More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0943 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0943  ATP-binding protein  100 
 
 		 282 aa  575  1.0000000000000001e-163  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1985  nucleotide-binding protein  53.11 
 
 		 282 aa  268  5e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2286  chromosome partitioning ATPase  51.54 
 
 		 262 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.119117  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1654  nucleotide-binding protein  52.36 
 
 		 279 aa  261  1e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0329038  hitchhiker  0.00690979 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1232  hypothetical protein  54.04 
 
 		 277 aa  255  4e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000427617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0091  hypothetical protein  50.65 
 
 		 304 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3049  Mrp protein  53.65 
 
 		 281 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.753797  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1328  ATPase-like, ParA/MinD  52.68 
 
 		 302 aa  253  3e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1211  nucleotide-binding protein  54.39 
 
 		 279 aa  249  2e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000175962  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3017  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  51.32 
 
 		 439 aa  249  4e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000106278  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0660  nucleotide-binding protein  49.43 
 
 		 281 aa  248  9e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000522627  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2518  nucleotide-binding protein  50.22 
 
 		 276 aa  245  6e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00750762  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0104  hypothetical protein  45.17 
 
 		 328 aa  241  7.999999999999999e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000677137  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2227  ATP-binding protein  53.36 
 
 		 280 aa  239  4e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.14194 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0264  chromosome partitioning ATPase  49.12 
 
 		 328 aa  238  5.999999999999999e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0628  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  54.91 
 
 		 419 aa  237  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0599345  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2835  ATPase  48.33 
 
 		 284 aa  236  4e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2521  Mrp protein  48.33 
 
 		 284 aa  235  7e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04680  chromosome partitioning ATPase  49.61 
 
 		 284 aa  232  7.000000000000001e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_114  hydrogenase 1 maturation protease-like protein  46.69 
 
 		 328 aa  228  1e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0663  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  46.09 
 
 		 298 aa  222  4.9999999999999996e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1525  ATP-binding protein  47.62 
 
 		 269 aa  218  8.999999999999998e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.486676  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0394  polysaccharide export protein  49.14 
 
 		 277 aa  217  1e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.95 
 
 		 287 aa  214  9e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08340  chromosome partitioning ATPase  49.58 
 
 		 276 aa  211  1e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.16254 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0267  hypothetical protein  48.89 
 
 		 288 aa  211  1e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.950713  normal  0.311122 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2141  chromosome partitioning ATPase protein  41.5 
 
 		 278 aa  209  3e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0731  hypothetical protein  45.61 
 
 		 290 aa  206  3e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0533  Mrp protein  43.17 
 
 		 272 aa  205  8e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1343  Mrp protein  41.57 
 
 		 347 aa  205  9e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.654252  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1731  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.98 
 
 		 289 aa  204  1e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.826727 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.17 
 
 		 289 aa  204  1e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.388921  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2027  Mrp protein  44.87 
 
 		 285 aa  204  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.251832 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.07 
 
 		 408 aa  203  2e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0872  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.98 
 
 		 289 aa  204  2e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.439579  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1426  ATP-binding protein  41.54 
 
 		 408 aa  202  6e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.904021  normal  0.20108 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0180  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.1 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1234  hypothetical protein  42.33 
 
 		 370 aa  199  3e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1967  ATP-binding protein  43.95 
 
 		 297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.847936 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1282  ATP-binding protein  43.5 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.240384  normal  0.0376424 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0968  protein of unknown function DUF59  45.5 
 
 		 371 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1702  chromosome partitioning ATPase  40.31 
 
 		 428 aa  196  3e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.05 
 
 		 270 aa  194  2e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.677394  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  44.84 
 
 		 358 aa  193  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  44.84 
 
 		 358 aa  193  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01241  hypothetical protein  43.42 
 
 		 285 aa  193  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3885  ParA family protein  41.77 
 
 		 364 aa  192  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0907  ATP-binding protein  43.95 
 
 		 293 aa  192  6e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.124437  normal  0.543626 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4146  ParA family protein  44.69 
 
 		 364 aa  192  8e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2014  hypothetical protein  46.67 
 
 		 357 aa  191  8e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000063714  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1814  protein of unknown function DUF59  42.15 
 
 		 363 aa  191  1e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0920101  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  45.74 
 
 		 364 aa  190  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2510  hypothetical protein  45.78 
 
 		 360 aa  190  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3613  ParA family protein  42.17 
 
 		 292 aa  190  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0375479 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2115  ParA family protein  44.03 
 
 		 286 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0337  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.56 
 
 		 300 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  unclonable  0.0000000110722  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1127  hypothetical protein  43.78 
 
 		 364 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1406  hypothetical protein  42.91 
 
 		 362 aa  189  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.295791  normal  0.937662 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2357  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.56 
 
 		 298 aa  189  4e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0420  protein of unknown function DUF59  43.69 
 
 		 360 aa  189  5e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0587708  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2838  putative mrp protein  42.67 
 
 		 391 aa  188  8e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0284462  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1360  hypothetical protein  42.98 
 
 		 365 aa  187  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4506  ParA family protein  42.06 
 
 		 364 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000372356 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3393  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  44.39 
 
 		 372 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1296  Mrp protein  42.54 
 
 		 359 aa  187  2e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.27319  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4314  hypothetical protein  42.97 
 
 		 364 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  44.59 
 
 		 363 aa  186  3e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1138  hypothetical protein  42.97 
 
 		 364 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.192644  normal  0.84977 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  45.09 
 
 		 357 aa  186  3e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0634  chromosome partitioning ATPase protein  40 
 
 		 280 aa  186  5e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.556056  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1098  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  42.57 
 
 		 364 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0621  Mrp protein  42.15 
 
 		 301 aa  185  7e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1045  hypothetical protein  43.59 
 
 		 364 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.232996  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0268  ATP-binding protein  42.22 
 
 		 284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.54861  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2109  hypothetical protein  43.33 
 
 		 367 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0874248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1215  chromosome partitioning ATPase protein  41.56 
 
 		 379 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.747251 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2173  chromosome partitioning ATPase  40.16 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000394872 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  44.49 
 
 		 305 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.491623  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1472  chromosome partitioning ATPase protein  40.91 
 
 		 394 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.95165  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2245  ATP-binding protein, Mrp/Nbp35 family protein  42.92 
 
 		 371 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.615288  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1105  MRP protein-like  42.73 
 
 		 361 aa  183  3e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0395  Mrp/NBP35 family protein  40.25 
 
 		 354 aa  183  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.616395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8411  hypothetical protein  38.87 
 
 		 380 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1138  hypothetical protein  44.14 
 
 		 368 aa  182  4.0000000000000006e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2048  MRP ATP/GTP-binding protein  43.69 
 
 		 372 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19290  small P-loop ATPase  45.54 
 
 		 364 aa  182  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1929  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.84 
 
 		 295 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.72469  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.89 
 
 		 348 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2410  chromosome partitioning ATPase  42.86 
 
 		 360 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3271  hypothetical protein  40.36 
 
 		 357 aa  182  6e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  42.34 
 
 		 395 aa  182  7e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1042  putative ATP-binding protein  41.89 
 
 		 374 aa  182  7e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.261199  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  40.99 
 
 		 363 aa  181  9.000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1760  hypothetical protein  43.48 
 
 		 367 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1645  hypothetical protein  41.2 
 
 		 364 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2055  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  40.62 
 
 		 376 aa  181  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19065  hypothetical protein  41.6 
 
 		 364 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0441543 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0972  hypothetical protein  42.02 
 
 		 365 aa  180  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.642546  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2457  hypothetical protein  41.74 
 
 		 382 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12568 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3481  putative ATP-binding protein  39.51 
 
 		 362 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00831009  normal  0.84949 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>