144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1606 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1606  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
170 aa  326  8e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8273  NAD(P)H-dependent FMN reductase, sulfate starvation-induced protein  68.29 
 
 
173 aa  206  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.122887 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0471  NADPH-dependent FMN reductase  62.8 
 
 
170 aa  184  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1499  hypothetical protein  53.71 
 
 
180 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411901  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7216  NADPH-dependent FMN reductase  47.85 
 
 
197 aa  127  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0427  NADPH-dependent FMN reductase  44.52 
 
 
184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6432  NADPH-dependent FMN reductase  46.67 
 
 
224 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.066752 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4350  NADPH-dependent FMN reductase  46.3 
 
 
205 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1978  NADPH-dependent FMN reductase  44.03 
 
 
196 aa  111  6e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.789371  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4899  NADPH-dependent FMN reductase  46 
 
 
153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4988  NADPH-dependent FMN reductase  46 
 
 
153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5267  NADPH-dependent FMN reductase  46 
 
 
153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.466048 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2918  NADPH-dependent FMN reductase  48.05 
 
 
189 aa  108  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148799  normal  0.384277 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4209  NADPH-dependent FMN reductase  41.83 
 
 
160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2472  flavoprotein  42.68 
 
 
172 aa  105  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2834  NADPH-dependent FMN reductase  43.86 
 
 
217 aa  104  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.324715  normal  0.692541 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3713  NADPH-dependent FMN reductase  40.12 
 
 
171 aa  101  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3775  NADPH-dependent FMN reductase  46.1 
 
 
182 aa  93.2  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.436385  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1328  hypothetical protein  40.4 
 
 
192 aa  91.7  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.35673  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4303  NADPH-dependent FMN reductase  43.62 
 
 
212 aa  86.3  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0468815  hitchhiker  0.00179271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1214  NADPH-dependent FMN reductase  39.55 
 
 
188 aa  82.4  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.370713  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1830  NADPH-dependent FMN reductase  37.75 
 
 
197 aa  82  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1456  NAD(P)H-dependent FMN reductase  35.26 
 
 
191 aa  81.6  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108076  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2223  NADPH-dependent FMN reductase  38.1 
 
 
189 aa  80.9  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106803  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2421  NADPH-dependent FMN reductase  48.35 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.578118  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1852  NADPH-dependent FMN reductase  38.35 
 
 
190 aa  77.8  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19780  predicted flavoprotein  41.6 
 
 
219 aa  77.4  0.00000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0329903  normal  0.0191485 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1780  NADPH-dependent FMN reductase  40.28 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1569  NADPH-dependent FMN reductase  40.43 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00531651  hitchhiker  0.0000218303 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4324  NAD(P)H-dependent FMN reductase  34.78 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.269642 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6110  NADPH-dependent FMN reductase  35.88 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0256323  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1275  NADPH-dependent FMN reductase  36.81 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1212  NADPH-dependent FMN reductase  36.81 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15525  normal  0.0454424 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5119  NADPH-dependent FMN reductase  38.93 
 
 
185 aa  74.3  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.948082 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2620  NADPH-dependent FMN reductase  34.27 
 
 
177 aa  74.3  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000508292  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1676  NAD(P)H-dependent FMN reductase  36.25 
 
 
184 aa  72.8  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2849  FMN reductase  35.34 
 
 
181 aa  72.4  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4346  NADPH-dependent FMN reductase  39.31 
 
 
407 aa  73.2  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3233  NAD(P)H-dependent FMN reductase  34.27 
 
 
193 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.659372  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2148  putative NADPH-dependent FMN reductase oxidoreductase protein  34.72 
 
 
195 aa  70.5  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.728186 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3451  FMN reductase, NADH-dependent  33.57 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2180  NADPH-dependent FMN reductase  37.01 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.855995 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1337  NADPH-dependent FMN reductase oxidoreductase protein  36.81 
 
 
214 aa  68.9  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19530  NAD(P)H-dependent FMN reductase  34.97 
 
 
197 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2980  NADPH-dependent FMN reductase  42.74 
 
 
172 aa  68.2  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00941  NAD(P)H-dependent FMN reductase  39.45 
 
 
191 aa  67.8  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.659723  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2706  FMN reductase  39.45 
 
 
191 aa  67.8  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.529701  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00948  hypothetical protein  39.45 
 
 
191 aa  67.8  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1681  NAD(P)H-dependent FMN reductase  34.27 
 
 
197 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1046  NAD(P)H-dependent FMN reductase  39.45 
 
 
191 aa  67.8  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1052  NAD(P)H-dependent FMN reductase  39.45 
 
 
191 aa  67.8  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.547438  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2659  NAD(P)H-dependent FMN reductase  39.45 
 
 
191 aa  67.8  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.724178  hitchhiker  0.00966888 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2381  NAD(P)H-dependent FMN reductase  39.45 
 
 
191 aa  67.8  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3727  NADPH-dependent FMN reductase  36.22 
 
 
224 aa  67.8  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2182  NAD(P)H-dependent FMN reductase  39.45 
 
 
191 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.758573 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03758  FMN reductase  38.79 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1143  NADPH-dependent FMN reductase  37.01 
 
 
193 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0935648  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1783  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
218 aa  65.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4976  NAD(P)H-dependent FMN reductase  32.87 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000541054  normal  0.0799227 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1099  NAD(P)H-dependent FMN reductase  40.4 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524065  normal  0.428105 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0236  NAD(P)H-dependent FMN reductase  37.61 
 
 
197 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.219354  hitchhiker  0.00210167 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0251  NAD(P)H-dependent FMN reductase  37.61 
 
 
197 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0228616  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1739  NAD(P)H-dependent FMN reductase  45.78 
 
 
171 aa  65.5  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.118437  normal  0.0421419 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30520  FMN reductase  34.25 
 
 
197 aa  65.5  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.742978  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0260  NAD(P)H-dependent FMN reductase  44.05 
 
 
197 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.373687  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0771  NADPH-dependent FMN reductase  40.2 
 
 
187 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0352  NAD(P)H-dependent FMN reductase  42.86 
 
 
193 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07440  predicted flavoprotein  36.03 
 
 
229 aa  63.5  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5415  NAD(P)H-dependent FMN reductase  31.94 
 
 
197 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246778  hitchhiker  0.00193598 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0568  NADPH-dependent FMN reductase  41.12 
 
 
430 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1645  NAD(P)H-dependent FMN reductase  36.3 
 
 
184 aa  63.2  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.688912  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2285  NADPH-dependent FMN reductase  36 
 
 
197 aa  63.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.595457  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2005  NADPH-dependent FMN reductase  38.89 
 
 
218 aa  62  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.423484  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18720  predicted flavoprotein  35.86 
 
 
211 aa  61.6  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3404  NADPH-dependent FMN reductase  36.96 
 
 
189 aa  61.6  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.378679  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3713  NADPH-dependent FMN reductase  36.96 
 
 
189 aa  61.6  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0095822 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3597  NADPH-dependent FMN reductase  38.28 
 
 
195 aa  61.2  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.686994  normal  0.227288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3585  NADPH-dependent FMN reductase  36.03 
 
 
205 aa  60.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00310961  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5008  NADPH-dependent FMN reductase  35.33 
 
 
202 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14241  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2153  NADPH-dependent FMN reductase  35.92 
 
 
206 aa  60.8  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256474  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1931  hypothetical protein  36.5 
 
 
203 aa  60.5  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1902  FMN reductase  32.43 
 
 
192 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30480  predicted flavoprotein  34.96 
 
 
200 aa  60.1  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.947146  normal  0.32989 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0879  NADPH-dependent FMN reductase  31.54 
 
 
194 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.227459  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1335  NADPH-dependent FMN reductase  39.18 
 
 
190 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5569  FMN reductase  31.21 
 
 
186 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0476585  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2040  FMN reductase  35.16 
 
 
193 aa  59.3  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5075  NADPH-dependent FMN reductase  31.08 
 
 
197 aa  58.9  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0558  FMN reductase  31.54 
 
 
186 aa  58.5  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6104  FMN reductase  44.59 
 
 
189 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.141165  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2450  NADPH-dependent FMN reductase  36.47 
 
 
206 aa  58.5  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.227753  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6093  FMN reductase  33.33 
 
 
186 aa  58.2  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.29051  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4212  NADPH-dependent FMN reductase  32.81 
 
 
185 aa  58.5  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.812339  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3915  FMN reductase  37.78 
 
 
187 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1694  FMN reductase  36.96 
 
 
193 aa  57.8  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2905  NADH-dependent FMN reductase MsuE  34.82 
 
 
186 aa  57.4  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4007  NADPH-dependent FMN reductase  32.47 
 
 
192 aa  57.8  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2598  NADPH-dependent FMN reductase  38.83 
 
 
199 aa  57  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123479  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2548  FMN reductase  30.41 
 
 
193 aa  57  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.33776 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6506  FMN reductase  29.93 
 
 
186 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>