45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0072 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0072  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  100 
 
 		 334 aa  643    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.859252  normal  0.733338 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0157  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  33.33 
 
 		 353 aa  149  6e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  43.08 
 
 		 954 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2497  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  46.81 
 
 		 190 aa  52.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2004  LysM domain/BON superfamily protein  44 
 
 		 161 aa  49.3  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1944  LysM domain/BON superfamily protein  40.82 
 
 		 161 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123188  normal  0.0308749 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 368 aa  48.5  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2267  LysM domain/BON superfamily protein  40.82 
 
 		 161 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0461572  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2148  LysM domain/BON superfamily protein  40.82 
 
 		 160 aa  49.3  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00099645  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2795  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  38.78 
 
 		 233 aa  47.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.683971  normal  0.0904413 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0937  hypothetical protein  52.08 
 
 		 96 aa  47  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00383294  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02210  hypothetical protein  38.89 
 
 		 166 aa  47  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0789  peptidoglycan-binding LysM  35.82 
 
 		 285 aa  47  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  30.28 
 
 		 219 aa  46.6  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0533  peptidoglycan-binding LysM  36.54 
 
 		 162 aa  46.6  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.235675  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0549  Peptidoglycan-binding LysM  36.54 
 
 		 162 aa  46.6  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5417  peptidoglycan-binding LysM  46 
 
 		 591 aa  46.2  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3821  hypothetical protein  50 
 
 		 96 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2954  peptidoglycan-binding LysM  39.13 
 
 		 312 aa  45.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1297  transport-associated protein  36.73 
 
 		 156 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.451371  normal  0.073309 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  47.06 
 
 		 470 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2944  Peptidoglycan-binding LysM  40.68 
 
 		 236 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.34706  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3803  lysM domain protein  37.74 
 
 		 159 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  hitchhiker  1.81276e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1542  lysM domain protein  37.74 
 
 		 159 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.001251  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0453  LysM domain/BON superfamily protein  40.35 
 
 		 158 aa  45.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5181  LysM domain/BON superfamily protein  38.78 
 
 		 156 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.556952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0694  lytic transglycosylase catalytic  36.76 
 
 		 595 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000324493  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1429  putative lipoprotein  41.54 
 
 		 279 aa  44.3  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000184738  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0431  peptidoglycan-binding LysM  35.85 
 
 		 543 aa  44.3  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000410197  normal  0.723763 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1368  peptidoglycan-binding protein  34.92 
 
 		 159 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189168  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4948  Peptidoglycan-binding LysM  36.73 
 
 		 153 aa  44.3  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4170  peptidoglycan-binding LysM  38.78 
 
 		 163 aa  43.5  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301843  normal  0.177746 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2095  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  32.34 
 
 		 335 aa  43.5  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.344287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4163  hypothetical protein  30.77 
 
 		 556 aa  43.5  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.868125  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1955  Peptidoglycan-binding LysM  40.24 
 
 		 239 aa  43.1  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1393  LysM domain/BON superfamily protein  36.54 
 
 		 156 aa  43.1  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1881  LysM domain/BON superfamily protein  36.73 
 
 		 156 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168616  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6198  LysM domain/BON superfamily protein  36.73 
 
 		 156 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0206564  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1315  peptidoglycan-binding LysM  38.24 
 
 		 377 aa  43.5  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798915  normal  0.930034 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1338  protein serine/threonine phosphatase  30.61 
 
 		 474 aa  43.1  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000169814  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1904  LysM domain/BON superfamily protein  36.73 
 
 		 156 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169778 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1648  lysM domain protein  35.85 
 
 		 159 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000383151  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0262  Peptidoglycan-binding LysM  38.3 
 
 		 318 aa  42.7  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2667  LysM domain/BON superfamily protein  35.19 
 
 		 158 aa  42.7  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000146101  normal  0.333538 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1612  lysM domain-containing protein  35.85 
 
 		 159 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000378837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>