103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3831 on replicon NC_009956
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009956  Dshi_3831  sucrose-6F-phosphate phosphohydrolase  100 
 
 
259 aa  518  1e-146  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.678629  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2627  alpha,alpha-trehalose-phosphate synthase  43.95 
 
 
278 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.371782  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34680  glucosylglycerol-phosphate synthase  41.08 
 
 
750 aa  158  9e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.966141  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3120  glucosylglycerol-phosphate synthase  37.34 
 
 
752 aa  124  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.361992  normal  0.0244373 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3515  HAD family hydrolase  30.22 
 
 
277 aa  86.7  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2312  sucrose-phosphate synthase  29.52 
 
 
723 aa  82.8  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.407263 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3516  sucrose-phosphate synthase  25.97 
 
 
716 aa  80.5  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1267  sucrose-phosphate synthase  31.2 
 
 
714 aa  80.5  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.327347 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1551  sucrose phosphate synthase  31.2 
 
 
714 aa  80.5  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3683  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.12 
 
 
762 aa  80.5  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0708  sucrose-phosphate synthase  28.4 
 
 
722 aa  77.8  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2610  sucrose-phosphate synthase, glycosyltransferase region  28.98 
 
 
725 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2718  HAD family hydrolase  27.64 
 
 
371 aa  75.9  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3967  sucrose-phosphate phosphatase subfamily protein  24.9 
 
 
729 aa  73.9  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.205238  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0200  HAD family hydrolase  31.08 
 
 
684 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.70537 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2267  sucrose-phosphate phosphatase  29.92 
 
 
721 aa  71.6  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3274  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
698 aa  70.5  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.258602  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0284  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.85 
 
 
688 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.533678  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3069  HAD family hydrolase  26.62 
 
 
720 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2913  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.72 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2291  HAD family hydrolase  23.17 
 
 
264 aa  67.8  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0714407  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1623  putative sucrose-6F-phosphate phosphohydrolase  24.28 
 
 
247 aa  66.2  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0026077  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0143  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  30.33 
 
 
684 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.279801  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4476  sucrose phosphatase  24.9 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0650  sucrose-phosphate synthase  27.31 
 
 
735 aa  64.7  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238518  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0808  HAD family hydrolase  25.66 
 
 
709 aa  62  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2912  sucrose-phosphate synthase  26.72 
 
 
718 aa  61.2  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1794  sucrose-phosphate synthase  23.08 
 
 
724 aa  59.7  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.399032  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4592  sucrose phosphatase  23.69 
 
 
252 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.418746  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3974  HAD family hydrolase  31.25 
 
 
261 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4285  HAD family hydrolase  31.25 
 
 
261 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1795  HAD family hydrolase  26.81 
 
 
276 aa  57  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000232683  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3804  HAD-superfamily hydrolase  30.21 
 
 
261 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3819  HAD-superfamily hydrolase  30.21 
 
 
261 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.126763  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3893  Cof-like hydrolase  32.61 
 
 
261 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.805334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4195  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  30.21 
 
 
267 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0996454  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4084  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  30.21 
 
 
267 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119194 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4133  HAD family hydrolase  30.21 
 
 
261 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2821  sucrose-phosphate phosphatase  24.02 
 
 
249 aa  53.9  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.498458 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2470  sucrose phosphatase  23.64 
 
 
252 aa  53.5  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0228  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  25.54 
 
 
293 aa  53.1  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.103806  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4172  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  30.43 
 
 
267 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0575456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1066  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  30.43 
 
 
267 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.840959  normal  0.475939 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2762  Cof-like hydrolase  34.48 
 
 
261 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1228  Cof protein  26.78 
 
 
266 aa  50.1  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1100  HAD family hydrolase  35.42 
 
 
554 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.261757  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1117  HAD family hydrolase  35.42 
 
 
554 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.293003  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0113  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.24 
 
 
271 aa  48.5  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0144  phosphatase YbhA  26.92 
 
 
265 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101549  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0410  HAD family hydrolase  31 
 
 
274 aa  47  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.661813  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3785  sugar phosphatase  25.71 
 
 
277 aa  47  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  0.40835 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2846  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  38.75 
 
 
283 aa  46.6  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000799455  normal  0.0158039 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  31.18 
 
 
268 aa  46.6  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0534  HAD superfamily hydrolase  23.75 
 
 
273 aa  46.2  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0909  Cof-like hydrolase  30.56 
 
 
268 aa  46.6  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000198866  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01700  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.83 
 
 
275 aa  46.2  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.616457 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0013  sugar phosphatase  31.4 
 
 
271 aa  46.2  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2739  Cof-like hydrolase  30.95 
 
 
263 aa  46.2  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1845  HAD superfamily hydrolase  31.58 
 
 
269 aa  45.8  0.0007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1423  HAD family hydrolase  30.35 
 
 
550 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1870  class II-B haloacid dehalogenase  32.56 
 
 
265 aa  44.7  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.791968  normal  0.480034 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2242  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  25.33 
 
 
263 aa  45.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0540  HAD superfamily hydrolase  32.56 
 
 
277 aa  45.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.467254  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01730  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  38.96 
 
 
311 aa  45.4  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330616  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0062  HAD superfamily hydrolase  33.33 
 
 
270 aa  44.3  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3074  Cof-like hydrolase  30 
 
 
306 aa  43.9  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7012  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  46.15 
 
 
261 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00675343  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3241  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.26 
 
 
274 aa  43.9  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0323  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  32.22 
 
 
466 aa  43.9  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2159  Cof protein  32.93 
 
 
268 aa  43.9  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3917  Cof-like hydrolase  31.75 
 
 
273 aa  43.5  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  23.75 
 
 
269 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  23.75 
 
 
269 aa  43.9  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9904  predicted protein  42.11 
 
 
276 aa  43.5  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2024  Cof-like hydrolase  26.09 
 
 
281 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4946  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0012  sugar phosphatase  31.4 
 
 
271 aa  43.5  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0726  HAD superfamily hydrolase  31.87 
 
 
274 aa  43.1  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1138  Cof protein  26.07 
 
 
265 aa  43.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0691805  normal  0.0113542 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  28 
 
 
279 aa  43.1  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2525  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.86 
 
 
282 aa  43.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1759  HAD-superfamily cof-like hydrolase  25 
 
 
289 aa  42.7  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0511  HAD superfamily hydrolase  37.7 
 
 
270 aa  42.7  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.930094  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5519  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.75 
 
 
273 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5432  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.75 
 
 
273 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5525  HAD superfamily hydrolase  31.75 
 
 
273 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0388  HAD superfamily hydrolase  24.37 
 
 
270 aa  42.7  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5248  HAD superfamily hydrolase  31.75 
 
 
273 aa  42.7  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.50022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5077  HAD superfamily hydrolase  31.75 
 
 
273 aa  42.7  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000418838  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5094  HAD superfamily hydrolase  31.75 
 
 
273 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0970006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5646  HAD superfamily hydrolase  31.75 
 
 
273 aa  42.7  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  29.07 
 
 
279 aa  42.7  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5189  Cof-like hydrolase  31.75 
 
 
273 aa  42.7  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5491  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.75 
 
 
273 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0216  Cof-like hydrolase  29.27 
 
 
265 aa  42.7  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  29.07 
 
 
279 aa  42.4  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5575  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.75 
 
 
273 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0217  Cof-like hydrolase  26.56 
 
 
269 aa  42.7  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0158  Cof-like hydrolase  31.34 
 
 
265 aa  42.4  0.007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2934  phosphotransferase  32.94 
 
 
273 aa  42  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0380  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  41.82 
 
 
295 aa  42  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.890791 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>