54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1748 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1748  major facilitator transporter  100 
 
 		 444 aa  883    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0189374  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1691  major facilitator transporter  98.2 
 
 		 445 aa  869    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000499428  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1712  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 		 445 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.200643  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0201  major facilitator superfamily MFS_1  29.93 
 
 		 402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.196345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5054  major facilitator superfamily MFS_1  25.72 
 
 		 462 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102448  normal  0.0163601 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2087  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 446 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000442741  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5596  major facilitator superfamily MFS_1  24.18 
 
 		 531 aa  107  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0855834  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0029  major facilitator superfamily MFS_1  29.54 
 
 		 427 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2034  major facilitator transporter  24.4 
 
 		 504 aa  106  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1339  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 471 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1763  major facilitator superfamily MFS_1  24.85 
 
 		 453 aa  98.6  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455527  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3236  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 513 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.113654 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2443  major facilitator superfamily MFS_1  22.62 
 
 		 457 aa  94  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000052902  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0794  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 461 aa  94  4e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0909  hypothetical protein  26.27 
 
 		 440 aa  93.2  8e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_781  hypothetical protein  24.73 
 
 		 461 aa  91.7  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1005  major facilitator superfamily MFS_1  24.84 
 
 		 446 aa  89.7  9e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0184  major facilitator transporter  25.23 
 
 		 470 aa  84.3  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.012641 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2212  hypothetical protein  26.6 
 
 		 490 aa  83.2  0.000000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.814869  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2800  hypothetical protein  26.81 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0968  major facilitator superfamily protein  24.24 
 
 		 468 aa  80.1  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.623645  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0365  major facilitator superfamily permease  22.87 
 
 		 474 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0373  major facilitator transporter  23.99 
 
 		 459 aa  78.6  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.259758  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0355  major facilitator transporter  23.65 
 
 		 459 aa  78.6  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000720237  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0334  twin-arginine translocation pathway signal  25.96 
 
 		 474 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3609  twin-arginine translocation pathway signal  25.96 
 
 		 474 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3806  major facilitator transporter  25.96 
 
 		 495 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3845  twin-arginine translocation pathway signal  27.05 
 
 		 476 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1458  major facilitator transporter  23.46 
 
 		 480 aa  74.7  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0397  hypothetical protein  21.55 
 
 		 422 aa  72.8  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0195929  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0364  major facilitator transporter  24.27 
 
 		 472 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0357  major facilitator transporter  24.27 
 
 		 472 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0367  major facilitator superfamily MFS_1  24.27 
 
 		 472 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000109722 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0359  major facilitator transporter  23.79 
 
 		 471 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0874  major facilitator transporter  23.1 
 
 		 450 aa  71.2  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0271  hypothetical protein  24.92 
 
 		 491 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0233  major facilitator superfamily MFS_1  24.89 
 
 		 457 aa  68.6  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3428  major facilitator transporter  21.12 
 
 		 482 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1907  major facilitator transporter  22.73 
 
 		 469 aa  67.4  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000193036  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0793  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 482 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320766 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0682  major facilitator transporter  23.25 
 
 		 454 aa  66.2  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2661  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 437 aa  63.5  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5604  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 		 457 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.638903  normal  0.244185 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3936  major facilitator transporter  24.42 
 
 		 438 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3659  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 406 aa  51.2  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0398  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 408 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2583  major facilitator transporter  22.76 
 
 		 409 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 410 aa  47  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2056  major facilitator transporter  21.62 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000877049  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4967  major facilitator transporter  22.83 
 
 		 440 aa  45.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.880384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0167  major facilitator transporter  22.19 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000230184  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1067  major facilitator superfamily MFS_1  24.66 
 
 		 423 aa  44.3  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0207259  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1026  major facilitator transporter  21.89 
 
 		 407 aa  43.9  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3349  major facilitator transporter  23.1 
 
 		 441 aa  43.5  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>