132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0699 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0699  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  254  3e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0928683  normal  0.0143499 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1014  hypothetical protein  64.04 
 
 		 115 aa  152  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.250849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1261  hypothetical protein  59.63 
 
 		 124 aa  131  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39512  predicted protein  36.36 
 
 		 274 aa  73.9  0.0000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0377472 
 
 
-
 
NC_006686  CND01590  regulation of amino acid metabolism-related protein, putative  35.29 
 
 		 450 aa  59.3  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0433818  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0258  proline dipeptidase  36.56 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.217199  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12020  conserved hypothetical protein TIGR00257  38.39 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2223  protein of unknown function UPF0029  36.17 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.238524  normal  0.0468847 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0770  hypothetical protein  39.33 
 
 		 197 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.634391  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0674  hypothetical protein  39.33 
 
 		 197 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  39 
 
 		 207 aa  57.4  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2225  protein of unknown function UPF0029  37.93 
 
 		 195 aa  57  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  35.71 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0586  hypothetical protein  35.48 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.101078  decreased coverage  0.000251226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2179  protein of unknown function UPF0029  37.5 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.509167  normal  0.553697 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  33.04 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl056  putative proline dipeptidase  33.33 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  35.05 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0682  hypothetical protein  37.08 
 
 		 193 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000348018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02100  hypothetical protein  35.96 
 
 		 196 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.482389 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0593  hypothetical protein  37.08 
 
 		 194 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.195431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1820  hypothetical protein  34.65 
 
 		 198 aa  53.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0596118  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1725  protein of unknown function UPF0029  34.21 
 
 		 204 aa  53.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0633  hypothetical protein  37.08 
 
 		 194 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000102941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0638  hypothetical protein  37.08 
 
 		 194 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134379 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48866  predicted protein  30.83 
 
 		 327 aa  53.1  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1989  protein of unknown function UPF0029  36.96 
 
 		 212 aa  52.4  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0314  hypothetical protein  35.24 
 
 		 205 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.55405 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12728  hypothetical protein  32.99 
 
 		 203 aa  52.4  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4570  hypothetical protein  37.08 
 
 		 194 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000582787  normal  0.0106541 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1849  protein of unknown function UPF0029  37.78 
 
 		 206 aa  52.4  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1598  hypothetical protein  34.29 
 
 		 205 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00000000468439  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1375  hypothetical protein  34.65 
 
 		 197 aa  51.2  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000270637  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  32.17 
 
 		 198 aa  51.2  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0454  protein of unknown function UPF0029  32.95 
 
 		 119 aa  50.8  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  32.8 
 
 		 211 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000186376  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08173  Impact family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G03000)  33.33 
 
 		 341 aa  50.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.627119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  34.86 
 
 		 213 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0813  protein of unknown function UPF0029  29.66 
 
 		 206 aa  50.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  33.68 
 
 		 210 aa  50.1  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  34.82 
 
 		 210 aa  50.1  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  32.04 
 
 		 213 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  33.7 
 
 		 214 aa  49.3  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  33.94 
 
 		 195 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  33.94 
 
 		 195 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1009  hypothetical protein  36.36 
 
 		 191 aa  48.9  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0286427  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0383  hypothetical protein  35.92 
 
 		 208 aa  49.3  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.46169  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  33.94 
 
 		 195 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  33.96 
 
 		 245 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1632  protein of unknown function UPF0029  31.63 
 
 		 201 aa  48.5  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4412  hypothetical protein  33.94 
 
 		 195 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0046  hypothetical protein  29.59 
 
 		 191 aa  48.1  0.00004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0248  hypothetical protein  33.71 
 
 		 196 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895952  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1413  hypothetical protein  32 
 
 		 205 aa  47.8  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.533633  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1121  hypothetical protein  46.67 
 
 		 192 aa  47.8  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.490437  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1450  hypothetical protein  34.41 
 
 		 198 aa  47.4  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1558  protein of unknown function UPF0029  32.63 
 
 		 203 aa  47.8  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  33.33 
 
 		 239 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0874  hypothetical protein  34.94 
 
 		 229 aa  47.4  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  33.94 
 
 		 195 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0820  hypothetical protein  34.94 
 
 		 229 aa  47.4  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.647748  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0180  protein of unknown function UPF0029  39.71 
 
 		 216 aa  47.4  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.190284  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0124  hypothetical protein  34.04 
 
 		 206 aa  47  0.00008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000265032 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  47.4  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  38.89 
 
 		 209 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  34.38 
 
 		 221 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60871  predicted protein  41.18 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0876  protein of unknown function UPF0029  31.52 
 
 		 203 aa  46.2  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.196068 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1716  hypothetical protein  36.47 
 
 		 206 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1211  protein of unknown function UPF0029  30 
 
 		 212 aa  46.6  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  34.55 
 
 		 290 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  33.03 
 
 		 204 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3596  hypothetical protein  33.03 
 
 		 195 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0533  hypothetical protein  32.38 
 
 		 205 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00814053  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  33.03 
 
 		 195 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01194  thymidylate synthase  42.86 
 
 		 212 aa  45.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.43796  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  31.53 
 
 		 198 aa  45.4  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  31.52 
 
 		 208 aa  45.4  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  31.86 
 
 		 209 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1444  hypothetical protein  31.31 
 
 		 216 aa  45.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1608  protein of unknown function UPF0029  40 
 
 		 201 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3126  hypothetical protein  30.6 
 
 		 209 aa  44.7  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1379  hypothetical protein  30.28 
 
 		 199 aa  44.3  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.262935  normal  0.051322 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3700  hypothetical protein  42.86 
 
 		 194 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2078  hypothetical protein  31.25 
 
 		 219 aa  43.9  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  32.22 
 
 		 212 aa  43.9  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  30.56 
 
 		 212 aa  43.9  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2969  hypothetical protein  33.71 
 
 		 200 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  32.08 
 
 		 195 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1554  protein of unknown function UPF0029  30.53 
 
 		 211 aa  43.5  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2511  hypothetical protein  27.96 
 
 		 203 aa  42.7  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0944  hypothetical protein  32.74 
 
 		 242 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2434  hypothetical protein  32.73 
 
 		 206 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0111  protein of unknown function UPF0029  28.97 
 
 		 216 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  32.26 
 
 		 211 aa  42.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0289  hypothetical protein  32.58 
 
 		 303 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0488253  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1805  hypothetical protein  32.61 
 
 		 303 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1720  hypothetical protein  32.61 
 
 		 196 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0445948  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1307  hypothetical protein  32.58 
 
 		 303 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.441803  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  31.73 
 
 		 194 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>