More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3528 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1301  magnesium transporter  77.88 
 
 		 484 aa  707    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1565  magnesium transporter, putative  77.3 
 
 		 456 aa  716    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2551  magnesium transporter  75.28 
 
 		 458 aa  689    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2974  magnesium transporter  76.48 
 
 		 456 aa  701    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.467265  normal  0.0484227 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2704  MgtE intracellular region  77.75 
 
 		 456 aa  723    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000714396  hitchhiker  0.000367704 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2772  MgtE intracellular region  77.75 
 
 		 456 aa  723    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000125234  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2763  MgtE intracellular region  72.47 
 
 		 465 aa  691    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00201718  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3528  MgtE intracellular region  100 
 
 		 455 aa  917    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000114236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1408  magnesium transporter  76.48 
 
 		 456 aa  701    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0463641  normal  0.12261 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2874  MgtE intracellular region  77.53 
 
 		 456 aa  719    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000391262  hitchhiker  0.000117357 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1081  magnesium transporter, putative  74.33 
 
 		 454 aa  676    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00154782  normal  0.461647 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1369  magnesium transporter  76.48 
 
 		 456 aa  701    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1385  magnesium transporter  76.48 
 
 		 456 aa  701    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4045  magnesium transporter  70.2 
 
 		 472 aa  629  1e-179  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000565  putative magnesium transporter MgtE  48.65 
 
 		 448 aa  415  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000005121  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05323  hypothetical protein  47.31 
 
 		 448 aa  404  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0416  putative magnesium transporter MgtE  46.64 
 
 		 448 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000019  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0180  divalent cation transporter, putative magnesium transporter  46.86 
 
 		 448 aa  381  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.881187  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1060  MgtE intracellular region  46.83 
 
 		 443 aa  371  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3911  serine/threonine protein kinase  45.97 
 
 		 446 aa  371  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0262  MgtE intracellular region  47.24 
 
 		 445 aa  342  1e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00197  putative Magnesium transporter  44.33 
 
 		 445 aa  333  3e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00518446  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2758  MgtE integral membrane region  36.78 
 
 		 448 aa  288  1e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2060  magnesium transporter  36.09 
 
 		 492 aa  281  2e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000417993  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0571  magnesium transporter  39.37 
 
 		 467 aa  278  2e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  38.53 
 
 		 453 aa  277  3e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2421  magnesium transporter  37.87 
 
 		 450 aa  276  6e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545313  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0645  magnesium transporter  36.97 
 
 		 452 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0824163  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0582  Mg/Co/Ni transporter MgtE  38.23 
 
 		 467 aa  274  3e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3966  magnesium transporter  36.49 
 
 		 454 aa  271  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0971  magnesium transporter  33.99 
 
 		 453 aa  269  8e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000190733  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0710  magnesium transporter  35.78 
 
 		 454 aa  267  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000631089  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3074  magnesium transporter  35.14 
 
 		 475 aa  267  2.9999999999999995e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687941 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3976  magnesium transporter  34.6 
 
 		 480 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  35.78 
 
 		 454 aa  265  1e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3354  magnesium transporter  35.78 
 
 		 454 aa  265  1e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  34.6 
 
 		 480 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  34.6 
 
 		 480 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  33.12 
 
 		 480 aa  264  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3760  magnesium transporter  34.52 
 
 		 480 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00964036  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3682  magnesium transporter  34.92 
 
 		 480 aa  265  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0667  magnesium transporter  35.55 
 
 		 454 aa  264  3e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2801  divalent cation transporter  37.91 
 
 		 452 aa  263  6e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0306  magnesium transporter  35.14 
 
 		 479 aa  263  6e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13146  hitchhiker  0.00174841 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4549  magnesium transporter  36.61 
 
 		 452 aa  261  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4271  divalent cation transporter  34.83 
 
 		 480 aa  261  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000733148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1825  magnesium transporter  37.12 
 
 		 463 aa  261  2e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202182  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1840  divalent cation transporter  34.91 
 
 		 453 aa  260  3e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3622  magnesium transporter  35.09 
 
 		 454 aa  260  3e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.135678  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  34.87 
 
 		 454 aa  260  4e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  34.87 
 
 		 454 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  35.55 
 
 		 454 aa  259  8e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  34.65 
 
 		 454 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0721  magnesium transporter  34.63 
 
 		 454 aa  256  5e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167519 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1846  magnesium transporter  32.85 
 
 		 480 aa  256  6e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02217  magnesium transporter  36.43 
 
 		 422 aa  256  8e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3382  magnesium transporter  36.32 
 
 		 454 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.363371  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3093  magnesium transporter  35.27 
 
 		 454 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3552  divalent cation transporter  32.43 
 
 		 480 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0662808  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4599  putative Mg transporter MgtE  32.57 
 
 		 482 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3316  magnesium transporter  34.78 
 
 		 455 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52460  putative Mg transporter MgtE  32.57 
 
 		 482 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2896  magnesium transporter  32.96 
 
 		 453 aa  252  1e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0679732  normal  0.300943 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2231  magnesium transporter  36.74 
 
 		 450 aa  248  1e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.555024  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  33.26 
 
 		 454 aa  247  3e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3183  magnesium transporter  38.48 
 
 		 455 aa  245  9.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0946  magnesium transporter  35.7 
 
 		 453 aa  245  9.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.313196  normal  0.57653 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3011  magnesium transporter  36.24 
 
 		 451 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0493  magnesium transporter  33.71 
 
 		 451 aa  243  7e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.862314  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002398  magnesium transporter  33.95 
 
 		 452 aa  241  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3545  magnesium transporter  33.71 
 
 		 477 aa  240  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1224  magnesium transporter  30.96 
 
 		 491 aa  240  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3111  magnesium transporter  30.96 
 
 		 491 aa  240  4e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1341  magnesium transporter  30.96 
 
 		 491 aa  240  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  33.5 
 
 		 452 aa  239  5.999999999999999e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000340775  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2114  magnesium transporter  33.02 
 
 		 453 aa  238  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2790  magnesium transporter  32.44 
 
 		 478 aa  235  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.559033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03669  hypothetical protein  32.79 
 
 		 451 aa  235  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0108  magnesium transporter  34.12 
 
 		 481 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1567  magnesium transporter  31.19 
 
 		 481 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3667  MgtE integral membrane region  35.18 
 
 		 456 aa  228  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2506  divalent cation transporter  35.47 
 
 		 494 aa  225  1e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34420  magnesium transporter; MgtE  31.45 
 
 		 480 aa  224  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.902296  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1994  divalent cation transporter  32.73 
 
 		 442 aa  216  9.999999999999999e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1327  magnesium transporter  31.71 
 
 		 492 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2951  magnesium transporter  31.94 
 
 		 492 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  32.59 
 
 		 471 aa  213  5.999999999999999e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000256  putative magnesium transporter MgtE  34.13 
 
 		 448 aa  208  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  32.09 
 
 		 476 aa  208  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  31.58 
 
 		 471 aa  206  5e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  31.45 
 
 		 473 aa  206  6e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0540  magnesium transporter  31.94 
 
 		 478 aa  204  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0471  magnesium transporter  31.81 
 
 		 482 aa  196  7e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.963916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1619  magnesium transporter  34.06 
 
 		 481 aa  195  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00438274  normal  0.116909 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0696  magnesium transporter  31.39 
 
 		 470 aa  194  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0731  magnesium transporter  33.13 
 
 		 455 aa  192  1e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.22084  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2723  magnesium transporter  30.07 
 
 		 462 aa  192  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  30.39 
 
 		 473 aa  190  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1332  magnesium transporter  32.11 
 
 		 455 aa  187  3e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1626  magnesium transporter  33.44 
 
 		 454 aa  187  4e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>