More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2789 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_2789  thiol:disulfide interchange protein  100 
 
 
269 aa  522  1e-147  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2252  putative thiol:disulfide interchange protein  64.15 
 
 
271 aa  322  5e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3826  redoxin domain-containing protein  48.13 
 
 
279 aa  240  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1703  redoxin domain-containing protein  45.32 
 
 
273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1759  hypothetical protein  47.43 
 
 
279 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416831  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4236  redoxin domain protein  46.04 
 
 
278 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1628  redoxin domain-containing protein  46.04 
 
 
278 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0881722  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3560  redoxin domain-containing protein  44.7 
 
 
278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2593  putative thiol:disulfide interchange protein  49.63 
 
 
276 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.357458  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3802  redoxin domain-containing protein  45.15 
 
 
278 aa  211  7e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3937  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  43.07 
 
 
290 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.144233  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3738  redoxin domain-containing protein  50.95 
 
 
268 aa  209  5e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2109  redoxin  39.18 
 
 
271 aa  207  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2395  thioredoxin-like protein  44.57 
 
 
278 aa  205  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  hitchhiker  0.0000244413 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3550  redoxin domain-containing protein  50.37 
 
 
278 aa  205  8e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.054429 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32600  thiol:disulfide interchange protein  52.2 
 
 
278 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.251961  normal  0.0539892 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2761  thiol:disulfide interchange protein  52.2 
 
 
278 aa  192  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376077  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1356  redoxin domain-containing protein  45.74 
 
 
278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.052167  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0511  redoxin domain-containing protein  46.1 
 
 
270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.662182 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2397  Redoxin domain protein  44.94 
 
 
267 aa  179  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.675955  normal  0.672629 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2788  putative thiol:disulfide interchange protein  66.43 
 
 
195 aa  174  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.982955 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00100  putative thiol:disulfide interchange protein  35.45 
 
 
277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2433  redoxin domain-containing protein  43.91 
 
 
277 aa  171  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4240  redoxin domain-containing protein  43.97 
 
 
332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0223129  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1412  Redoxin domain protein  45.78 
 
 
263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2921  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  44.39 
 
 
269 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253355  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5120  redoxin domain-containing protein  45.54 
 
 
269 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3262  redoxin domain-containing protein  45.07 
 
 
269 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0170639  normal  0.755125 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4210  redoxin domain-containing protein  43.46 
 
 
269 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4837  redoxin  42.99 
 
 
269 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4186  redoxin domain-containing protein  42.99 
 
 
269 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.855693  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3329  redoxin domain-containing protein  42.99 
 
 
269 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.531271 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3733  redoxin domain-containing protein  38.26 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.919007  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2015  Redoxin domain protein  45.11 
 
 
169 aa  117  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3246  redoxin domain-containing protein  37.05 
 
 
266 aa  116  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.575298  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1468  Redoxin domain-containing protein  41.22 
 
 
164 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0261888  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2634  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.7 
 
 
272 aa  105  7e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52704  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2883  Redoxin domain-containing protein  31.25 
 
 
270 aa  93.2  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1730  Redoxin domain-containing protein  35.61 
 
 
200 aa  89  8e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.686612  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  40.91 
 
 
182 aa  87.4  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1492  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.33 
 
 
193 aa  87.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.36 
 
 
189 aa  85.5  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8082  Redoxin domain protein  34.93 
 
 
180 aa  84.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  28.57 
 
 
173 aa  84  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  26.79 
 
 
173 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.61 
 
 
189 aa  81.6  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  27.98 
 
 
173 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  27.98 
 
 
173 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  26.79 
 
 
173 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  27.98 
 
 
173 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  27.98 
 
 
173 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6120  redoxin domain-containing protein  36.96 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3424  Redoxin domain protein  37.5 
 
 
183 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0519333  normal  0.0539833 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0061  Redoxin domain protein  33.88 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  27.38 
 
 
173 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2203  redoxin domain-containing protein  40.44 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0533  redoxin domain-containing protein  37.96 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  26.19 
 
 
173 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0509  redoxin domain-containing protein  37.96 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0534  putative thioredoxin  37.5 
 
 
180 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.677226 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2283  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.65 
 
 
199 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000858823  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  27.82 
 
 
173 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  26.79 
 
 
173 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3603  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.48 
 
 
183 aa  76.6  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0124  redoxin  38.41 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.909527  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0607  redoxin domain-containing protein  38.41 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0269  Redoxin domain-containing protein  34.51 
 
 
188 aa  76.3  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.890492 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1239  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  35.2 
 
 
422 aa  76.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.502856  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2627  redoxin domain-containing protein  37.5 
 
 
182 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0576  redoxin domain-containing protein  37.68 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2777  redoxin domain-containing protein  38.24 
 
 
182 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.769829  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4480  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.36 
 
 
194 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1412  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  30.88 
 
 
174 aa  75.1  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.49361  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3631  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.03 
 
 
187 aa  75.1  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.540722  normal  0.6253 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0485  redoxin domain-containing protein  31.34 
 
 
194 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.71 
 
 
166 aa  74.3  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3690  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  36.96 
 
 
183 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1124  redoxin domain-containing protein  32.28 
 
 
181 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.65139  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3880  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.37 
 
 
194 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.88 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4005  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.6 
 
 
194 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2175  hypothetical protein  32.26 
 
 
160 aa  72.8  0.000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.02 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  0.571857 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1872  heat shock protein DnaJ-like  32.71 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.506662  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00935  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like protein  36.45 
 
 
189 aa  72  0.000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.263507  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  37.29 
 
 
184 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2682  thioredoxin  38.05 
 
 
183 aa  71.6  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0398  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  37.9 
 
 
223 aa  71.6  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0641884  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0344  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.14 
 
 
183 aa  71.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00014833  hitchhiker  0.000312976 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3545  redoxin domain-containing protein  29.92 
 
 
194 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0486  redoxin domain-containing protein  30.6 
 
 
194 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0476  thioredoxin, putative  29.85 
 
 
194 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2704  hypothetical protein  34.97 
 
 
205 aa  71.2  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.396222  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2013  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  30.6 
 
 
176 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0399  thiol-disulfide oxidoreductase  29.85 
 
 
174 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1895  redoxin domain-containing protein  31.36 
 
 
189 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.132277 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0200  thioredoxin domain-containing protein  40.5 
 
 
189 aa  71.2  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30 
 
 
169 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0243  redoxin domain-containing protein  35.11 
 
 
184 aa  70.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.487537  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1768  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.72 
 
 
446 aa  70.1  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.197214  normal  0.508736 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>