80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2627 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2627  alpha,alpha-trehalose-phosphate synthase  100 
 
 		 278 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.371782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3831  sucrose-6F-phosphate phosphohydrolase  43.95 
 
 		 259 aa  179  4e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.678629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34680  glucosylglycerol-phosphate synthase  44.07 
 
 		 750 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.966141  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3120  glucosylglycerol-phosphate synthase  41.77 
 
 		 752 aa  145  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.361992  normal  0.0244373 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2312  sucrose-phosphate synthase  28.57 
 
 		 723 aa  88.2  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.407263 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3274  HAD family hydrolase  30.71 
 
 		 698 aa  80.9  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.258602  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1267  sucrose-phosphate synthase  30.86 
 
 		 714 aa  78.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.327347 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3516  sucrose-phosphate synthase  27.73 
 
 		 716 aa  78.2  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1551  sucrose phosphate synthase  30.86 
 
 		 714 aa  78.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4476  sucrose phosphatase  27.38 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2912  sucrose-phosphate synthase  28.4 
 
 		 718 aa  75.1  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0708  sucrose-phosphate synthase  28.1 
 
 		 722 aa  73.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0808  HAD family hydrolase  26.42 
 
 		 709 aa  72.8  0.000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2470  sucrose phosphatase  26.8 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2610  sucrose-phosphate synthase, glycosyltransferase region  26.62 
 
 		 725 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2821  sucrose-phosphate phosphatase  26.94 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.498458 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1794  sucrose-phosphate synthase  24.59 
 
 		 724 aa  72.4  0.000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.399032  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3683  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.42 
 
 		 762 aa  71.6  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4592  sucrose phosphatase  27.95 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.418746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2267  sucrose-phosphate phosphatase  27.57 
 
 		 721 aa  67  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3967  sucrose-phosphate phosphatase subfamily protein  22.18 
 
 		 729 aa  65.5  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.205238  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3515  HAD family hydrolase  29.31 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1623  putative sucrose-6F-phosphate phosphohydrolase  27.39 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0026077  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0650  sucrose-phosphate synthase  25.5 
 
 		 735 aa  60.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238518  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0200  HAD family hydrolase  27.94 
 
 		 684 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.70537 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3069  HAD family hydrolase  23.9 
 
 		 720 aa  60.1  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0143  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.13 
 
 		 684 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.279801  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0284  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.73 
 
 		 688 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.533678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2315  sucrose-phosphate synthase  25.2 
 
 		 709 aa  57  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0410  HAD family hydrolase  26.79 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.661813  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01730  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.82 
 
 		 311 aa  53.9  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1101  HAD family hydrolase  26.85 
 
 		 228 aa  52  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.744434  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0228  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.41 
 
 		 293 aa  52  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.103806  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3241  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  36.05 
 
 		 274 aa  50.8  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28910  predicted protein  25.11 
 
 		 313 aa  50.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0458788  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2739  Cof-like hydrolase  23.41 
 
 		 263 aa  50.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2913  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.81 
 
 		 277 aa  49.7  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3893  Cof-like hydrolase  42 
 
 		 261 aa  49.3  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.805334  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1574  Cof-like hydrolase  31.18 
 
 		 261 aa  48.9  0.00008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.34557  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2618  HAD family hydrolase  42.19 
 
 		 261 aa  48.9  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3974  HAD family hydrolase  38.89 
 
 		 261 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4285  HAD family hydrolase  38.89 
 
 		 261 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1100  HAD family hydrolase  27.8 
 
 		 554 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.261757  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1066  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  42 
 
 		 267 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.840959  normal  0.475939 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4172  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  42 
 
 		 267 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0575456  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1117  HAD family hydrolase  27.8 
 
 		 554 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.293003  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4084  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  40 
 
 		 267 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119194 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3804  HAD-superfamily hydrolase  40 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3819  HAD-superfamily hydrolase  40 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.126763  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2718  HAD family hydrolase  25.75 
 
 		 371 aa  48.1  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1795  HAD family hydrolase  24.89 
 
 		 276 aa  47.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000232683  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4195  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  40 
 
 		 267 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0996454  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4133  HAD family hydrolase  40 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2762  Cof-like hydrolase  40 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3309  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.86 
 
 		 281 aa  47  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  32.94 
 
 		 273 aa  46.2  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2291  HAD family hydrolase  25.36 
 
 		 264 aa  45.8  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0714407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2032  Cof-like hydrolase  27.03 
 
 		 278 aa  45.8  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.201826 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1228  Cof protein  46.15 
 
 		 266 aa  45.4  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5573  hypothetical protein  40.35 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1138  Cof protein  25.11 
 
 		 265 aa  44.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0691805  normal  0.0113542 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0457  Cof-like hydrolase  37.5 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.287116  normal  0.117356 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6319  putative Cof hydrolase  25.51 
 
 		 270 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1422  phosphotransferase  33.01 
 
 		 273 aa  44.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  38.6 
 
 		 268 aa  44.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2934  phosphotransferase  32.04 
 
 		 273 aa  43.9  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1097  HAD superfamily hydrolase  40.74 
 
 		 273 aa  44.3  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000207763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4113  sugar phosphatase  34.48 
 
 		 279 aa  43.5  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0638  hypothetical protein  25 
 
 		 226 aa  43.1  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0216  Cof-like hydrolase  33.33 
 
 		 265 aa  43.1  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0217  Cof-like hydrolase  22.22 
 
 		 269 aa  43.1  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0879  phosphotransferase  34.25 
 
 		 286 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3675  Cof protein  41.25 
 
 		 270 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0848  phosphotransferase  34.25 
 
 		 286 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.457335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0911  phosphotransferase  34.25 
 
 		 286 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.620186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0934  phosphotransferase  34.25 
 
 		 286 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.600795 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0820  phosphotransferase  34.25 
 
 		 286 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00301  hydrolase  23.24 
 
 		 270 aa  42.4  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1887  Cof protein  34.04 
 
 		 270 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0437079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0013  sugar phosphatase  28.42 
 
 		 271 aa  42  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>