More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2518 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2518  nucleotide-binding protein  100 
 
 
276 aa  557  1e-158  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00750762  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1985  nucleotide-binding protein  62.68 
 
 
282 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3017  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  59.69 
 
 
439 aa  328  7e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000106278  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0628  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  57.25 
 
 
419 aa  299  4e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0599345  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2286  chromosome partitioning ATPase  58.87 
 
 
262 aa  291  8e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.119117  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1654  nucleotide-binding protein  52.22 
 
 
279 aa  286  2e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0329038  hitchhiker  0.00690979 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2227  ATP-binding protein  53.09 
 
 
280 aa  284  9e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.14194 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1232  hypothetical protein  52.09 
 
 
277 aa  280  2e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000427617  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1328  ATPase-like, ParA/MinD  50.19 
 
 
302 aa  277  1e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04680  chromosome partitioning ATPase  52.55 
 
 
284 aa  271  7e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0264  chromosome partitioning ATPase  49 
 
 
328 aa  268  1e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08340  chromosome partitioning ATPase  53.28 
 
 
276 aa  266  2e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.16254 
 
 
-
 
NC_002936  DET0104  hypothetical protein  45.09 
 
 
328 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000677137  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1525  ATP-binding protein  54.51 
 
 
269 aa  265  5e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.486676  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0660  nucleotide-binding protein  51.69 
 
 
281 aa  264  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000522627  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0091  hypothetical protein  47.79 
 
 
304 aa  261  6.999999999999999e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3049  Mrp protein  48.3 
 
 
281 aa  260  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.753797  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1211  nucleotide-binding protein  48.36 
 
 
279 aa  258  8e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000175962  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_114  hydrogenase 1 maturation protease-like protein  48.98 
 
 
328 aa  251  1e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0394  polysaccharide export protein  50.19 
 
 
277 aa  237  2e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2835  ATPase  45.34 
 
 
284 aa  224  1e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2521  Mrp protein  44.94 
 
 
284 aa  222  4.9999999999999996e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0943  ATP-binding protein  50.22 
 
 
282 aa  221  8e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0663  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  46.52 
 
 
298 aa  218  6e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0533  Mrp protein  44.05 
 
 
272 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2037  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.49 
 
 
358 aa  206  3e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000910104  hitchhiker  0.00000144662 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2173  chromosome partitioning ATPase  41.42 
 
 
302 aa  205  7e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000394872 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1814  protein of unknown function DUF59  44.03 
 
 
363 aa  204  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0920101  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1234  hypothetical protein  40.08 
 
 
370 aa  203  3e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.81 
 
 
287 aa  202  5e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41 
 
 
289 aa  202  6e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.388921  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1343  Mrp protein  41.74 
 
 
347 aa  202  7e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.654252  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0634  chromosome partitioning ATPase protein  43.86 
 
 
280 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.556056  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2492  protein of unknown function DUF59  39.92 
 
 
364 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0134384  normal  0.291391 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0908  MRP protein-like  42.11 
 
 
291 aa  199  3e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.382595  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01241  hypothetical protein  38.71 
 
 
285 aa  198  7.999999999999999e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1296  Mrp protein  44.3 
 
 
359 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.27319  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0872  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.54 
 
 
289 aa  196  3e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.439579  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2014  hypothetical protein  44.44 
 
 
357 aa  196  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000063714  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0041  hypothetical protein  38.04 
 
 
304 aa  196  3e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0118047 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1946  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.36 
 
 
288 aa  196  5.000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2615  chromosome partitioning ATPase protein  41.67 
 
 
280 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  43.86 
 
 
305 aa  195  9e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.491623  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0044  hypothetical protein  40.4 
 
 
308 aa  194  1e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2141  chromosome partitioning ATPase protein  40.08 
 
 
278 aa  194  1e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  38.49 
 
 
379 aa  194  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1731  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.67 
 
 
289 aa  193  2e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.826727 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1929  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.48 
 
 
295 aa  194  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.72469  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1084  hypothetical protein  38.1 
 
 
307 aa  193  3e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.352642  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0420  protein of unknown function DUF59  42.92 
 
 
360 aa  192  4e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0587708  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19290  small P-loop ATPase  39.36 
 
 
364 aa  192  6e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0180  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.67 
 
 
289 aa  191  9e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2621  hypothetical protein  41.78 
 
 
363 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0268  ATP-binding protein  41.59 
 
 
284 aa  191  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.54861  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  37.35 
 
 
363 aa  190  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  41.96 
 
 
395 aa  190  2e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1042  putative ATP-binding protein  41.33 
 
 
374 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.261199  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1045  hypothetical protein  38.89 
 
 
364 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.232996  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1127  hypothetical protein  39.45 
 
 
364 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0907  ATP-binding protein  36.36 
 
 
293 aa  189  4e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.124437  normal  0.543626 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1360  hypothetical protein  39.82 
 
 
365 aa  189  4e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2138  hypothetical protein  38.8 
 
 
306 aa  189  5e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.44 
 
 
348 aa  189  5e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1282  ATP-binding protein  36.82 
 
 
297 aa  189  5e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.240384  normal  0.0376424 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1718  hypothetical protein  40.97 
 
 
310 aa  189  5e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2357  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.02 
 
 
298 aa  188  7e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4314  hypothetical protein  38.91 
 
 
364 aa  188  8e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1098  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  38.91 
 
 
364 aa  188  9e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285598  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0267  hypothetical protein  40.16 
 
 
288 aa  188  9e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.950713  normal  0.311122 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2109  hypothetical protein  35.53 
 
 
367 aa  187  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0874248  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1138  hypothetical protein  38.91 
 
 
364 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.192644  normal  0.84977 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1408  ParA family protein  37.45 
 
 
295 aa  187  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.738873  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4506  ParA family protein  39.22 
 
 
364 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000372356 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0731  hypothetical protein  39.46 
 
 
290 aa  187  2e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0337  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.31 
 
 
300 aa  187  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  unclonable  0.0000000110722  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2145  MRP protein-like protein  38.5 
 
 
382 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2587  protein of unknown function DUF59  41.59 
 
 
351 aa  186  3e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600696  normal  0.426631 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03090  NBP35, putative  40.7 
 
 
336 aa  186  3e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.820324  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0920  hypothetical protein  40.36 
 
 
362 aa  186  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1064  hypothetical protein  40.36 
 
 
362 aa  186  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.626095  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1557  hypothetical protein  39.66 
 
 
362 aa  186  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3885  ParA family protein  41.03 
 
 
364 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2767  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.22 
 
 
362 aa  186  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1406  hypothetical protein  40.85 
 
 
362 aa  185  6e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.295791  normal  0.937662 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3271  hypothetical protein  38.6 
 
 
357 aa  185  6e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1760  hypothetical protein  37.7 
 
 
367 aa  185  7e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224371  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2189  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.11 
 
 
362 aa  185  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00291769  normal  0.27131 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2115  ParA family protein  39.65 
 
 
286 aa  185  7e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3613  ParA family protein  36.69 
 
 
292 aa  185  7e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0375479 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0052  mrP protein  38.56 
 
 
361 aa  184  9e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1967  ATP-binding protein  36.33 
 
 
297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.847936 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1469  cytochrome c oxidase, heme b and copper-binding subunit, membrane-bound  42.48 
 
 
366 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0634786  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1978  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  39.74 
 
 
371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000194849  hitchhiker  0.00590431 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  38.22 
 
 
363 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1966  hypothetical protein  40.72 
 
 
362 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0395  Mrp/NBP35 family protein  37.99 
 
 
354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.616395  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0411  Mrp protein  42.48 
 
 
358 aa  183  2.0000000000000003e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.169995  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2379  MRP family ATP-binding protein  38.67 
 
 
362 aa  183  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.384277  hitchhiker  0.0044393 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2027  Mrp protein  38.37 
 
 
285 aa  183  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.251832 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  38.17 
 
 
357 aa  183  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>