109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11623 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11623  ionic transporter integral membrane protein chaA  100 
 
 		 360 aa  677    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.140145 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3735  sodium/calcium exchanger membrane region  70.09 
 
 		 371 aa  426  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6768  sodium/calcium exchanger membrane region  56.99 
 
 		 392 aa  327  3e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1195  calcium/proton exchanger  55.21 
 
 		 361 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0433  calcium/cation antiporter  55.21 
 
 		 361 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.420944  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1144  calcium/cation antiporter  55.21 
 
 		 361 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.293577  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0009  calcium/proton exchanger  55.21 
 
 		 380 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1490  calcium/proton exchanger  55.21 
 
 		 361 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1405  calcium/cation antiporter  55.21 
 
 		 361 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0155  calcium/cation antiporter  54.93 
 
 		 361 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.416293  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4124  sodium/calcium exchanger membrane region  58.52 
 
 		 362 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3898  sodium/calcium exchanger membrane region  56.39 
 
 		 360 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.905693 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4012  sodium/calcium exchanger membrane region  56.39 
 
 		 360 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.406694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1393  calcium/proton exchanger  56.18 
 
 		 381 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107806  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4874  putative sodium/calcium exchanger membrane region  59.75 
 
 		 392 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4424  sodium/calcium exchanger membrane region  57.23 
 
 		 362 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.612228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3452  sodium/calcium exchanger membrane region  55.35 
 
 		 368 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3961  sodium/calcium exchanger membrane region  57.23 
 
 		 362 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0830114  normal  0.184483 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4399  Sodium/calcium exchanger membrane region  59.76 
 
 		 361 aa  299  6e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.636528  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0339  sodium/calcium exchanger membrane region  51.08 
 
 		 343 aa  298  9e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3837  sodium/calcium exchanger membrane region  56.77 
 
 		 362 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0780669  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4531  sodium/calcium exchanger membrane region  56.77 
 
 		 362 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117991  normal  0.913167 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5773  sodium/calcium exchanger membrane region  56.77 
 
 		 362 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4970  sodium/calcium exchanger membrane region  56.78 
 
 		 360 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.14573 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1316  Sodium/calcium exchanger  55.21 
 
 		 362 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572805  normal  0.640052 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3387  sodium/calcium exchanger membrane region  50.14 
 
 		 360 aa  287  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0305214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0997  Ca2+/H+ antiporter  57.14 
 
 		 355 aa  285  7e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.24422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1680  Ca2+/H+ antiporter  56.9 
 
 		 360 aa  285  8e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56452  normal  0.743279 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1646  sodium/calcium exchanger membrane region  51.65 
 
 		 359 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.23409  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6051  sodium/calcium exchanger membrane region  52.38 
 
 		 379 aa  278  9e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1979  calcium/proton antiporter  44.07 
 
 		 382 aa  278  1e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.632798 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3245  sodium/calcium exchanger membrane region  58.47 
 
 		 382 aa  273  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.400754  normal  0.71488 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3860  sodium/calcium exchanger membrane region  42.58 
 
 		 358 aa  272  6e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5473  sodium/calcium exchanger membrane region  58.59 
 
 		 361 aa  271  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37302  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0265  sodium/calcium exchanger membrane region  58.81 
 
 		 359 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.152273  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4437  sodium/calcium antiporter  57.14 
 
 		 355 aa  265  7e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.212303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0343  calcium/proton antiporter  44.31 
 
 		 385 aa  258  2e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6853  putative ionic transporter y4hA  49.17 
 
 		 365 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.529173  normal  0.370974 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6447  calcium/proton exchanger  49.25 
 
 		 369 aa  238  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.194017  normal  0.51142 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3965  sodium/calcium exchanger membrane region  47.4 
 
 		 360 aa  216  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116135  normal  0.85718 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3806  sodium/calcium exchanger membrane region  42.38 
 
 		 377 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.209552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3511  sodium/calcium exchanger membrane region  42.34 
 
 		 377 aa  206  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3493  sodium/calcium exchanger membrane region  40.61 
 
 		 386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0439084  normal  0.408385 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1368  calcium/sodium:proton antiporter  36.08 
 
 		 366 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.455587  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1902  calcium/sodium:proton antiporter  35.8 
 
 		 366 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.22655  normal  0.347346 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1908  calcium/sodium:proton antiporter  35.8 
 
 		 366 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1924  calcium/sodium:proton antiporter  35.9 
 
 		 366 aa  193  4e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25776  normal  0.0698126 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1966  calcium/sodium:proton antiporter  35.51 
 
 		 366 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.788667 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2430  calcium/proton exchanger  35.9 
 
 		 366 aa  193  5e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.64101  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1699  calcium/sodium:proton antiporter  35.9 
 
 		 366 aa  192  6e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.569241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1359  sodium/calcium exchanger membrane region  41.01 
 
 		 368 aa  192  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0140249 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01194  calcium/sodium:proton antiporter  35.61 
 
 		 366 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1324  calcium/sodium:proton antiporter  35.61 
 
 		 366 aa  191  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.185191  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1366  calcium/sodium:proton antiporter  35.61 
 
 		 366 aa  191  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0643431  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2407  calcium/sodium:proton antiporter  35.61 
 
 		 366 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227831 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1383  calcium/sodium:proton antiporter  35.61 
 
 		 366 aa  191  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.779424  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01204  hypothetical protein  35.61 
 
 		 366 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1552  calcium/sodium:proton antiporter  35.2 
 
 		 366 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.154529 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2574  calcium/sodium:proton antiporter  33.99 
 
 		 366 aa  189  8e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2267  calcium/sodium:proton antiporter  33.71 
 
 		 366 aa  189  9e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2332  calcium/sodium:proton antiporter  33.24 
 
 		 364 aa  186  4e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3397  sodium/calcium exchanger membrane region  40.13 
 
 		 365 aa  183  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.689879  normal  0.0994344 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1757  calcium/sodium:proton antiporter  33.33 
 
 		 366 aa  181  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2124  calcium/sodium:proton antiporter  33.43 
 
 		 366 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.898006  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2523  calcium/sodium:proton antiporter  33.43 
 
 		 366 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2233  calcium/sodium:proton antiporter  33.43 
 
 		 366 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0545  calcium/proton transporter, putative  40.31 
 
 		 378 aa  178  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.97035  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1001  calcium/proton antiporter  35.87 
 
 		 365 aa  178  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0994  sodium/calcium exchanger membrane region  35.11 
 
 		 361 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0959  sodium/calcium exchanger membrane region  35.11 
 
 		 361 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3384  sodium/calcium exchanger membrane region  34.8 
 
 		 370 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0979  sodium/calcium exchanger membrane region  34.48 
 
 		 365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0910  sodium/calcium exchanger membrane region  34.48 
 
 		 365 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3290  sodium/calcium exchanger membrane region  34.29 
 
 		 365 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2920  calcium/sodium:proton antiporter  32.3 
 
 		 366 aa  172  9e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1793  calcium/sodium:proton antiporter  34.26 
 
 		 366 aa  166  5e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102364  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0764  calcium/proton antiporter, putative  30.5 
 
 		 365 aa  157  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0668  Sodium/calcium exchanger membrane region  30.32 
 
 		 367 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0674  Sodium/calcium exchanger membrane region  30 
 
 		 363 aa  153  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.774852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3147  Ca2+/H+ antiporter  29.36 
 
 		 385 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409231  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5666  sodium/calcium exchanger membrane region  36.86 
 
 		 380 aa  141  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2175  CaCA family calcium/proton exchanger  32.48 
 
 		 382 aa  140  4.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.226472 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2992  sodium/calcium exchanger membrane region  31.16 
 
 		 365 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.198433  normal  0.141377 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2731  sodium/calcium exchanger membrane region  30.84 
 
 		 365 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0140  sodium/calcium exchanger membrane region  29.48 
 
 		 374 aa  122  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24550  Ca2+/H+ antiporter  31.96 
 
 		 440 aa  92.8  9e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0945764  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1369  calcium/proton antiporter, CaCA family  28.85 
 
 		 354 aa  70.9  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2705  calcium/cation antiporter  23.22 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000150317  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1870  calcium/proton antiporter, CaCA family  28 
 
 		 351 aa  59.3  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.757367  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4046  calcium/proton antiporter, CaCA family  29.34 
 
 		 364 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.633248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0023  calcium/proton exchanger  29.02 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.662707 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0894  calcium/proton exchanger  28.1 
 
 		 367 aa  56.2  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3001  calcium/proton antiporter, CaCA family  24.53 
 
 		 358 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67118  Ca2+/H+ antiporter  23.2 
 
 		 416 aa  53.5  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.112466  normal  0.866268 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1624  calcium/proton exchanger  22.92 
 
 		 348 aa  52.8  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000062591  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4558  calcium/proton exchanger  26.11 
 
 		 363 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0904  calcium/proton antiporter, CaCA family  29.1 
 
 		 356 aa  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0458439  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1366  calcium/proton exchanger  23.72 
 
 		 348 aa  50.4  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.609235  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0405  calcium/cation antiporter  23.6 
 
 		 351 aa  49.3  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2549  calcium/proton antiporter, CaCA family  24.14 
 
 		 365 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>