184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1721 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1721  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 302 aa  631  1e-180  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1314  Radical SAM domain protein  59.58 
 
 		 311 aa  372  1e-102  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.263305 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0327  Radical SAM domain protein  38.64 
 
 		 281 aa  182  6e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0182  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 256 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1167  radical SAM family protein  39.89 
 
 		 261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000379498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1991  radical SAM domain-containing protein  37.63 
 
 		 294 aa  129  5.0000000000000004e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2078  hypothetical protein  37.78 
 
 		 182 aa  128  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.583376 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1782  radical SAM domain-containing protein  35.08 
 
 		 281 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.425379  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0807  radical SAM domain-containing protein  32.41 
 
 		 242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1829  radical SAM domain-containing protein  32.83 
 
 		 276 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0830  radical SAM domain-containing protein  32.41 
 
 		 242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1433  Radical SAM domain protein  33.61 
 
 		 395 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.908326 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1963  radical SAM domain-containing protein  28.85 
 
 		 389 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.003672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0739  Radical SAM domain protein  35.36 
 
 		 245 aa  106  5e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.93142  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0959  radical SAM domain-containing protein  34.69 
 
 		 258 aa  105  7e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00609549  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2102  Radical SAM domain protein  29.3 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.793336  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0922  radical SAM domain-containing protein  29.15 
 
 		 387 aa  103  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.56559  normal  0.49234 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0937  hypothetical protein  33.84 
 
 		 385 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388526  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4362  radical SAM family protein  30.45 
 
 		 387 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2161  radical SAM domain-containing protein  31.31 
 
 		 373 aa  103  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0231722 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1181  radical SAM family protein  33.85 
 
 		 362 aa  102  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0204222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1225  Radical SAM domain protein  30.71 
 
 		 386 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.931656  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0508  radical SAM domain-containing protein  35.2 
 
 		 390 aa  102  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233922  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0387  hypothetical protein  32.32 
 
 		 390 aa  102  9e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0399  hypothetical protein  32.32 
 
 		 390 aa  102  9e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1946  radical SAM domain-containing protein  34.02 
 
 		 437 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041965 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1206  radical SAM family protein  30.25 
 
 		 393 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649327 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0015  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 363 aa  101  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.811476  hitchhiker  0.00130653 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2670  Radical SAM domain protein  31.36 
 
 		 290 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4818  Radical SAM domain protein  29.66 
 
 		 350 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1080  radical SAM family protein  29.41 
 
 		 386 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981176  normal  0.301506 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0704  radical SAM family protein  31.31 
 
 		 384 aa  100  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.503182  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1419  radical SAM domain-containing protein  31.79 
 
 		 359 aa  99.8  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12598  hypothetical protein  27.78 
 
 		 340 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1011  radical SAM domain-containing protein  36.36 
 
 		 301 aa  99.4  7e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0620  radical SAM family Fe-S protein  27.82 
 
 		 350 aa  98.6  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0452  radical SAM domain-containing protein  30.45 
 
 		 385 aa  98.2  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0398  radical SAM domain-containing protein  30.64 
 
 		 372 aa  97.8  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0556  Radical SAM domain protein  31.58 
 
 		 258 aa  96.7  4e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.162631  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3222  radical SAM family protein  27.49 
 
 		 387 aa  97.1  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2296  radical SAM family protein  26.6 
 
 		 341 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2343  radical SAM domain-containing protein  26.6 
 
 		 341 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.513503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2335  radical SAM domain-containing protein  26.6 
 
 		 358 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.799816  hitchhiker  0.00678012 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0556  Radical SAM domain protein  32.18 
 
 		 359 aa  95.9  8e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0685  radical SAM domain-containing protein  31.02 
 
 		 294 aa  95.9  8e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0316247 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1472  Radical SAM domain protein  35.45 
 
 		 270 aa  95.5  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0707  radical SAM domain-containing protein  31.63 
 
 		 421 aa  95.1  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0399019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1137  Radical SAM domain protein  30.38 
 
 		 357 aa  94.7  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3183  Radical SAM domain protein  24.82 
 
 		 370 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177318 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1003  hypothetical protein  28.03 
 
 		 381 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28900  DNA repair photolyase  27.69 
 
 		 350 aa  94.4  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.614391  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2599  radical SAM domain-containing protein  29.18 
 
 		 338 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1060  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 361 aa  94.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0286  radical SAM domain-containing protein  33.16 
 
 		 269 aa  94.7  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4466  radical SAM domain-containing protein  31.47 
 
 		 353 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1480  hypothetical protein  31.09 
 
 		 356 aa  94.7  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000411506  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3325  radical SAM family protein  29.53 
 
 		 368 aa  94  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000113455 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2190  radical SAM domain-containing protein  30.39 
 
 		 373 aa  94  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2980  Radical SAM domain protein  28.45 
 
 		 381 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0187919 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2341  hypothetical protein  28.99 
 
 		 377 aa  94  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0742  radical SAM family protein  28.69 
 
 		 361 aa  93.6  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.669971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1952  Radical SAM domain protein  27.14 
 
 		 344 aa  93.6  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0517  Radical SAM domain protein  31.12 
 
 		 385 aa  93.2  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.619466 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0798  radical SAM domain-containing protein  31.61 
 
 		 362 aa  93.2  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.442309 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1409  radical SAM domain-containing protein  31.25 
 
 		 267 aa  93.2  5e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47505  normal  0.209816 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05793  radical SAM domain protein  30.39 
 
 		 375 aa  92.8  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2123  radical SAM domain-containing protein  31.03 
 
 		 362 aa  92.8  7e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0547  radical SAM domain-containing protein  32.18 
 
 		 362 aa  92.4  8e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2509  hypothetical protein  27.84 
 
 		 366 aa  92  9e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.690045 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0561  Radical SAM domain protein  32.22 
 
 		 385 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2600  DNA repair photolyase  30.65 
 
 		 386 aa  91.7  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.64054  normal  0.361396 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2814  Radical SAM domain protein  31.31 
 
 		 343 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1808  Radical SAM domain protein  27.06 
 
 		 345 aa  92  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0645523  normal  0.369217 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03695  radical SAM domain protein  30.1 
 
 		 356 aa  91.7  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0729  radical SAM domain-containing protein  25.17 
 
 		 345 aa  92  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.321296 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2719  Radical SAM domain protein  30.81 
 
 		 343 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1025  radical SAM domain-containing protein  27.41 
 
 		 388 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0928  hypothetical protein  28.33 
 
 		 375 aa  90.9  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2545  radical SAM family protein  25.93 
 
 		 417 aa  91.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1658  radical SAM domain-containing protein  26.55 
 
 		 376 aa  90.9  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0587  radical SAM family protein  27.41 
 
 		 392 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0767  radical SAM domain-containing protein  25.91 
 
 		 386 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.338567 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1066  radical SAM domain-containing protein  27.41 
 
 		 392 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2237  radical SAM domain-containing protein  26.74 
 
 		 392 aa  90.5  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2104  Radical SAM domain protein  27.85 
 
 		 380 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124136  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1698  transporter  25.48 
 
 		 325 aa  90.1  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3517  Radical SAM domain protein  27.18 
 
 		 390 aa  90.1  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.546912  normal  0.918389 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1768  radical SAM domain-containing protein  27.2 
 
 		 374 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.938086 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3795  radical SAM domain-containing protein  28.68 
 
 		 339 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3138  radical SAM family protein  31.63 
 
 		 355 aa  89.7  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2004  Radical SAM domain protein  26.56 
 
 		 368 aa  89.7  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal  0.180359 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4095  radical SAM domain-containing protein  32.47 
 
 		 362 aa  89.7  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14520  DNA repair photolyase  25.64 
 
 		 357 aa  89.7  6e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2972  radical SAM domain-containing protein  26.57 
 
 		 385 aa  89.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2862  radical SAM domain-containing protein  26.57 
 
 		 383 aa  89.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22952  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2923  radical SAM domain-containing protein  26.57 
 
 		 385 aa  89.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2549  radical SAM domain-containing protein  26.57 
 
 		 385 aa  89.4  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22398  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0946  radical SAM domain-containing protein  27.04 
 
 		 392 aa  89  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1220  radical SAM domain-containing protein  25.19 
 
 		 329 aa  89  9e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0539702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0268  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 		 301 aa  89  9e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.698085  normal  0.0396119 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>