More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1263 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1263  histidine kinase  100 
 
 		 346 aa  694    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1559  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  55.13 
 
 		 346 aa  355  5e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.306197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2915  two-component sensor histidine kinase  55.29 
 
 		 346 aa  353  2e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1106  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  54.44 
 
 		 346 aa  353  2e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.306668  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3938  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  55.59 
 
 		 350 aa  337  9.999999999999999e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1532  histidine kinase  54.89 
 
 		 353 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.628543  normal  0.374808 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2288  histidine kinase  51.71 
 
 		 346 aa  312  3.9999999999999997e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.677673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3588  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.24 
 
 		 423 aa  268  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.149511  hitchhiker  0.00271132 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1042  histidine kinase  46.24 
 
 		 438 aa  267  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0389643  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.86 
 
 		 445 aa  264  1e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0634  histidine kinase  47.11 
 
 		 450 aa  262  8e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0887  ATP-binding region, ATPase-like  45.24 
 
 		 451 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3543  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  44.77 
 
 		 478 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1659  histidine kinase  45.66 
 
 		 433 aa  259  6e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.455173  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5267  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.06 
 
 		 448 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0196  histidine kinase  46.96 
 
 		 510 aa  257  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.447748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0505  Signal transduction histidine kinase  45.75 
 
 		 417 aa  256  5e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4924  histidine kinase  45.8 
 
 		 443 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.543055 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0775  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.22 
 
 		 449 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.82168  normal  0.228948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0757  two component sensor histidine kinase  46.15 
 
 		 435 aa  251  9.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.162212 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3196  histidine kinase  41.83 
 
 		 356 aa  251  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0721667  normal  0.0151706 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2811  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.01 
 
 		 422 aa  245  9e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0177  histidine kinase  41.98 
 
 		 407 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.450001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0167  histidine kinase  41.28 
 
 		 407 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.114642  normal  0.326562 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0840  histidine kinase  41.97 
 
 		 363 aa  238  1e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133727 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0381  histidine kinase  42.6 
 
 		 430 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0312  putative sensor histidine kinase  42.39 
 
 		 438 aa  233  4.0000000000000004e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0298  sensor histidine kinase, putative  42.39 
 
 		 438 aa  233  5e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2916  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.27 
 
 		 430 aa  231  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.301233 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2689  histidine kinase  43.55 
 
 		 430 aa  230  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1535  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.8 
 
 		 459 aa  226  4e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.896315  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0496  phosphate regulon sensor kinase PhoR  39.71 
 
 		 419 aa  223  4e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.27503  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0012  histidine kinase  48.41 
 
 		 424 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.61719  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0478  histidine kinase  40.22 
 
 		 438 aa  219  5e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0118  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.94 
 
 		 415 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.26579 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4551  histidine kinase  39.4 
 
 		 480 aa  216  7e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3575  histidine kinase  39.37 
 
 		 416 aa  205  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455968  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1123  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.31 
 
 		 482 aa  203  4e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.702413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2689  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.79 
 
 		 402 aa  202  5e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10288  normal  0.570693 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 456 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2200  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 		 448 aa  196  6e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.148395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 		 489 aa  194  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.68 
 
 		 585 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2989  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.68 
 
 		 585 aa  192  7e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2317  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.2 
 
 		 431 aa  192  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.837858  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.13 
 
 		 444 aa  189  7e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 		 581 aa  188  9e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 		 592 aa  186  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.11 
 
 		 458 aa  186  5e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.54 
 
 		 589 aa  186  6e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2632  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.29 
 
 		 454 aa  185  8e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.434659  normal  0.0783763 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 		 476 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.763592  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2258  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 		 451 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.42492 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2400  Signal transduction histidine kinase, PhoR  34.82 
 
 		 437 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.595791  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1287  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.06 
 
 		 468 aa  183  5.0000000000000004e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.3 
 
 		 585 aa  182  6e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  35.16 
 
 		 587 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0217  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 		 449 aa  182  9.000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.217538 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0746  histidine kinase  31.43 
 
 		 337 aa  181  1e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000736417  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 		 600 aa  182  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.32 
 
 		 584 aa  181  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2232  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 		 433 aa  181  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0952  sensory box histidine kinase  41.98 
 
 		 346 aa  181  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000116101  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  43.51 
 
 		 352 aa  182  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  36.13 
 
 		 587 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1492  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.02 
 
 		 465 aa  181  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  36.69 
 
 		 591 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.8 
 
 		 464 aa  180  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409193 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.02 
 
 		 465 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  35.81 
 
 		 587 aa  180  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 412 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3839  two-component sensor PhoR  42.57 
 
 		 434 aa  179  5.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000175105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2551  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.62 
 
 		 401 aa  179  5.999999999999999e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.203481  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1931  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.78 
 
 		 591 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3568  sensor histidine kinase  36.57 
 
 		 430 aa  179  7e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2275  histidine kinase  38.44 
 
 		 394 aa  179  7e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0585084  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.03 
 
 		 584 aa  179  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 		 589 aa  179  7e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000411549  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  36.36 
 
 		 584 aa  179  8e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5610  histidine kinase  42.31 
 
 		 344 aa  179  9e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.741974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2471  Histidine kinase  37.24 
 
 		 446 aa  179  9e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  40.56 
 
 		 587 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  40.56 
 
 		 587 aa  178  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  40.56 
 
 		 587 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1175  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.81 
 
 		 412 aa  178  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0245607  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  40.56 
 
 		 587 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 607 aa  178  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.96 
 
 		 587 aa  178  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  39.94 
 
 		 537 aa  177  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  39.23 
 
 		 587 aa  177  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  39.23 
 
 		 587 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.31 
 
 		 442 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.531342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2107  histidine kinase  31.53 
 
 		 598 aa  176  5e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1272  phosphate sensor signal transduction histidine kinase, PhoR  43.15 
 
 		 437 aa  176  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.54553  normal  0.265376 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1486  histidine kinase  40.32 
 
 		 575 aa  176  7e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1435  phosphate regulon sensor protein PhoR  39.24 
 
 		 442 aa  175  9e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.24 
 
 		 442 aa  175  9e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4124  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.36 
 
 		 376 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.21839  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0488  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.65 
 
 		 442 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1183  histidine kinase  43.9 
 
 		 439 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.965515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>