
 		 69 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14270  protein of unknown function (DUF397)  47.62 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0266  protein of unknown function DUF397  45 
 
 		 69 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.687438  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6482  hypothetical protein  43.24 
 
 		 76 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.435568 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  46.88 
 
 		 68 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0397  hypothetical protein  41.79 
 
 		 69 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1597  hypothetical protein  44.62 
 
 		 70 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  38.24 
 
 		 67 aa  58.2  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0265  protein of unknown function DUF397  40.98 
 
 		 68 aa  57  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138869  normal  0.97902 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1588  hypothetical protein  44.62 
 
 		 71 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1548  hypothetical protein  44.62 
 
 		 71 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0220305  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  45.9 
 
 		 80 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6312  protein of unknown function DUF397  46.88 
 
 		 74 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61619  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3763  protein of unknown function DUF397  37.84 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12020  protein of unknown function (DUF397)  46.67 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0599  hypothetical protein  42.11 
 
 		 69 aa  53.5  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  38.67 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20610  protein of unknown function (DUF397)  45.61 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.069741  normal  0.682793 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1329  hypothetical protein  43.55 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3476  hypothetical protein  42.86 
 
 		 72 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  42.19 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12060  protein of unknown function (DUF397)  45.61 
 
 		 65 aa  51.2  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3856  hypothetical protein  45.61 
 
 		 72 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20560  protein of unknown function (DUF397)  42.11 
 
 		 66 aa  50.4  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0993  hypothetical protein  40.62 
 
 		 67 aa  50.4  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7976  hypothetical protein  39.19 
 
 		 80 aa  50.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0545278  normal  0.164909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1019  hypothetical protein  37.5 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0905  hypothetical protein  35.82 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0955654 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3784  hypothetical protein  40.28 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  43.33 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1517  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  48.9  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0185029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3941  protein of unknown function DUF397  39.66 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272319  normal  0.0398541 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0787  hypothetical protein  38.6 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.679584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2969  hypothetical protein  40.74 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000849623 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2128  protein of unknown function DUF397  36.84 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996693  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1230  protein of unknown function DUF397  40.98 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0779142  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4124  hypothetical protein  36 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1445  protein of unknown function DUF397  39.62 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.12043  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2543  hypothetical protein  40.32 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6435  protein of unknown function DUF397  50 
 
 		 57 aa  47.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6018  protein of unknown function DUF397  58.82 
 
 		 89 aa  47  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.260789  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0718  protein of unknown function DUF397  37.88 
 
 		 73 aa  47  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1505  protein of unknown function DUF397  39.34 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.272297  hitchhiker  0.00205006 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2601  hypothetical protein  43.75 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0203178  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1304  protein of unknown function DUF397  41.38 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379944  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4454  protein of unknown function DUF397  39.68 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  45.16 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7828  hypothetical protein  35.29 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1767  hypothetical protein  40 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2448  hypothetical protein  38.18 
 
 		 62 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14038  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5086  hypothetical protein  36.99 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000003971 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36640  protein of unknown function (DUF397)  36.21 
 
 		 83 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0015395  normal  0.323981 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1786  hypothetical protein  38.33 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1943  protein of unknown function DUF397  41.51 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00825556  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3503  protein of unknown function DUF397  40.98 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1132  hypothetical protein  38.6 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2128  hypothetical protein  41.82 
 
 		 62 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0927  hypothetical protein  46.94 
 
 		 63 aa  44.3  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  37.31 
 
 		 69 aa  44.3  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0513  hypothetical protein  41.82 
 
 		 62 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.47229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1897  hypothetical protein  39.34 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1379  hypothetical protein  44.9 
 
 		 63 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383201  hitchhiker  0.00799748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1159  hypothetical protein  40 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0339608  unclonable  0.0000000343885 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0643  hypothetical protein  41.67 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3009  hypothetical protein  38.33 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4235  hypothetical protein  34.43 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0716  protein of unknown function DUF397  33.33 
 
 		 65 aa  42.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4159  protein of unknown function DUF397  41.07 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4579  protein of unknown function DUF397  40 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7553  hypothetical protein  37.97 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0973  hypothetical protein  39.62 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1416  hypothetical protein  42.86 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0509701 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4463  hypothetical protein  37.29 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3236  hypothetical protein  36.67 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4685  hypothetical protein  40.3 
 
 		 69 aa  42  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.144765  normal  0.226614 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1984  protein of unknown function DUF397  40 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00383957  normal  0.845583 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0417  protein of unknown function DUF397  37.04 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1444  protein of unknown function DUF397  41.51 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.184265  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3657  hypothetical protein  37.29 
 
 		 62 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3743  hypothetical protein  33.85 
 
 		 75 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>