26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4049 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4049  hypothetical protein  100 
 
 
541 aa  1107    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.49668  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0720  hypothetical protein  59.59 
 
 
562 aa  626  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1526  hypothetical protein  54.38 
 
 
546 aa  614  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0322  hypothetical protein  41.87 
 
 
548 aa  365  1e-100  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26411  hypothetical protein  35.61 
 
 
542 aa  297  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.425384 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2372  hypothetical protein  33.27 
 
 
543 aa  248  3e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2129  hypothetical protein  26.04 
 
 
463 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2177  hypothetical protein  26.04 
 
 
463 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0853  membrane protein-like protein  25.51 
 
 
579 aa  75.1  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.691101  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3886  membrane protein-like protein  25.1 
 
 
586 aa  73.9  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.920923 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10860  predicted membrane protein  28.33 
 
 
525 aa  67.8  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197063  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1451  Ets- domain containing protein  21.7 
 
 
463 aa  67.4  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1477  hypothetical protein  20.9 
 
 
463 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0545423  normal  0.74916 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4272  membrane protein-like protein  23.11 
 
 
478 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09720  predicted membrane protein  25.08 
 
 
481 aa  64.7  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.523461  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1053  membrane protein-like protein  20.99 
 
 
489 aa  63.9  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0150253  hitchhiker  0.00944494 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5205  membrane protein-like protein  25.21 
 
 
521 aa  56.2  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1179  hypothetical protein  23.86 
 
 
509 aa  56.6  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1346  Protein of unknown function DUF2079, membrane  29.88 
 
 
509 aa  55.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0001004 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0363  membrane protein-like  28.15 
 
 
486 aa  53.9  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115908  normal  0.868887 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0753  membrane protein-like protein  21.92 
 
 
659 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.844921  normal  0.0837231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0414  hypothetical protein  21.14 
 
 
520 aa  49.7  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.103112  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7352  putative integral membrane protein  23.33 
 
 
563 aa  47.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.33063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5084  hypothetical protein  24.41 
 
 
506 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.108071  normal  0.201189 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08120  predicted membrane protein  26.18 
 
 
455 aa  45.8  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117111  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4411  membrane protein-like protein  24.29 
 
 
663 aa  44.3  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0414403  normal  0.531187 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>