54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2368 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2368  von Willebrand factor, type A  100 
 
 
220 aa  459  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3137  von Willebrand factor type A  67.73 
 
 
224 aa  322  4e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1103  von Willebrand factor, type A  65 
 
 
224 aa  319  3e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0134  von Willebrand factor, type A  53.46 
 
 
218 aa  235  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864003  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0560  von Willebrand factor type A  56.02 
 
 
230 aa  235  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0637  von Willebrand factor, type A  52.56 
 
 
224 aa  227  1e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2107  von Willebrand factor type A  53.46 
 
 
254 aa  221  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2365  von Willebrand factor type A domain-containing protein  54.67 
 
 
219 aa  215  4e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1160  von Willebrand factor type A domain protein  54.67 
 
 
219 aa  215  5e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  49.76 
 
 
1204 aa  215  5e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.137165 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01978  hypothetical protein  54.67 
 
 
219 aa  214  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01967  hypothetical protein  54.67 
 
 
219 aa  214  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0987  von Willebrand factor type A domain-containing protein  54.67 
 
 
219 aa  214  8e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.233145 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1584  von Willebrand factor type A  54.21 
 
 
219 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1568  von Willebrand factor type A  54.21 
 
 
219 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.921097  normal  0.435058 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2215  von Willebrand factor type A domain-containing protein  54.21 
 
 
219 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3010  von Willebrand factor type A domain protein  54.21 
 
 
219 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.136954 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2880  von Willebrand factor type A domain protein  47.69 
 
 
225 aa  202  4e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.158441  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2499  von Willebrand factor type A  47.69 
 
 
225 aa  202  4e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.950174  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2727  von Willebrand factor, type A  41.85 
 
 
233 aa  182  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3006  hypothetical protein  40.93 
 
 
222 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0482  von Willebrand factor type A  38.1 
 
 
222 aa  154  9e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0810  von Willebrand factor, type A  42.35 
 
 
233 aa  151  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4762  von Willebrand factor type A domain protein  37.16 
 
 
224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4667  von Willebrand factor, type A  33.82 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40968  normal  0.0500765 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2991  von Willebrand factor type A  30.77 
 
 
219 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00948375  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4669  von Willebrand factor, type A  28.5 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264174  normal  0.0341202 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0629  hypothetical protein  30.39 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3685  von Willebrand factor type A  30.52 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.523422  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1170  von Willebrand factor type A  29.13 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.906773 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0570  von Willebrand factor type A  29.9 
 
 
212 aa  72  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1086  putative tellurium resistance protein  29.9 
 
 
212 aa  72  0.000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0508  putative tellurium resistance protein  29.9 
 
 
212 aa  72  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3687  von Willebrand factor type A  34.11 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.189845  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1166  von Willebrand factor type A  32.48 
 
 
212 aa  68.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0628  hypothetical protein  33.33 
 
 
212 aa  67  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4203  von Willebrand factor type A  35.54 
 
 
244 aa  67.4  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258867  normal  0.0187609 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3684  von Willebrand factor type A  27.32 
 
 
346 aa  65.5  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.497723  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0506  putative tellurium resistance protein  32.77 
 
 
212 aa  63.2  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0568  von Willebrand factor type A  29.87 
 
 
233 aa  63.2  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0505  putative tellurium resistance protein  26.34 
 
 
346 aa  62.4  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0567  von Willebrand factor type A  26.34 
 
 
346 aa  62.4  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1089  putative tellurium resistance protein  26.34 
 
 
346 aa  62.4  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5987  von Willebrand factor, type A  30.81 
 
 
248 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.919016  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1088  putative tellurium resistance protein  31.93 
 
 
222 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1498  von Willebrand factor type A  28.45 
 
 
228 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1643  von Willebrand factor type A  26.36 
 
 
223 aa  54.3  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1172  von Willebrand factor type A  27.23 
 
 
352 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4666  von Willebrand factor, type A  24.4 
 
 
350 aa  51.6  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.404551  normal  0.0464435 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7176  von Willebrand factor type A  27.27 
 
 
238 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135257  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0630  hypothetical protein  20.54 
 
 
343 aa  48.9  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3582  hypothetical protein  22.02 
 
 
202 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857055  normal  0.123891 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2065  von Willebrand factor type A  32.8 
 
 
380 aa  46.2  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3332  von Willebrand factor, type A  27.11 
 
 
477 aa  42  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0350677  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>