More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0663 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0663  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  100 
 
 
298 aa  611  9.999999999999999e-175  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1211  nucleotide-binding protein  44.49 
 
 
279 aa  262  6e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000175962  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2286  chromosome partitioning ATPase  47.39 
 
 
262 aa  246  3e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.119117  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1232  hypothetical protein  50 
 
 
277 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000427617  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3049  Mrp protein  44.84 
 
 
281 aa  237  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.753797  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1654  nucleotide-binding protein  47.27 
 
 
279 aa  236  4e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0329038  hitchhiker  0.00690979 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2518  nucleotide-binding protein  45.34 
 
 
276 aa  224  1e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00750762  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1328  ATPase-like, ParA/MinD  41.79 
 
 
302 aa  224  2e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2141  chromosome partitioning ATPase protein  48 
 
 
278 aa  223  3e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.98 
 
 
287 aa  223  3e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0628  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  47.62 
 
 
419 aa  222  4.9999999999999996e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0599345  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0091  hypothetical protein  43.15 
 
 
304 aa  220  3e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0660  nucleotide-binding protein  46.84 
 
 
281 aa  215  8e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000522627  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0180  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.74 
 
 
289 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3271  hypothetical protein  46.85 
 
 
357 aa  214  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1731  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.74 
 
 
289 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.826727 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0872  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.85 
 
 
289 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.439579  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1985  nucleotide-binding protein  42.55 
 
 
282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2027  Mrp protein  47.56 
 
 
285 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.251832 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3017  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  40.8 
 
 
439 aa  211  9e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000106278  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3393  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  47.46 
 
 
372 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1967  ATP-binding protein  40.82 
 
 
297 aa  211  1e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.847936 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.97 
 
 
289 aa  211  2e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.388921  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1282  ATP-binding protein  40.96 
 
 
297 aa  209  4e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.240384  normal  0.0376424 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1360  hypothetical protein  46.98 
 
 
365 aa  209  4e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1343  Mrp protein  45.5 
 
 
347 aa  209  5e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.654252  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0395  Mrp/NBP35 family protein  46.85 
 
 
354 aa  209  5e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.616395  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.74 
 
 
348 aa  209  6e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3613  ParA family protein  40.78 
 
 
292 aa  209  7e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0375479 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0943  ATP-binding protein  46.09 
 
 
282 aa  208  9e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  46.67 
 
 
357 aa  208  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0394  polysaccharide export protein  46.56 
 
 
277 aa  207  2e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2510  hypothetical protein  45.95 
 
 
360 aa  207  2e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  46.85 
 
 
358 aa  206  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2587  protein of unknown function DUF59  43.28 
 
 
351 aa  206  3e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600696  normal  0.426631 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  46.85 
 
 
358 aa  206  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1575  ATPase-like, ParA/MinD  44.84 
 
 
358 aa  206  5e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0104  hypothetical protein  43.23 
 
 
328 aa  205  6e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000677137  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0410  Mrp protein  44.4 
 
 
298 aa  205  8e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0473573 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0621  Mrp protein  40.3 
 
 
301 aa  205  9e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2048  MRP ATP/GTP-binding protein  47.09 
 
 
372 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3344  ATPase-like, ParA/MinD  44.2 
 
 
358 aa  203  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.312419  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1045  hypothetical protein  46.19 
 
 
364 aa  203  3e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.232996  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1920  ATPase-like, ParA/MinD  44.2 
 
 
296 aa  203  3e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1786  nucleotide-binding protein-like protein  47.09 
 
 
361 aa  203  3e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1946  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.56 
 
 
288 aa  203  3e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0731  hypothetical protein  43.64 
 
 
290 aa  203  3e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0264  chromosome partitioning ATPase  41.95 
 
 
328 aa  202  4e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1472  chromosome partitioning ATPase protein  44.11 
 
 
394 aa  202  4e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.95165  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2187  putative multidrug-resistance related protein  47.73 
 
 
370 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0964076  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1128  hypothetical protein  40.47 
 
 
302 aa  202  4e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0634  chromosome partitioning ATPase protein  43.15 
 
 
280 aa  202  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.556056  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0442  hypothetical protein  49.77 
 
 
384 aa  202  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.0224463 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2145  MRP protein-like protein  45.74 
 
 
382 aa  202  6e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0337  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.82 
 
 
300 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  unclonable  0.0000000110722  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  43.95 
 
 
363 aa  201  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2521  Mrp protein  40.66 
 
 
284 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1408  ParA family protein  43.37 
 
 
295 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.738873  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  47.09 
 
 
363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0533  Mrp protein  41.99 
 
 
272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1191  Mrp protein  41.77 
 
 
304 aa  199  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00197237  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1315  hypothetical protein  43.97 
 
 
297 aa  199  3e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00797735  hitchhiker  0.00521275 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2835  ATPase  39.93 
 
 
284 aa  199  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0267  hypothetical protein  43.75 
 
 
288 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.950713  normal  0.311122 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0268  ATP-binding protein  41.37 
 
 
284 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.54861  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1234  hypothetical protein  45.29 
 
 
370 aa  199  5e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4565  MRP protein-like protein  46.19 
 
 
378 aa  199  5e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3465  MinD/MRP family ATPase  41.7 
 
 
376 aa  198  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  46.19 
 
 
375 aa  199  7e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2115  ParA family protein  42.37 
 
 
286 aa  198  7.999999999999999e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  43.95 
 
 
362 aa  198  9e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0064  hypothetical protein  47.03 
 
 
389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0745  MRP family ATPase  38.04 
 
 
285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5982  MRP protein-like protein  44.3 
 
 
374 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141343  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3327  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  45.95 
 
 
415 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0721864  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5082  MRP protein-like protein  45.29 
 
 
373 aa  196  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0057  mrp-related protein  47.03 
 
 
387 aa  196  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1565  protein of unknown function DUF59  43.36 
 
 
354 aa  196  3e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.226796  normal  0.517405 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1898  MRP family ATP-binding protein  44.02 
 
 
354 aa  197  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121089  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01241  hypothetical protein  46.64 
 
 
285 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2615  chromosome partitioning ATPase protein  41.78 
 
 
280 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0057  mrp-related protein  47.03 
 
 
394 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0740397  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1042  putative ATP-binding protein  43.95 
 
 
374 aa  196  5.000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.261199  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2325  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.05 
 
 
367 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2838  putative mrp protein  40.66 
 
 
391 aa  194  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0284462  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2075  hypothetical protein  43.75 
 
 
298 aa  194  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.010662  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  43.3 
 
 
363 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  45.5 
 
 
379 aa  194  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3202  hypothetical protein  41.13 
 
 
415 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.560297  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  44.84 
 
 
364 aa  193  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1702  chromosome partitioning ATPase  39.85 
 
 
428 aa  194  2e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3481  putative ATP-binding protein  43.3 
 
 
362 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00831009  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2055  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  42.44 
 
 
376 aa  194  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7302  MRP protein-like protein  43.98 
 
 
374 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145804  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  44.59 
 
 
363 aa  193  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1138  hypothetical protein  46.93 
 
 
368 aa  193  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2204  hypothetical protein  44.59 
 
 
382 aa  193  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.746531  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2066  MRP ATP/GTP-binding protein  46.85 
 
 
373 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0228594  normal  0.0543779 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.01 
 
 
408 aa  193  3e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.3 
 
 
362 aa  193  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0291426  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>