60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1476 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1476  hypothetical protein  100 
 
 		 374 aa  740    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.470406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2271  polysaccharide pyruvyl transferase  46.65 
 
 		 378 aa  280  2e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000535083  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3145  hypothetical protein  48.26 
 
 		 383 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.624247 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3605  polysaccharide pyruvyl transferase  45.21 
 
 		 382 aa  259  7e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.808806  hitchhiker  0.000648077 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3364  polysaccharide pyruvyl transferase  45.75 
 
 		 382 aa  258  9e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.324545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16400  polysaccharide pyruvyl transferase  29.92 
 
 		 373 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000229912  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  25.88 
 
 		 745 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2379  polysaccharide pyruvyl transferase  28.71 
 
 		 400 aa  133  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000108064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2096  polysaccharide pyruvyl transferase  36.25 
 
 		 388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0215  polysaccharide pyruvyl transferase  36.86 
 
 		 366 aa  130  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  26.56 
 
 		 745 aa  126  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1063  CsaB protein  29.85 
 
 		 367 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0788  pyruvyl-transferase  29.25 
 
 		 367 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192045  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3117  polysaccharide pyruvyl transferase  29.57 
 
 		 370 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.030522  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0884  pyruvyl-transferase  29.46 
 
 		 367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0840  CsaB protein  29.46 
 
 		 367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0973  CsaB protein  29.46 
 
 		 367 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0112574 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2062  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  26.17 
 
 		 612 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000046039  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3108  polysaccharide pyruvyl transferase  30.56 
 
 		 377 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00646313  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0713  polysaccharide pyruvyl transferase  27.68 
 
 		 369 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.67475  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0786  pyruvyl-transferase  28.3 
 
 		 375 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0252  polysaccharide pyruvyl transferase  22.51 
 
 		 438 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000318155  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4399  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  26.36 
 
 		 362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0391258  hitchhiker  0.00000000000323458 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0102  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  32.03 
 
 		 367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0123  polysaccharide pyruvyl transferase  30.65 
 
 		 356 aa  106  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000678569  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0783  polysaccharide pyruvyl transferase  26.09 
 
 		 362 aa  106  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727732  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0972  CsaB protein  26.33 
 
 		 369 aa  106  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953296  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2392  polysaccharide pyruvyl transferase  27.39 
 
 		 395 aa  104  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.692445  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0932  pyruvyl-transferase  26.36 
 
 		 362 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.277719  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4122  polysaccharide pyruvyl transferase  31.38 
 
 		 367 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000169583  unclonable  0.000000000262551 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3975  polysaccharide pyruvyl transferase  26.04 
 
 		 1225 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.584875 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0956  polysaccharide pyruvyl transferase  23.57 
 
 		 407 aa  73.6  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2747  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  24.84 
 
 		 348 aa  73.6  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1755  polysaccharide pyruvyl transferase  24.75 
 
 		 347 aa  72  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1706  polysaccharide pyruvyl transferase  25.17 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1731  polysaccharide pyruvyl transferase  25.17 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1129  polysaccharide pyruvyl transferase  23.64 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.904656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3375  polysaccharide pyruvyl transferase  24.18 
 
 		 348 aa  69.7  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2202  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  26.27 
 
 		 332 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4433  polysaccharide pyruvyl transferase  24.55 
 
 		 350 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0618  hypothetical protein  22.99 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  normal  0.0191891 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2362  polysaccharide pyruvyl transferase  29.52 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0735051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3792  response regulator receiver domain-containing protein  24.04 
 
 		 359 aa  61.6  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1529  hypothetical protein  24.35 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0032024 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0419  hypothetical protein  26.47 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2576  polysaccharide pyruvyl transferase  28.52 
 
 		 406 aa  59.7  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1425  hypothetical protein  25.24 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3929  hypothetical protein  22.83 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_002936  DET0213  hypothetical protein  28 
 
 		 431 aa  58.2  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0140  hypothetical protein  24.88 
 
 		 430 aa  57  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.794718  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3253  putative polysaccharide pyruvyl transferase  20.5 
 
 		 381 aa  57  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151053  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0373  hypothetical protein  25.22 
 
 		 413 aa  57  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0482859  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0431  hypothetical protein  24.71 
 
 		 413 aa  55.5  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.645976  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1074  hypothetical protein  23.78 
 
 		 351 aa  53.5  0.000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3383  polysaccharide pyruvyl transferase  21.26 
 
 		 408 aa  53.1  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1056  hypothetical protein  22.61 
 
 		 408 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1408  polysaccharide pyruvyl transferase  22.69 
 
 		 341 aa  48.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000381534  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0960  polysaccharide pyruvyl transferase  21.53 
 
 		 418 aa  47  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.63346  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15321  hypothetical protein  23.32 
 
 		 367 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.29569 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3882  hypothetical protein  20.73 
 
 		 382 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>