88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1392 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1392  methyltransferase type 11  100 
 
 		 204 aa  423  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2499  methyltransferase type 12  46.56 
 
 		 203 aa  154  6e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1601  hypothetical protein  31.58 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0256  methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1368  methyltransferase type 12  30.82 
 
 		 210 aa  84.7  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0284  methyltransferase type 11  30.92 
 
 		 209 aa  84.7  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07904  conserved hypothetical protein  31.71 
 
 		 325 aa  79.3  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.414403  normal  0.323526 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03996  conserved hypothetical protein  38.79 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0273649  normal  0.194457 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2277  methyltransferase type 11  26.26 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  38.46 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2106  methyltransferase type 12  31.82 
 
 		 436 aa  53.9  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0157  methyltransferase type 12  34.42 
 
 		 338 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0701135  normal  0.868895 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  30.47 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  29.92 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0030  methyltransferase type 12  30.43 
 
 		 324 aa  49.3  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  30.5 
 
 		 284 aa  49.3  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  31.65 
 
 		 225 aa  48.9  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38925  predicted protein  34.55 
 
 		 281 aa  48.5  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.14201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3396  methyltransferase type 12  36.14 
 
 		 439 aa  48.5  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1075  methyltransferase type 12  31.87 
 
 		 303 aa  48.1  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4321  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.82 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701577  normal  0.237369 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0591  methyltransferase  29.8 
 
 		 326 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.27 
 
 		 255 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2186  hypothetical protein  31.18 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286296  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  29.79 
 
 		 284 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  25.52 
 
 		 577 aa  46.6  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  29.03 
 
 		 226 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  30.43 
 
 		 236 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.31 
 
 		 250 aa  45.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2263  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 232 aa  45.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  30.43 
 
 		 236 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  37 
 
 		 456 aa  45.4  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32655  predicted protein  33.33 
 
 		 269 aa  45.8  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.351809  normal  0.0198714 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  30.43 
 
 		 236 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  30.43 
 
 		 236 aa  45.4  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  30.43 
 
 		 236 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  26.99 
 
 		 199 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  29.37 
 
 		 262 aa  45.1  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2330  hypothetical protein  24.31 
 
 		 249 aa  45.4  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.291215  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2477  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 213 aa  45.1  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0166  DNA topoisomerase VI subunit A-like protein  25.14 
 
 		 257 aa  45.1  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  32.1 
 
 		 257 aa  44.7  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  31.06 
 
 		 200 aa  45.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  32.05 
 
 		 577 aa  45.1  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1658  hypothetical protein  29.76 
 
 		 244 aa  45.1  0.0008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00141764  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  31.06 
 
 		 200 aa  45.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2106  hypothetical protein  30.43 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  29.67 
 
 		 226 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  30.22 
 
 		 260 aa  44.3  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  28.32 
 
 		 275 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1512  methyltransferase type 11  31.51 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.358179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2562  methyltransferase type 11  30.61 
 
 		 227 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000154268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1951  methyltransferase type 11  27.37 
 
 		 226 aa  44.3  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.319095  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  27.96 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  29.38 
 
 		 265 aa  43.1  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0197  Methyltransferase type 12  29.14 
 
 		 310 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  27.74 
 
 		 249 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1989  methyltransferase type 11  29.29 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512707  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2902  Methyltransferase type 12  28.47 
 
 		 248 aa  43.5  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000205015  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1411  Methyltransferase type 11  31.91 
 
 		 246 aa  43.5  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110905 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  34.09 
 
 		 436 aa  43.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05789  methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06380)  35.71 
 
 		 279 aa  43.9  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.761453 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 252 aa  43.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2762  methyltransferase  26.32 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.296293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0690  hypothetical protein  42.31 
 
 		 58 aa  43.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  34.74 
 
 		 256 aa  43.1  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  26.28 
 
 		 225 aa  42.7  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1279  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.34 
 
 		 253 aa  42.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0198  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.42 
 
 		 252 aa  42.7  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.537911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  30.33 
 
 		 249 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  32.14 
 
 		 263 aa  42.4  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  26.92 
 
 		 249 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  22.03 
 
 		 269 aa  42.4  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  26.92 
 
 		 249 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  27.86 
 
 		 232 aa  42.4  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0656  Methyltransferase type 11  38.75 
 
 		 199 aa  42  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098603 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00656  Uncharacterized methyltransferase AN0656 (EC 2.1.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BFM4]  32.99 
 
 		 286 aa  42  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.529096 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1028  hypothetical protein  28.48 
 
 		 255 aa  42  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  28.39 
 
 		 202 aa  42  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  26.28 
 
 		 249 aa  41.6  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  26.28 
 
 		 249 aa  41.6  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1539  Methyltransferase type 12  30.77 
 
 		 312 aa  42  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1063  hypothetical protein  28.95 
 
 		 276 aa  41.6  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.051758  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5232  methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 352 aa  42  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  26.28 
 
 		 249 aa  41.6  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0226  Methyltransferase type 12  26.18 
 
 		 311 aa  41.2  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1037  methyltransferase type 12  32.99 
 
 		 256 aa  41.2  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  31.4 
 
 		 249 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>