More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2269 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2269  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  681    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.681202  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0544  hypothetical protein  52.77 
 
 
310 aa  301  1e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2714  hypothetical protein  43.38 
 
 
663 aa  204  2e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000124871  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0571  hypothetical protein  45.19 
 
 
760 aa  198  1.0000000000000001e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.137635  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2495  hypothetical protein  41.26 
 
 
772 aa  191  1e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0157541  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2101  hypothetical protein  38.74 
 
 
356 aa  160  3e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00076564  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2118  hypothetical protein  36.4 
 
 
301 aa  151  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.134861  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2493  hypothetical protein  39.08 
 
 
539 aa  149  5e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  39.22 
 
 
276 aa  149  8e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0833  putative lipoprotein  38.91 
 
 
341 aa  143  4e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000110547  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0977  hypothetical protein  33.42 
 
 
381 aa  142  9.999999999999999e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000230443  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1865  protein of unknown function DUF323  38.22 
 
 
289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000544959  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  37.14 
 
 
263 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0945  hypothetical protein  35.38 
 
 
370 aa  138  1e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136664  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7515  hypothetical protein  35.53 
 
 
245 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.888834 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2239  hypothetical protein  37.63 
 
 
330 aa  136  5e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0453686  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2601  hypothetical protein  34.46 
 
 
225 aa  136  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.683008  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2805  putative cytoplasmic protein  35.37 
 
 
226 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2311  hypothetical protein  34.82 
 
 
224 aa  132  6e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.254882  normal  0.0358095 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2485  putative cytoplasmic protein  33.33 
 
 
226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.848357  normal  0.715845 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2826  hypothetical protein  36.59 
 
 
225 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2747  hypothetical protein  34.69 
 
 
336 aa  130  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000451907 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2106  hypothetical protein  32.86 
 
 
276 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.175349  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2515  hypothetical protein  36.58 
 
 
361 aa  129  6e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000085485  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5254  hypothetical protein  34.07 
 
 
233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.410558  normal  0.101212 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1056  hypothetical protein  47.62 
 
 
201 aa  127  4.0000000000000003e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000574228  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2847  hypothetical cytosolic protein  32.52 
 
 
226 aa  126  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0545564  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2802  hypothetical protein  35.77 
 
 
214 aa  125  9e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3542  hypothetical protein  36.71 
 
 
230 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332756  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3831  protein of unknown function DUF323  33.98 
 
 
223 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3574  protein of unknown function DUF323  34.3 
 
 
768 aa  123  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  38.49 
 
 
475 aa  123  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2903  protein of unknown function DUF323  34.25 
 
 
327 aa  123  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  32.56 
 
 
489 aa  119  6e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  35.8 
 
 
587 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0572  hypothetical protein  32.27 
 
 
386 aa  115  7.999999999999999e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.189978  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1169  protein of unknown function DUF323  31.67 
 
 
279 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1267  protein of unknown function DUF323  36.55 
 
 
270 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  33.6 
 
 
446 aa  108  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  42.86 
 
 
715 aa  107  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  45.99 
 
 
293 aa  107  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  32.27 
 
 
802 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  29.29 
 
 
358 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1133  hypothetical protein  33.46 
 
 
282 aa  106  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.571519  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  31.95 
 
 
922 aa  106  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1004  protein of unknown function DUF323  33.06 
 
 
298 aa  106  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.302602  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1572  hypothetical protein  32.22 
 
 
267 aa  105  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  32.57 
 
 
929 aa  105  9e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2986  hypothetical protein  30.65 
 
 
294 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.0027982  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  32.94 
 
 
636 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  34.26 
 
 
603 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003599  hypothetical protein  33.33 
 
 
262 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.218262  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  31.28 
 
 
617 aa  103  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  31.5 
 
 
625 aa  103  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  30.86 
 
 
287 aa  103  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  30.51 
 
 
1911 aa  102  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  36.11 
 
 
398 aa  101  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  30.12 
 
 
820 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2829  serine/threonine protein kinase  30.56 
 
 
593 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  31.15 
 
 
781 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0607  hypothetical protein  31.84 
 
 
611 aa  97.8  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  29.08 
 
 
862 aa  97.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  32.57 
 
 
882 aa  98.2  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  28.57 
 
 
654 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  27.82 
 
 
346 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  31.1 
 
 
620 aa  97.1  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  28.19 
 
 
416 aa  96.3  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16100  hypothetical protein  33.17 
 
 
237 aa  96.3  7e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.719572  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0831  hypothetical protein  28.85 
 
 
285 aa  95.9  9e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0420887  unclonable  0.0000101596 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4035  serine/threonine protein kinase  28.91 
 
 
639 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  28.91 
 
 
639 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  29.2 
 
 
637 aa  94.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0993  protein of unknown function DUF323  30.77 
 
 
401 aa  93.6  4e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  29.5 
 
 
740 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  27.69 
 
 
267 aa  94  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  30.86 
 
 
877 aa  93.6  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  30.04 
 
 
621 aa  93.2  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  29.82 
 
 
892 aa  92.8  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  27.82 
 
 
269 aa  92.8  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  27.82 
 
 
952 aa  92.4  9e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2145  hypothetical protein  29.19 
 
 
366 aa  92  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2831  serine/threonine protein kinase  31.15 
 
 
618 aa  92.4  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  28.26 
 
 
1104 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  41.5 
 
 
826 aa  90.5  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  29.82 
 
 
623 aa  90.1  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  28.73 
 
 
527 aa  90.1  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  40.14 
 
 
742 aa  88.6  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  24.06 
 
 
426 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  27.98 
 
 
664 aa  89  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  37.97 
 
 
829 aa  87.8  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  39.31 
 
 
325 aa  87.8  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1133  protein of unknown function DUF323  29.23 
 
 
321 aa  87.8  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.316154  normal  0.911277 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  38.06 
 
 
1581 aa  87.8  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0907  protein of unknown function DUF323  28.33 
 
 
359 aa  88.2  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  28.66 
 
 
1196 aa  86.7  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  37.91 
 
 
586 aa  85.9  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  28.14 
 
 
351 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  36.6 
 
 
433 aa  85.1  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2069  hypothetical protein  28.2 
 
 
281 aa  84.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.425192  normal  0.19976 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1232  hypothetical protein  27.15 
 
 
559 aa  84  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000146578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>