More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1812 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1812  Sec-independent protein translocase TatC  100 
 
 
285 aa  564  1e-160  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00710402  hitchhiker  0.000512966 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0387  Sec-independent protein translocase TatC  67.43 
 
 
264 aa  349  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.374464  normal  0.89902 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3986  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  65.75 
 
 
254 aa  349  4e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.786755 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0386  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  66.03 
 
 
264 aa  347  9e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.565784  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4349  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  66.4 
 
 
255 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4289  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  66.4 
 
 
255 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1429  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  65.12 
 
 
278 aa  331  7.000000000000001e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.219215 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1578  Sec-independent protein translocase TatC  61.45 
 
 
279 aa  317  1e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0630  Sec-independent protein translocase TatC  56.9 
 
 
267 aa  261  8.999999999999999e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.59388  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43950  Tat family transporter: protein export TatC  59.58 
 
 
284 aa  261  1e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.601024  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04641  Tat family protein secretion protein  50 
 
 
264 aa  259  4e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.174125  normal  0.993499 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1732  Sec-independent periplasmic protein translocase  54.13 
 
 
267 aa  248  6e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0464  protein secretion component, Tat family  51.82 
 
 
238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05201  Tat family protein secretion protein  50.44 
 
 
252 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04891  Tat family protein secretion protein  48.96 
 
 
252 aa  242  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1796  protein secretion component, Tat family  52.44 
 
 
239 aa  236  3e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05191  Tat family protein secretion protein  52 
 
 
239 aa  235  7e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.593552  normal  0.37508 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05281  Tat family protein secretion protein  47.28 
 
 
252 aa  223  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.35987  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06661  protein secretion component, Tat family  54.82 
 
 
246 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0991  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.44 
 
 
324 aa  150  3e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0395989  hitchhiker  0.000851053 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2494  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.9 
 
 
252 aa  143  4e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3123  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.48 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290973 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03800  Twin arginine targeting translocation protein , TatC subunit  37.9 
 
 
230 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0692  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.05 
 
 
257 aa  135  9e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.299574  normal  0.13691 
 
 
-
 
NC_002936  DET1599  Sec-independent protein translocase TatC  33.91 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144124  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0808  Sec-independent protein translocase TatC  34.05 
 
 
266 aa  132  6.999999999999999e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2680  Sec-independent protein translocase TatC  33.78 
 
 
271 aa  132  7.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1345  Sec-independent protein translocase TatC  32.61 
 
 
262 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.352913  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1481  sec-independent protein translocase TatC  32.17 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0260  Sec-independent protein translocase TatC  37.12 
 
 
244 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0872197  hitchhiker  0.00458614 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1489  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.78 
 
 
275 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.299654  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1808  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.76 
 
 
468 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0681  sec-independent protein translocase protein TatC  34.04 
 
 
283 aa  128  9.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000821362  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1687  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.2 
 
 
275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2610  Sec-independent protein translocase TatC  34.17 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2703  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.86 
 
 
263 aa  127  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1907  Sec-independent protein translocase TatC  33.74 
 
 
271 aa  126  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0775947  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2343  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.46 
 
 
274 aa  126  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0131452  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4204  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  31.2 
 
 
249 aa  125  6e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1211  Sec-independent protein translocase TatC  30.83 
 
 
299 aa  125  7e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1640  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.59 
 
 
249 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03731  TatABCE protein translocation system subunit  34.06 
 
 
258 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4141  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.06 
 
 
258 aa  125  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4170  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  34.06 
 
 
258 aa  125  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164858 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4310  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  34.06 
 
 
258 aa  125  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03680  hypothetical protein  34.06 
 
 
258 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4221  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  34.06 
 
 
258 aa  125  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142004 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4359  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  34.06 
 
 
258 aa  125  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2666  SEC-independent protein translocase protein  31.52 
 
 
270 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341088  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4062  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  34.06 
 
 
258 aa  125  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5279  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  34.06 
 
 
258 aa  125  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.613586  normal  0.20665 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1119  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.78 
 
 
241 aa  123  3e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0956  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.2 
 
 
268 aa  123  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0063  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.22 
 
 
270 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0346056  normal  0.0538922 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1804  Sec-independent protein translocase TatC  33.73 
 
 
288 aa  122  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226534  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1475  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.49 
 
 
259 aa  122  6e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000005557  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3556  Sec-independent protein translocase TatC  30.34 
 
 
249 aa  122  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0987  Sec-independent protein translocase TatC  28.97 
 
 
301 aa  122  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0884  Sec-independent protein translocase protein TatC  33.46 
 
 
274 aa  122  8e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0875  twin arginine-targeting protein translocase TatC  33.46 
 
 
274 aa  122  8e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.965079  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00562  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  32.3 
 
 
251 aa  122  8e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1648  Sec-independent protein translocase TatC subunit  34.33 
 
 
250 aa  122  9e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.889374  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0909  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.97 
 
 
280 aa  122  9e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12711  normal  0.120321 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1268  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.05 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0400  Sec-independent protein translocase TatC  30.34 
 
 
249 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1120  twin arginine-targeting protein translocase TatC  32.31 
 
 
251 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000124349  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0165  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  32.76 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0456  Sec-independent protein translocase TatC  30 
 
 
261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2002  Sec-independent protein translocase TatC  30.94 
 
 
278 aa  119  7e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.4915  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4302  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.88 
 
 
259 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.901815  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4206  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.88 
 
 
259 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4362  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.88 
 
 
259 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4255  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.88 
 
 
259 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4183  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.88 
 
 
259 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.335663  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0501  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.91 
 
 
249 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4415  putative Sec-independent protein translocase protein TatC  33.2 
 
 
271 aa  119  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.941523 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1226  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.31 
 
 
242 aa  119  7.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039082 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1617  Sec-independent protein translocase TatC  34.2 
 
 
271 aa  119  7.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.050313  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1166  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.85 
 
 
280 aa  118  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.316189  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2322  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.1 
 
 
277 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0472235  normal  0.432389 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0587  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.14 
 
 
262 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.851675 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3758  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  32.77 
 
 
253 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.428108  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0318  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.22 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1092  twin arginine-targeting protein translocase TatC  30.13 
 
 
241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4405  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.57 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.632551  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00567  Sec-independent protein translocase protein  31.88 
 
 
249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3043  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  31.56 
 
 
252 aa  117  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0132  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.84 
 
 
398 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3910  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.04 
 
 
255 aa  117  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1279  Sec-independent protein translocase TatC  30.21 
 
 
247 aa  116  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00382682  hitchhiker  0.0000030225 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3001  sec-independent protein translocase protein TatC  33.19 
 
 
251 aa  117  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87318  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2427  hypothetical protein  32.2 
 
 
250 aa  116  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1981  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.45 
 
 
287 aa  116  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.437038  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0426  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.06 
 
 
251 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000454537 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1974  Sec-independent protein translocase TatC  31.09 
 
 
368 aa  116  5e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.812349  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0414  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.06 
 
 
251 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0440  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.06 
 
 
251 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.289196 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1102  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.47 
 
 
339 aa  116  5e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.462043  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3900  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.06 
 
 
251 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0516  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.92 
 
 
264 aa  115  6e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852209  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>