54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1462 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1462  imelysin  100 
 
 		 356 aa  715    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0336824  normal  0.0166245 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2721  Peptidase M75, Imelysin  34.28 
 
 		 425 aa  140  3.9999999999999997e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00128061  normal  0.730271 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3792  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 384 aa  139  6e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0676  putative lipoprotein  31.4 
 
 		 382 aa  135  8e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0791  putative lipoprotein  29.34 
 
 		 381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0722  putative lipoprotein  28.86 
 
 		 387 aa  124  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00126841  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0671  putative lipoprotein  29.34 
 
 		 383 aa  123  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0811  putative lipoprotein  27.42 
 
 		 387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208807  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0694  putative lipoprotein  26.33 
 
 		 381 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0937  putative lipoprotein  27.37 
 
 		 386 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000801975  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3870  Peptidase M75, Imelysin  28.43 
 
 		 391 aa  97.1  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755425  normal  0.516703 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0971  putative lipoprotein  28.35 
 
 		 386 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0240965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1934  hypothetical protein  26.81 
 
 		 368 aa  84.7  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0548586 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0668  hypothetical protein  23.81 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0864322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0883  putative iron-regulated protein A  25.51 
 
 		 435 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.500561  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0825  hypothetical protein  26.92 
 
 		 358 aa  70.5  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1458  iron-regulated protein A, putative  25.97 
 
 		 399 aa  69.7  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.449627  normal  0.841376 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1925  putative iron-regulated protein  25 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330682 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3868  Peptidase M75, Imelysin  24.02 
 
 		 441 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  0.169885 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1525  putative iron-regulated protein  23.85 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217885 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2833  putative iron-regulated protein A  24.24 
 
 		 431 aa  63.9  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0600822  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37860  hypothetical protein  26.88 
 
 		 354 aa  62  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214112  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1786  putative iron-regulated protein  22.86 
 
 		 417 aa  61.6  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003123  iron-regulated protein A precursor  21.82 
 
 		 420 aa  61.2  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2203  hypothetical protein  26.96 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02715  hypothetical protein  22.86 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1370  hypothetical protein  23.9 
 
 		 338 aa  58.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2561  putative iron-regulated protein  24.57 
 
 		 400 aa  56.2  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126038 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2557  putative iron-regulated protein  20.27 
 
 		 431 aa  55.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000340096  hitchhiker  0.000000144413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4530  Peptidase M75, Imelysin  21.85 
 
 		 384 aa  53.9  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4578  hypothetical protein  37.35 
 
 		 424 aa  53.5  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.219407 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3197  putative iron-regulated protein  38.03 
 
 		 428 aa  53.5  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.767807  normal  0.856839 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37840  hypothetical protein  25.09 
 
 		 441 aa  52.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00426998  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3326  hypothetical protein  24.04 
 
 		 445 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4939  hypothetical protein  31.33 
 
 		 475 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56830  metalloproteinase outer membrane  31.33 
 
 		 446 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4061  iron-regulated protein A, putative  24.68 
 
 		 458 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08516  hypothetical protein  27.03 
 
 		 379 aa  48.9  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0641  hypothetical protein  23.1 
 
 		 358 aa  48.9  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4475  hypothetical protein  23.47 
 
 		 445 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811777 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3529  putative iron-regulated protein  32.53 
 
 		 426 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0199  putative iron-regulated protein  31.4 
 
 		 441 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.929699 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1368  putative lipoprotein  36.14 
 
 		 420 aa  48.5  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1548  imelysin  31.4 
 
 		 422 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4315  hypothetical protein  33.73 
 
 		 424 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0310  hypothetical protein  23.04 
 
 		 377 aa  47  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0643  imelysin  31.03 
 
 		 417 aa  46.6  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0272375  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0952  hypothetical protein  23.33 
 
 		 444 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4366  iron-regulated protein A, putative  23.58 
 
 		 452 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0913  hypothetical protein  23.33 
 
 		 443 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0565  hypothetical protein  20.99 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2084  hypothetical protein  25.83 
 
 		 387 aa  44.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.868997 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3297  periplasmic lipoprotein-like protein  23.24 
 
 		 353 aa  44.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5685  hypothetical protein  22.34 
 
 		 376 aa  43.1  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.421727  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>