More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2440 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2440  Iojap-related protein  100 
 
 		 117 aa  232  1.0000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3821  iojap-like protein  63.06 
 
 		 115 aa  147  5e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0170  Iojap-related protein  60.87 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0361  Iojap-related protein  67.29 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0593  Iojap-related protein  59.46 
 
 		 119 aa  142  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.328156 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0980  iojap-like protein  60.95 
 
 		 149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0276771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2321  iojap-like protein  60 
 
 		 147 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.891424 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1686  Iojap-related protein  60 
 
 		 147 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2298  iojap-like protein  60 
 
 		 147 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1011  iojap domain-containing protein  59.05 
 
 		 154 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1236  iojap domain-containing protein  58.1 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.757129  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1888  iojap domain-containing protein  58.1 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.791339  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1071  iojap domain-containing protein  58.1 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.18972  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1381  iojap superfamily protein  58.1 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.601287  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1227  iojap domain-containing protein  58.1 
 
 		 154 aa  135  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0354  iojap domain-containing protein  58.1 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.623814  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0796  iojap domain-containing protein  58.1 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2194  hypothetical protein  59.05 
 
 		 203 aa  135  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5625  Iojap-related protein  58.1 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2215  iojap-like protein  58.1 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2336  iojap-like protein  58.1 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2392  iojap-like protein  58.1 
 
 		 205 aa  134  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1992  iojap-like protein  58.1 
 
 		 213 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0989402  normal  0.862271 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1297  iojap-like protein  57.14 
 
 		 154 aa  133  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.605705  normal  0.0750793 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2068  iojap-like protein  57.14 
 
 		 152 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.286889 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3263  Iojap-related protein  53.45 
 
 		 151 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.874451 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0781  Iojap-related protein  56.19 
 
 		 256 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11902  normal  0.247773 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2526  Iojap-related protein  57.14 
 
 		 241 aa  131  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3524  iojap-like protein  55.1 
 
 		 261 aa  129  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.395947  normal  0.0571508 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2079  Iojap-related protein  53.85 
 
 		 261 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1732  iojap-like protein  53.06 
 
 		 289 aa  125  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1901  iojap-like protein  53.06 
 
 		 274 aa  122  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.151802  normal  0.412442 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3200  iojap-like protein  53.06 
 
 		 263 aa  122  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0614  iojap-like protein  48.7 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1972  Iojap-related protein  50 
 
 		 274 aa  122  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.972723 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2687  iojap-like protein  52.04 
 
 		 221 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0645219  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1706  iojap-like protein  53.06 
 
 		 262 aa  122  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0218041  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1949  iojap-like protein  50.48 
 
 		 250 aa  121  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1241  iojap-like protein  48.7 
 
 		 130 aa  120  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2625  iojap-like protein  49.04 
 
 		 233 aa  120  8e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.247151  normal  0.127166 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1104  hypothetical protein  53.1 
 
 		 118 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  51.3 
 
 		 122 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2660  Iojap-related protein  50.88 
 
 		 115 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00250929  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  52.21 
 
 		 118 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1341  hypothetical protein  48.57 
 
 		 189 aa  116  9e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2127  iojap-like protein  52.17 
 
 		 130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.810786  normal  0.0331873 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1543  Iojap-related protein  52.88 
 
 		 123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0158973  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4827  iojap-related protein  48.7 
 
 		 123 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.943671  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0612  iojap-like protein  47.83 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4367  Iojap-related protein  48.7 
 
 		 128 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.909341 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0485  Iojap-related protein  49.56 
 
 		 120 aa  106  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.40385e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2415  iojap-like protein  50.96 
 
 		 116 aa  106  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000527491  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4809  iojap-like protein  53 
 
 		 139 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.243454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4862  iojap-like protein  53 
 
 		 139 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4684  iojap-like protein  53 
 
 		 158 aa  103  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08370  iojap-related protein  48.67 
 
 		 117 aa  103  9e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216142  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4972  hypothetical protein  48.15 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05158  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1581  hypothetical protein  50.96 
 
 		 117 aa  101  3e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000588564  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0666  iojap family protein  47.57 
 
 		 116 aa  99  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  2.49784e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2586  iojap domain-containing protein  47.12 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000697602  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1511  iojap protein family  47.57 
 
 		 116 aa  98.6  3e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000252813  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3343  Poly(A) polymerase, PcnB  42.31 
 
 		 114 aa  97.8  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574363  normal  0.0167921 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0194  hypothetical protein  48 
 
 		 137 aa  97.4  6e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0193009 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0214  Iojap-related protein  47 
 
 		 137 aa  94.7  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3315  iojap-like protein  45.92 
 
 		 114 aa  94  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000132969  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3451  iojap-like protein  45.92 
 
 		 114 aa  94  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316802  hitchhiker  0.00269335 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3273  iojap-like protein  45.92 
 
 		 109 aa  94  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1094  iojap-like protein  45.92 
 
 		 109 aa  94  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000143508  hitchhiker  0.000000000478913 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2933  iojap-like protein  44.12 
 
 		 115 aa  94  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000045875  decreased coverage  0.00669714 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1562  iojap-like protein  48.45 
 
 		 105 aa  93.6  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.985002  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3706  iojap-like protein  45.54 
 
 		 109 aa  93.6  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000743073  decreased coverage  0.000000204323 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3646  iojap-like protein  41.44 
 
 		 150 aa  93.6  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000675973  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2867  iojap-like protein  44.12 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000086194  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3483  iojap-like protein  43.14 
 
 		 109 aa  92.8  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000176434  unclonable  0.0000000000377675 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2934  iojap-like protein  44.86 
 
 		 128 aa  93.2  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.968442 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3882  iojap-like protein  43.3 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.604343  normal  0.0302517 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4206  iojap-like protein  42.42 
 
 		 149 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1137  iojap-like protein  45.36 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000812131  normal  0.662489 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1736  Iojap family protein  42.86 
 
 		 124 aa  92.4  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1717  iojap-related protein  41.9 
 
 		 106 aa  91.7  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0857  Iojap-related protein  43.56 
 
 		 109 aa  91.3  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000112346  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2274  iojap-like protein  52.88 
 
 		 125 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.547969  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3147  iojap-like protein  42.86 
 
 		 109 aa  90.9  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000880611  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1659  iojap-related protein  44.23 
 
 		 118 aa  90.9  5e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000807789  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01659  iojap domain protein  44.33 
 
 		 105 aa  90.9  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000504193  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0522  Iojap-related protein  44.66 
 
 		 120 aa  90.1  8e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0513689  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0993  iojap-like protein  42.16 
 
 		 114 aa  90.1  9e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000971305  normal  0.0937197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1058  iojap-like protein  42.16 
 
 		 114 aa  90.1  9e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000229081  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0156  iojap-like protein  42.45 
 
 		 164 aa  90.1  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0997  iojap-like protein  42.16 
 
 		 114 aa  90.1  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000184153  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1170  iojap domain-containing protein  42.16 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3013  iojap-like protein  43.56 
 
 		 166 aa  89.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357309  normal  0.915296 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0417  hypothetical protein  44.76 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1739  iojap-like protein  47.47 
 
 		 173 aa  90.1  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0163  Iojap-related protein  44.66 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2525  iojap-like protein  43 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.52236  normal  0.917472 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1328  hypothetical protein  44.21 
 
 		 112 aa  88.6  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0865  hypothetical protein  43 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4129  iojap-like protein  45.56 
 
 		 128 aa  88.2  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000489424  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2793  iojap-like protein  43.75 
 
 		 143 aa  88.2  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>