More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1942 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0820  serine/threonine protein kinase  58.92 
 
 		 574 aa  721    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.703748  normal  0.0249792 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1942  Serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 621 aa  1251    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2825  serine/threonine protein kinase  54.72 
 
 		 574 aa  660    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.766433  hitchhiker  0.00137239 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0330  serine/threonine protein kinase  57.57 
 
 		 574 aa  653    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7924  serine/threonine protein kinase  57.72 
 
 		 572 aa  649    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.345293  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3613  serine/threonine protein kinase  56.6 
 
 		 577 aa  652    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374938  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2845  serine/threonine protein kinase  61.85 
 
 		 577 aa  725    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36762  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0704  serine/threonine protein kinase  53.41 
 
 		 569 aa  604  1.0000000000000001e-171  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0336836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0181  protein kinase  54.64 
 
 		 579 aa  601  1e-170  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1244  serine/threonine protein kinase  55.3 
 
 		 571 aa  588  1e-167  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1132  protein kinase  55.48 
 
 		 571 aa  581  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3479  protein serine/threonine phosphatases  49.21 
 
 		 580 aa  571  1e-161  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.644953  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3727  protein kinase  49.46 
 
 		 569 aa  563  1.0000000000000001e-159  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000615107 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3139  serine/threonine protein kinase  53 
 
 		 585 aa  521  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1512  serine/threonine protein kinase  39.56 
 
 		 596 aa  456  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2762  serine/threonine protein kinase  39.86 
 
 		 606 aa  450  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757983  normal  0.303991 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0248  putative membrane associated protein kinase  37.15 
 
 		 590 aa  432  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1814  serine/threonine protein kinase  39.54 
 
 		 596 aa  423  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1878  serine/threonine protein kinase  38.68 
 
 		 599 aa  424  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.686913  hitchhiker  0.00272261 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1021  serine/threonine protein kinase  37.44 
 
 		 589 aa  423  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.867163  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4949  serine/threonine protein kinase  38.24 
 
 		 610 aa  416  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3713  protein kinase  40.31 
 
 		 591 aa  411  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2279  serine/threonine protein kinase  38.79 
 
 		 574 aa  408  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0942803 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03878  Serine/threonine protein kinase  38.54 
 
 		 586 aa  404  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02559  Serine/threonine protein kinase  38.12 
 
 		 605 aa  396  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1963  serine/threonine protein kinase  36.43 
 
 		 576 aa  396  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2627  protein serine/threonine phosphatase  37.09 
 
 		 576 aa  398  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0575166 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2418  serine/threonine protein kinase  35.18 
 
 		 570 aa  386  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2280  serine/threonine protein kinase  33.97 
 
 		 548 aa  297  3e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187654  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3205  protein serine/threonine phosphatase  32.44 
 
 		 571 aa  270  5e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.252613 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0826  protein kinase:protein phosphatase 2C-like  32.45 
 
 		 562 aa  265  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2971  protein serine/threonine phosphatases  33.86 
 
 		 563 aa  258  3e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2091  serine/threonine-protein kinase, putative  32.32 
 
 		 556 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0473599 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3649  protein kinase  32.14 
 
 		 556 aa  251  4e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0234168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2097  protein kinase  31.32 
 
 		 554 aa  249  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0694444 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1602  protein serine/threonine phosphatase  31.83 
 
 		 556 aa  248  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.022391  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1609  protein serine/threonine phosphatase  32.07 
 
 		 555 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122256  decreased coverage  0.000000000229317 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3523  putative serine/threonine-protein kinase  31.77 
 
 		 555 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0593  protein phosphatase/kinase family protein  31.11 
 
 		 595 aa  244  3e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2101  protein kinase  30.71 
 
 		 553 aa  244  5e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1786  hitchhiker  0.00815198 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23380  serine/threonine-kinase and phosphatase  31.1 
 
 		 559 aa  241  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0320  protein serine/threonine phosphatases  31.9 
 
 		 565 aa  239  9e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2303  serine/threonine protein kinase, putative  31.34 
 
 		 529 aa  239  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41520  putative serine/threonine-protein kinase  31.73 
 
 		 533 aa  236  6e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1782  protein serine/threonine phosphatase  30.09 
 
 		 556 aa  232  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3274  protein serine/threonine phosphatases  30.86 
 
 		 594 aa  223  6e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.35703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3527  serine/threonine protein kinase  32.3 
 
 		 566 aa  222  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1410  protein kinase  30.81 
 
 		 582 aa  218  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.840602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2316  putative serine/threonine protein kinase  30.81 
 
 		 573 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.943613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2677  protein serine/threonine phosphatase  31.28 
 
 		 580 aa  210  5e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1321  serine/threonine protein kinase  27.45 
 
 		 700 aa  189  2e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1550  protein kinase  27.45 
 
 		 667 aa  174  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05919 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1146  protein serine/threonine phosphatase  41.09 
 
 		 705 aa  139  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.694371  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  30.04 
 
 		 666 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.23 
 
 		 551 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1304  protein kinase  28.36 
 
 		 664 aa  126  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1279  protein kinase  28.36 
 
 		 664 aa  126  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  28.94 
 
 		 634 aa  126  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  29.82 
 
 		 614 aa  126  1e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0786  serine/threonine protein kinase, putative  27.61 
 
 		 666 aa  123  8e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1511  serine/threonine kinase protein  29.55 
 
 		 641 aa  120  9e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  31.39 
 
 		 776 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.53 
 
 		 916 aa  118  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  31.39 
 
 		 673 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3840  serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 		 466 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  29.93 
 
 		 586 aa  115  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.47 
 
 		 668 aa  115  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.89 
 
 		 863 aa  114  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3757  serine/threonine protein kinase  30.4 
 
 		 466 aa  114  6e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.94 
 
 		 653 aa  114  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.62 
 
 		 715 aa  114  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  29.37 
 
 		 325 aa  113  9e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3699  serine/threonine protein kinase  30.4 
 
 		 469 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.89 
 
 		 591 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0870  serine/threonine protein kinase  29.7 
 
 		 328 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4274  serine/threonine protein kinase  27.97 
 
 		 481 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.700711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4042  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.31 
 
 		 528 aa  111  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4523  serine/threonine protein kinase  30.68 
 
 		 439 aa  112  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  26.18 
 
 		 662 aa  112  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3491  protein kinase  28.67 
 
 		 481 aa  111  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.201999  normal  0.195124 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3350  protein kinase  27.4 
 
 		 465 aa  110  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.3 
 
 		 627 aa  110  8.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  28.52 
 
 		 593 aa  109  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  30.34 
 
 		 666 aa  110  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.83 
 
 		 667 aa  110  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3904  serine/threonine protein kinase  25.46 
 
 		 657 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.331218  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3668  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.13 
 
 		 553 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.965868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3910  serine/threonine protein kinase  25.09 
 
 		 657 aa  109  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106725  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.68 
 
 		 650 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  31 
 
 		 468 aa  109  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0471  serine/threonine protein kinase  27.05 
 
 		 479 aa  109  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.65 
 
 		 598 aa  109  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0480  serine/threonine protein kinase  27.12 
 
 		 479 aa  109  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  normal  0.0196518 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1282  serine/threonine protein kinase  25.09 
 
 		 657 aa  108  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00711344 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3961  serine/threonine protein kinase  25.09 
 
 		 657 aa  108  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.95648  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3707  serine/threonine protein kinase  30.43 
 
 		 480 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0026  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.6 
 
 		 445 aa  108  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.397929  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3603  serine/threonine protein kinase  25.09 
 
 		 657 aa  107  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  28.83 
 
 		 612 aa  108  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5336  serine/threonine protein kinase  27.6 
 
 		 485 aa  108  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.567075 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>