47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0417 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0417  FMN-binding  100 
 
 		 179 aa  371  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000846474  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1799  FMN-binding domain protein  58.29 
 
 		 184 aa  194  4.0000000000000005e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000508928  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0905  FMN-binding domain-containing protein  47.65 
 
 		 184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000303402  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3458  FMN-binding domain-containing protein  47.65 
 
 		 184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000627682  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0920  FMN-binding domain-containing protein  45.88 
 
 		 183 aa  168  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0051552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0956  FMN-binding domain-containing protein  45.88 
 
 		 183 aa  168  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275776  normal  0.549187 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0921  FMN-binding domain-containing protein  45.88 
 
 		 183 aa  168  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888668  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0610  putative signal peptide protein  50.29 
 
 		 171 aa  164  6.9999999999999995e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0709  putative signal peptide protein  47.13 
 
 		 181 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.549423  normal  0.030053 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2656  putative signal peptide protein  47.06 
 
 		 183 aa  153  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000219967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1179  FMN-binding  44.77 
 
 		 173 aa  149  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1564  FMN-binding domain-containing protein  42.26 
 
 		 180 aa  144  5e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0361  FMN-binding domain protein  42.95 
 
 		 168 aa  134  9e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.221019 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1847  FMN-binding domain protein  40.76 
 
 		 173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000189195 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5380  FMN-binding domain protein  40.76 
 
 		 173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.17391 
 
 
-
 
NC_003296  RS01729  signal peptide protein  36.41 
 
 		 186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1887  FMN-binding domain protein  35.87 
 
 		 186 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00905192  normal  0.670131 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1558  FMN-binding domain protein  35.87 
 
 		 186 aa  127  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.335211 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3432  FMN-binding domain-containing protein  38.18 
 
 		 149 aa  104  8e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.953268  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2626  hypothetical protein  35.19 
 
 		 152 aa  95.9  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.240318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1833  FMN-binding domain protein  32.65 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653717  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0652  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.52 
 
 		 580 aa  57  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4034  FMN-binding domain-containing protein  28.74 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1083  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  36.49 
 
 		 368 aa  53.9  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0590058 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1316  FMN-binding  37.78 
 
 		 182 aa  53.1  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000101636  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0978  FMN-binding domain protein  39.44 
 
 		 185 aa  51.2  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224949 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1185  hypothetical protein  27.4 
 
 		 166 aa  50.1  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3890  FMN-binding domain-containing protein  36.49 
 
 		 189 aa  48.5  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00153293  normal  0.0179558 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3789  FMN-binding domain-containing protein  29.88 
 
 		 175 aa  47.8  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000077872  decreased coverage  0.000000492054 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2246  hypothetical protein  29.01 
 
 		 187 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.246047 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0588  FMN-binding  37.5 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00870871  decreased coverage  0.000120733 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4601  hypothetical protein  26.04 
 
 		 170 aa  47.4  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0694  FMN-binding domain protein  31.03 
 
 		 391 aa  46.6  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0711  FMN-binding domain-containing protein  29.78 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000470992  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2432  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.34 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744665  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1596  transcriptional regulator, putative  35.44 
 
 		 397 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000252282  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2015  FMN-binding domain-containing protein  35.11 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1638  FMN-binding domain protein  29.35 
 
 		 373 aa  45.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000487572  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0496  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  34.48 
 
 		 177 aa  45.1  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00037002  hitchhiker  0.000327646 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2436  hypothetical protein  35.63 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000527429  normal  0.0196691 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0639  FMN-binding  35.44 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000261865  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1479  membrane bound regulatory protein, VcrC-like protein  30.68 
 
 		 397 aa  43.1  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00732489  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0717  FMN-binding domain protein  27.84 
 
 		 393 aa  42.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1289  membrane-bound regulatory protein  29.03 
 
 		 389 aa  42.7  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0907  FMN-binding domain protein  29.13 
 
 		 176 aa  41.6  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1343  FMN-binding domain-containing protein  28.12 
 
 		 397 aa  41.6  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000579258  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3121  FMN-binding domain-containing protein  33.73 
 
 		 171 aa  41.2  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.132086  unclonable  0.00000402249 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>