More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0104 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0104  hypothetical protein  100 
 
 
328 aa  655    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000677137  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0264  chromosome partitioning ATPase  87.5 
 
 
328 aa  585  1e-166  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_114  hydrogenase 1 maturation protease-like protein  86.59 
 
 
328 aa  553  1e-156  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3049  Mrp protein  49.59 
 
 
281 aa  270  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.753797  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1654  nucleotide-binding protein  54.81 
 
 
279 aa  268  5.9999999999999995e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0329038  hitchhiker  0.00690979 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1232  hypothetical protein  52.26 
 
 
277 aa  268  7e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000427617  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0091  hypothetical protein  55.17 
 
 
304 aa  268  8.999999999999999e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2518  nucleotide-binding protein  45.09 
 
 
276 aa  266  4e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00750762  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2286  chromosome partitioning ATPase  50.4 
 
 
262 aa  263  2e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.119117  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1985  nucleotide-binding protein  47.93 
 
 
282 aa  258  9e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1328  ATPase-like, ParA/MinD  49.8 
 
 
302 aa  255  6e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3017  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  45.24 
 
 
439 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000106278  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1211  nucleotide-binding protein  48.94 
 
 
279 aa  245  6.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000175962  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0628  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  51.24 
 
 
419 aa  243  5e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0599345  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0660  nucleotide-binding protein  48.95 
 
 
281 aa  236  4e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000522627  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2835  ATPase  44.84 
 
 
284 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04680  chromosome partitioning ATPase  48.15 
 
 
284 aa  224  2e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2521  Mrp protein  44.05 
 
 
284 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08340  chromosome partitioning ATPase  48.31 
 
 
276 aa  221  9.999999999999999e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.16254 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1525  ATP-binding protein  42.31 
 
 
269 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.486676  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17011  MRP-like protein  38.56 
 
 
357 aa  218  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.995649 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3344  ATPase-like, ParA/MinD  37.7 
 
 
358 aa  218  1e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.312419  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0943  ATP-binding protein  45 
 
 
282 aa  218  2e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2227  ATP-binding protein  45.02 
 
 
280 aa  217  2e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.14194 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2587  protein of unknown function DUF59  37.34 
 
 
351 aa  212  9e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600696  normal  0.426631 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1575  ATPase-like, ParA/MinD  36.42 
 
 
358 aa  210  3e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0872  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.53 
 
 
289 aa  209  4e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.439579  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1731  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.31 
 
 
289 aa  209  5e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.826727 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1831  protein of unknown function DUF59  38.66 
 
 
345 aa  209  7e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.203374  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0180  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.26 
 
 
289 aa  207  1e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0533  Mrp protein  42.04 
 
 
272 aa  208  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.57 
 
 
287 aa  207  1e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.25 
 
 
348 aa  207  3e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1565  protein of unknown function DUF59  36.89 
 
 
354 aa  205  1e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.226796  normal  0.517405 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0968  protein of unknown function DUF59  36.74 
 
 
371 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0394  polysaccharide export protein  47.92 
 
 
277 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.5 
 
 
289 aa  198  7.999999999999999e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.388921  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2325  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.11 
 
 
367 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1590  chromosome partitioning ATPase  36.45 
 
 
347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1296  Mrp protein  35.87 
 
 
359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.27319  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20271  hypothetical protein  35.09 
 
 
367 aa  196  3e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0663  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  43.23 
 
 
298 aa  196  3e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1153  ATPase  35.09 
 
 
361 aa  196  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0337  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.2 
 
 
300 aa  195  8.000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  unclonable  0.0000000110722  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1105  MRP protein-like  36.25 
 
 
361 aa  195  9e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4935  protein of unknown function DUF59  46.72 
 
 
368 aa  194  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716392  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2027  Mrp protein  42.86 
 
 
285 aa  195  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.251832 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2141  chromosome partitioning ATPase protein  43.1 
 
 
278 aa  194  1e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0508  chromosome partitioning ATPase protein  41.15 
 
 
390 aa  194  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1929  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.42 
 
 
295 aa  194  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.72469  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44 
 
 
270 aa  193  3e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.677394  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4074  hypothetical protein  35.05 
 
 
336 aa  193  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2597  protein of unknown function DUF59  35.11 
 
 
356 aa  192  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0491781 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0634  chromosome partitioning ATPase protein  43.23 
 
 
280 aa  192  5e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.556056  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2357  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.98 
 
 
298 aa  192  7e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0268  ATP-binding protein  44.64 
 
 
284 aa  192  8e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.54861  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7302  MRP protein-like protein  36.14 
 
 
374 aa  192  9e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145804  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0621  Mrp protein  43.97 
 
 
301 aa  192  9e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1282  ATP-binding protein  42.6 
 
 
297 aa  191  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.240384  normal  0.0376424 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2037  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.36 
 
 
358 aa  191  2e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000910104  hitchhiker  0.00000144662 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2173  chromosome partitioning ATPase  42.04 
 
 
302 aa  190  2.9999999999999997e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000394872 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1472  chromosome partitioning ATPase protein  40.08 
 
 
394 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.95165  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0926  Mrp/Nbp35 family ATP-binding protein  34.01 
 
 
367 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0267061 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2014  hypothetical protein  43.67 
 
 
357 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000063714  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  36.07 
 
 
359 aa  189  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  43.04 
 
 
305 aa  189  4e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.491623  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22681  hypothetical protein  35.74 
 
 
358 aa  189  5e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.371256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2226  protein of unknown function DUF59  34.77 
 
 
365 aa  189  5.999999999999999e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.934574  normal  0.117815 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1234  hypothetical protein  42.99 
 
 
370 aa  189  5.999999999999999e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5982  MRP protein-like protein  35.24 
 
 
374 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141343  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01241  hypothetical protein  43.3 
 
 
285 aa  188  9e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1927  MRP protein-like  34.34 
 
 
360 aa  188  9e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2615  chromosome partitioning ATPase protein  40.68 
 
 
280 aa  188  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  45.78 
 
 
395 aa  188  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2145  MRP protein-like protein  44.84 
 
 
382 aa  188  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1287  hypothetical protein  37.42 
 
 
391 aa  188  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.404261  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1165  hypothetical protein  37.67 
 
 
356 aa  187  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258705 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1110  ATPase-like, ParA/MinD  35.8 
 
 
367 aa  188  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.559665 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0420  protein of unknown function DUF59  44.95 
 
 
360 aa  187  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0587708  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1138  hypothetical protein  43.36 
 
 
368 aa  187  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4583  hypothetical protein  37.03 
 
 
356 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0046  protein of unknown function DUF59  36.42 
 
 
368 aa  187  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0267  hypothetical protein  42.67 
 
 
288 aa  187  2e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.950713  normal  0.311122 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0907  ATP-binding protein  41.74 
 
 
293 aa  187  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.124437  normal  0.543626 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1045  hypothetical protein  35.63 
 
 
364 aa  187  2e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.232996  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0745  MRP family ATPase  38.26 
 
 
285 aa  187  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0731  hypothetical protein  42.06 
 
 
290 aa  187  3e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2935  hypothetical protein  44.09 
 
 
377 aa  187  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  36.33 
 
 
353 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1967  ATP-binding protein  42.24 
 
 
297 aa  186  4e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.847936 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1343  Mrp protein  34.16 
 
 
347 aa  186  4e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.654252  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0908  MRP protein-like  43.36 
 
 
291 aa  186  4e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.382595  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0402  MRP protein-like  34.24 
 
 
358 aa  186  5e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.78996 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  37 
 
 
353 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00760  hypothetical protein  39.62 
 
 
376 aa  186  6e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.161739  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1044  Mrp/Nbp35 family ATP-binding protein  34.8 
 
 
373 aa  186  6e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3055  protein of unknown function DUF59  35.56 
 
 
353 aa  186  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2066  MRP ATP/GTP-binding protein  41.26 
 
 
373 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0228594  normal  0.0543779 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1814  protein of unknown function DUF59  42.67 
 
 
363 aa  186  7e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0920101  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1946  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.37 
 
 
288 aa  185  9e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>