71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0373 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0373  hypothetical protein  100 
 
 		 481 aa  984    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1037  hypothetical protein  46.84 
 
 		 477 aa  457  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.960638  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4438  hypothetical protein  45.82 
 
 		 476 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.35414  normal  0.628211 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4173  hypothetical protein  47.64 
 
 		 479 aa  434  1e-120  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0983315  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3361  hypothetical protein  45.67 
 
 		 482 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4364  hypothetical protein  31.08 
 
 		 484 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.945805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0169  hypothetical protein  35.37 
 
 		 211 aa  97.8  4e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.917424  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0275  hypothetical protein  36.42 
 
 		 210 aa  97.8  4e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00635248  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0314  hypothetical protein  34.87 
 
 		 210 aa  97.8  4e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0663161  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0167  hypothetical protein  25.1 
 
 		 632 aa  89  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.427298  n/a   
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6511  hypothetical protein  26.91 
 
 		 497 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0072  hypothetical protein  27.27 
 
 		 838 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.661071  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0687  hypothetical protein  29.66 
 
 		 519 aa  73.6  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0836  hypothetical protein  29.66 
 
 		 613 aa  72.8  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.715517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0849  hypothetical protein  26.87 
 
 		 480 aa  70.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.338117  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0144  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  30.66 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0866  hypothetical protein  27.35 
 
 		 511 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3820  hypothetical protein  30.37 
 
 		 541 aa  70.5  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3018  hypothetical protein  28.81 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00034439  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0855  hypothetical protein  27.68 
 
 		 511 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2483  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  26.24 
 
 		 286 aa  68.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000992077  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1597  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  30.48 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.417903  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5775  hypothetical protein  25.66 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.314122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0142  hypothetical protein  26.23 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.253672 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4725  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  25 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045977 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0266  hypothetical protein  25.96 
 
 		 263 aa  67  0.0000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2487  hypothetical protein  29.31 
 
 		 436 aa  65.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0438109  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1653  hypothetical protein  25.5 
 
 		 500 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.189804  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4003  hypothetical protein  26.57 
 
 		 906 aa  64.3  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0145  hypothetical protein  25.33 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.185076  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0156  hypothetical protein  25 
 
 		 306 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0345  hypothetical protein  27.18 
 
 		 474 aa  61.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2550  hypothetical protein  26.82 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0138  hypothetical protein  24.89 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.650511  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5659  hypothetical protein  26.52 
 
 		 1319 aa  60.1  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3327  hypothetical protein  25.62 
 
 		 435 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000506493  hitchhiker  9.65434e-22 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004333  hypothetical protein  25.51 
 
 		 1199 aa  59.7  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.330356  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0925  hypothetical protein  40.86 
 
 		 461 aa  59.7  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.841538  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17060  hypothetical protein  26.64 
 
 		 294 aa  60.1  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3482  hypothetical protein  28.89 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5662  hypothetical protein  24.43 
 
 		 442 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3377  phage protein  28.93 
 
 		 516 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00845273  hitchhiker  0.00000000000000133815 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2355  hypothetical protein  32.38 
 
 		 534 aa  54.3  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.750444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1324  hypothetical protein  28.21 
 
 		 716 aa  54.3  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.772779 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6572  hypothetical protein  26.95 
 
 		 358 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102603  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0957  hypothetical protein  25 
 
 		 452 aa  53.5  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1992  hypothetical protein  26.54 
 
 		 518 aa  53.1  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0454  phage protein  26.21 
 
 		 538 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267672  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2653  phage protein  26.21 
 
 		 538 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2265  hypothetical protein  25.78 
 
 		 540 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0334  hypothetical protein  27.48 
 
 		 524 aa  50.1  0.00009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0929  hypothetical protein  30.43 
 
 		 409 aa  48.9  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.230723  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2861  hypothetical protein  23.21 
 
 		 504 aa  47.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0476882  normal  0.0347919 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1155  hypothetical protein  24.8 
 
 		 689 aa  48.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0100  hypothetical protein  31.2 
 
 		 541 aa  47.4  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535772  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6364  hypothetical protein  24.77 
 
 		 606 aa  47.4  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.038941  normal  0.601528 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3403  hypothetical protein  30.84 
 
 		 532 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00805318  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2999  hypothetical protein  28.92 
 
 		 1161 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128545  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01367  hypothetical protein  25.34 
 
 		 459 aa  45.8  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.667542  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2564  hypothetical protein  23.58 
 
 		 243 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1168  hypothetical protein  24.12 
 
 		 549 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2020  hypothetical protein  24.56 
 
 		 290 aa  45.8  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0029  hypothetical protein  25 
 
 		 377 aa  44.3  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2750  hypothetical protein  28.16 
 
 		 305 aa  43.9  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.595373  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3005  hypothetical protein  28.43 
 
 		 1160 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386641  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2699  hypothetical protein  28.43 
 
 		 1170 aa  43.9  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2678  hypothetical protein  28.43 
 
 		 1170 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2961  hypothetical protein  27.45 
 
 		 1160 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6920  hypothetical protein  21.9 
 
 		 293 aa  43.9  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2958  hypothetical protein  28.43 
 
 		 1160 aa  43.9  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000406417 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2279  hypothetical protein  27.45 
 
 		 1160 aa  43.5  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522466 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>