More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1161 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1161  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
214 aa  437  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.981458 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1298  Holliday junction DNA helicase RuvA  65.42 
 
 
214 aa  286  2e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15861  Holliday junction DNA helicase RuvA  52 
 
 
233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4681  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.6 
 
 
207 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07021  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.98 
 
 
223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0478763  normal  0.273413 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4475  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.33 
 
 
209 aa  137  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2298  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.6 
 
 
207 aa  137  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0268  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.16 
 
 
224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.426034  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09371  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.78 
 
 
224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0618985  normal  0.218033 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0745  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.38 
 
 
199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000883401  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1076  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.79 
 
 
199 aa  125  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131842  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0018  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.1 
 
 
210 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0020  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.1 
 
 
210 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2671  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.57 
 
 
198 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.103257  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.51 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.51 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2472  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
212 aa  113  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.196184  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.67 
 
 
201 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.67 
 
 
201 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.85 
 
 
205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.05 
 
 
202 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2820  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.94 
 
 
213 aa  109  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.480869 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0931  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.62 
 
 
199 aa  109  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.97537e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3315  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.62 
 
 
199 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0857  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  27.15 
 
 
225 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0640033  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.54 
 
 
202 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09181  putative holliday junction DNA helicase RuvA  28.05 
 
 
225 aa  108  5e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0728559  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1271  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.23 
 
 
202 aa  107  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0682991  normal  0.630495 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09161  putative holliday junction DNA helicase RuvA  27.15 
 
 
225 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.745862  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.74 
 
 
205 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.74 
 
 
205 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2031  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.11 
 
 
204 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000338953  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2337  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.96 
 
 
197 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.194735  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2421  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.11 
 
 
204 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0480934  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2144  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.11 
 
 
204 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0379489  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1705  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.25 
 
 
209 aa  105  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.275173  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2212  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.37 
 
 
204 aa  105  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10251  putative holliday junction DNA helicase RuvA  26.55 
 
 
228 aa  105  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.177357  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.57 
 
 
202 aa  104  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.21 
 
 
205 aa  104  9e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0530  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.92 
 
 
206 aa  104  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1754  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.87 
 
 
200 aa  103  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000623811  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0420  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.87 
 
 
200 aa  103  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0074  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.44 
 
 
196 aa  103  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000176454  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0484  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.44 
 
 
193 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1879  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.6 
 
 
193 aa  102  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000619466  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0269  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
204 aa  102  4e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0893  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
200 aa  102  5e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000557116  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4725  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.92 
 
 
202 aa  102  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.08 
 
 
189 aa  101  7e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.250827  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2494  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.82 
 
 
208 aa  101  7e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4665  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.59 
 
 
190 aa  101  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1353  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.74 
 
 
203 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  hitchhiker  0.00521266 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2054  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.74 
 
 
203 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2109  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.74 
 
 
203 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.434147  normal  0.12473 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1229  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.74 
 
 
203 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0100145  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1226  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.97 
 
 
190 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1414  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.05 
 
 
199 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000662939  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2049  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.74 
 
 
203 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774525  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.52 
 
 
200 aa  100  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1248  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.61 
 
 
200 aa  100  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2116  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.46 
 
 
211 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1884  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.48 
 
 
203 aa  100  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.425804  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1819  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.88 
 
 
205 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.180722  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4062  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.25 
 
 
192 aa  99.8  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1771  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.85 
 
 
203 aa  99  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0290161  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1954  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.85 
 
 
203 aa  99  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.165373  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2181  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.53 
 
 
205 aa  99  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.613402  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0718  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.31 
 
 
207 aa  98.6  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  0.726711 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1779  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.8 
 
 
203 aa  98.6  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00140889  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1583  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.99 
 
 
193 aa  98.6  7e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.281985  normal  0.49857 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0957  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.8 
 
 
203 aa  98.6  7e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00202612  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2597  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.8 
 
 
203 aa  98.6  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1325  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.8 
 
 
203 aa  98.6  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2091  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.8 
 
 
203 aa  98.6  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000143296  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2103  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.92 
 
 
205 aa  98.2  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01832  Holliday junction DNA helicase motor protein  33.85 
 
 
203 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.263475  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2096  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.38 
 
 
196 aa  97.8  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01820  hypothetical protein  33.85 
 
 
203 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.22815  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3345  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.57 
 
 
193 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238137 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2353  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.16 
 
 
194 aa  97.8  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.547794 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0616  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.57 
 
 
193 aa  97.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1847  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  30.89 
 
 
206 aa  97.4  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0445343  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2077  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.24 
 
 
205 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000433363  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1437  Holliday junction DNA helicase RuvA  30 
 
 
204 aa  97.8  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000146819  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2572  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.75 
 
 
205 aa  97.4  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0232474  hitchhiker  0.00151008 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1956  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.24 
 
 
205 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00381182  normal  0.897117 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1424  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.99 
 
 
210 aa  97.1  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000192016  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0811  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.18 
 
 
202 aa  97.1  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.24 
 
 
205 aa  96.7  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2076  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.12 
 
 
205 aa  96.7  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.438835  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2720  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.34 
 
 
197 aa  96.7  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0527  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.37 
 
 
199 aa  96.7  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0424  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.96 
 
 
193 aa  96.7  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.702078  normal  0.0516739 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2033  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.02 
 
 
205 aa  96.7  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00030841  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3674  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.71 
 
 
205 aa  96.7  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000325951  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1938  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.84 
 
 
205 aa  96.3  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00077844  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0684  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.25 
 
 
207 aa  96.3  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.801169  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1901  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.76 
 
 
205 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000334634  hitchhiker  0.000124168 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1661  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.05 
 
 
199 aa  96.3  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>