More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1211 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1211  nucleotide-binding protein  100 
 
 
279 aa  562  1.0000000000000001e-159  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000175962  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0091  hypothetical protein  50.9 
 
 
304 aa  294  9e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1328  ATPase-like, ParA/MinD  52.65 
 
 
302 aa  290  1e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1232  hypothetical protein  54.83 
 
 
277 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000427617  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3049  Mrp protein  52.33 
 
 
281 aa  286  4e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.753797  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1654  nucleotide-binding protein  53.19 
 
 
279 aa  282  4.0000000000000003e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0329038  hitchhiker  0.00690979 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2286  chromosome partitioning ATPase  52.3 
 
 
262 aa  265  7e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.119117  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0660  nucleotide-binding protein  51.27 
 
 
281 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000522627  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2518  nucleotide-binding protein  48.36 
 
 
276 aa  258  8e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00750762  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0663  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  44.49 
 
 
298 aa  250  1e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1985  nucleotide-binding protein  45.9 
 
 
282 aa  250  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0264  chromosome partitioning ATPase  49.57 
 
 
328 aa  249  3e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0104  hypothetical protein  48.94 
 
 
328 aa  245  4.9999999999999997e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000677137  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2835  ATPase  45.32 
 
 
284 aa  244  9e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0628  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  48.04 
 
 
419 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0599345  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2521  Mrp protein  45.32 
 
 
284 aa  243  3e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3017  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  45.53 
 
 
439 aa  241  7.999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000106278  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0394  polysaccharide export protein  50.19 
 
 
277 aa  240  2e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2227  ATP-binding protein  50.36 
 
 
280 aa  237  1e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.14194 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08340  chromosome partitioning ATPase  49.09 
 
 
276 aa  236  3e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.16254 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04680  chromosome partitioning ATPase  50.61 
 
 
284 aa  229  3e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  50.45 
 
 
357 aa  229  4e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1525  ATP-binding protein  50.21 
 
 
269 aa  228  7e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.486676  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0943  ATP-binding protein  54.39 
 
 
282 aa  228  1e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_114  hydrogenase 1 maturation protease-like protein  48.07 
 
 
328 aa  227  2e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1343  Mrp protein  46.9 
 
 
347 aa  226  3e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.654252  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0533  Mrp protein  45.38 
 
 
272 aa  225  5.0000000000000005e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2141  chromosome partitioning ATPase protein  46.19 
 
 
278 aa  225  6e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.03 
 
 
287 aa  225  8e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.87 
 
 
289 aa  224  9e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.388921  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  49.56 
 
 
358 aa  223  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  49.56 
 
 
358 aa  223  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1710  hypothetical protein  48.67 
 
 
363 aa  223  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  46.64 
 
 
363 aa  222  4.9999999999999996e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2115  ParA family protein  47.16 
 
 
286 aa  221  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1282  ATP-binding protein  43.63 
 
 
297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.240384  normal  0.0376424 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2621  hypothetical protein  48.7 
 
 
363 aa  219  3e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0337  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.66 
 
 
300 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  unclonable  0.0000000110722  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1731  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.73 
 
 
289 aa  219  5e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.826727 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2800  protein of unknown function DUF59  48.25 
 
 
363 aa  218  7e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183179  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3476  hypothetical protein  48.25 
 
 
363 aa  218  7e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0863865  normal  0.308541 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0872  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.64 
 
 
289 aa  217  1e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.439579  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1967  ATP-binding protein  42.64 
 
 
297 aa  218  1e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.847936 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0180  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.04 
 
 
289 aa  217  2e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  46.22 
 
 
363 aa  217  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  47.44 
 
 
363 aa  217  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0268  ATP-binding protein  43.98 
 
 
284 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.54861  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1042  putative ATP-binding protein  45.13 
 
 
374 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.261199  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  45.98 
 
 
363 aa  215  8e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1360  hypothetical protein  46.02 
 
 
365 aa  214  9.999999999999999e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2014  hypothetical protein  49.56 
 
 
357 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000063714  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1296  Mrp protein  44.19 
 
 
359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.27319  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3481  putative ATP-binding protein  46.02 
 
 
362 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00831009  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0731  hypothetical protein  43.24 
 
 
290 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2245  ATP-binding protein, Mrp/Nbp35 family protein  43.59 
 
 
371 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.615288  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.02 
 
 
362 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0291426  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2189  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.58 
 
 
362 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00291769  normal  0.27131 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0907  ATP-binding protein  43.14 
 
 
293 aa  212  7e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.124437  normal  0.543626 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3272  putative iron sulfur binding protein  47.37 
 
 
363 aa  211  7e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  48.02 
 
 
395 aa  211  7.999999999999999e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0920  hypothetical protein  47.32 
 
 
362 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1064  hypothetical protein  47.32 
 
 
362 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.626095  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0052  mrP protein  46.88 
 
 
361 aa  211  9e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1406  hypothetical protein  46.52 
 
 
362 aa  211  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.295791  normal  0.937662 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3885  ParA family protein  44.68 
 
 
364 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0267  hypothetical protein  46.22 
 
 
288 aa  211  1e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.950713  normal  0.311122 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0931  putative iron sulfur binding protein  46.02 
 
 
363 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4314  hypothetical protein  45.49 
 
 
364 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1557  hypothetical protein  45.81 
 
 
362 aa  211  1e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3613  ParA family protein  43.18 
 
 
292 aa  211  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0375479 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0968  protein of unknown function DUF59  49.12 
 
 
371 aa  210  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1547  ParA family protein  42.63 
 
 
356 aa  210  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.97129  hitchhiker  0.000107443 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0972  hypothetical protein  47.77 
 
 
365 aa  210  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.642546  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1138  hypothetical protein  45.49 
 
 
364 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.192644  normal  0.84977 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1786  nucleotide-binding protein-like protein  47.37 
 
 
361 aa  210  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2379  MRP family ATP-binding protein  46.46 
 
 
362 aa  209  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.384277  hitchhiker  0.0044393 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4075  protein of unknown function DUF59  45.35 
 
 
363 aa  209  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1403  hypothetical protein  46.7 
 
 
362 aa  209  3e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0041  hypothetical protein  43.97 
 
 
304 aa  209  3e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0118047 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  45.81 
 
 
362 aa  210  3e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1127  hypothetical protein  45.49 
 
 
364 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1098  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  45.08 
 
 
364 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285598  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2592  protein of unknown function DUF59  46.43 
 
 
363 aa  209  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.144704 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1814  protein of unknown function DUF59  47.08 
 
 
363 aa  209  4e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0920101  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0423  ATPase-like, ParA/MinD  44.35 
 
 
376 aa  209  5e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2348  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.78 
 
 
363 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0602957 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3393  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  47.53 
 
 
372 aa  208  7e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2173  chromosome partitioning ATPase  41.43 
 
 
302 aa  208  8e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000394872 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2027  Mrp protein  46.88 
 
 
285 aa  208  8e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.251832 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4146  ParA family protein  44.26 
 
 
364 aa  208  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1163  putative iron sulfur binding protein  44.69 
 
 
365 aa  208  9e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0126108  normal  0.565689 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0859  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.78 
 
 
363 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000753537  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3830  hypothetical protein  46.22 
 
 
363 aa  207  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.358406  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19290  small P-loop ATPase  46.29 
 
 
364 aa  207  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3327  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  47.98 
 
 
415 aa  207  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0721864  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2482  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.33 
 
 
363 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1234  hypothetical protein  44.25 
 
 
370 aa  207  1e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2357  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.36 
 
 
298 aa  207  1e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2457  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  42.8 
 
 
371 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000583453  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1213  putative ATP-binding protein  45.33 
 
 
362 aa  206  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>