More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4892 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_4892  hypothetical protein  100 
 
 		 564 aa  1155    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0498261  normal  0.117948 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5061  hypothetical protein  59.45 
 
 		 562 aa  628  1e-179  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2389  hypothetical protein  57.46 
 
 		 557 aa  613  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4124  hypothetical protein  40.84 
 
 		 559 aa  413  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000171711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4076  hypothetical protein  33.16 
 
 		 578 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165251  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3284  hypothetical protein  33.96 
 
 		 554 aa  270  4e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3769  hypothetical protein  32.81 
 
 		 564 aa  258  3e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1006  hypothetical protein  32.77 
 
 		 543 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0451  hypothetical protein  33.39 
 
 		 617 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2333  monooxygenase FAD-binding  31.7 
 
 		 536 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.307173 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1929  monooxygenase, FAD-binding  30.35 
 
 		 619 aa  220  6e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.132935  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4564  monooxygenase FAD-binding  29.36 
 
 		 598 aa  213  5.999999999999999e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.669744 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08410  FAD-dependent monooxygenase (Eurofung)  29.73 
 
 		 624 aa  202  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29830  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  30.98 
 
 		 543 aa  199  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.832343 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4406  monooxygenase, FAD-binding  29.31 
 
 		 597 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.814419  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3219  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  28.22 
 
 		 545 aa  194  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3518  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  28.6 
 
 		 539 aa  192  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054521  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4156  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  31.62 
 
 		 541 aa  189  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  0.0299299 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0227  monooxygenase FAD-binding  29.51 
 
 		 596 aa  188  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1463  monooxygenase FAD-binding  28.62 
 
 		 598 aa  187  6e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6470  monooxygenase, FAD-binding  29.38 
 
 		 586 aa  187  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.71496  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3271  PheA/TfdB family polyketide hydroxylase  29.14 
 
 		 544 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.654558  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3504  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  29.76 
 
 		 539 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2460  monooxygenase FAD-binding  29.09 
 
 		 595 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3304  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  28.35 
 
 		 544 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3045  monooxygenase, FAD-binding  29.25 
 
 		 600 aa  184  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000523244  unclonable  0.000000929922 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3564  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  28.35 
 
 		 539 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.89711  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3793  monooxygenase, FAD-binding  31.05 
 
 		 524 aa  183  6e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.791839  normal  0.0125936 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3220  monooxygenase FAD-binding  28.55 
 
 		 539 aa  182  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.238017  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3520  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  28.17 
 
 		 539 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1744  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  29.45 
 
 		 539 aa  182  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.572505 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3526  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  29.53 
 
 		 539 aa  180  7e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6338  monooxygenase FAD-binding  31.01 
 
 		 504 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4679  monooxygenase, FAD-binding  27.24 
 
 		 592 aa  177  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0600734  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2185  monooxygenase, FAD-binding  28.64 
 
 		 590 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5534  monooxygenase FAD-binding  27.96 
 
 		 584 aa  172  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.105639  hitchhiker  0.00000473423 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0899  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase  28.55 
 
 		 586 aa  171  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.67308e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5592  monooxygenase FAD-binding protein  30.92 
 
 		 524 aa  169  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0339  monooxygenase, FAD-binding  31.17 
 
 		 534 aa  168  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0305956  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0848  hypothetical protein  28.39 
 
 		 511 aa  164  3e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.970878  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4181  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  28.99 
 
 		 531 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1083  monooxygenase FAD-binding  29.91 
 
 		 523 aa  161  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4588  monooxygenase FAD-binding  29.33 
 
 		 555 aa  159  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6462  monooxygenase, FAD-binding  28.11 
 
 		 598 aa  155  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3894  monooxygenase FAD-binding  28.2 
 
 		 540 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0436183  normal  0.0134982 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09029  FAD dependent oxidoreductase, putative (JCVI)  27.39 
 
 		 579 aa  154  4e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0131  2,4-dichlorophenol 6-monooxygenase  31.04 
 
 		 556 aa  154  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0320392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7059  monooxygenase FAD-binding  30.81 
 
 		 512 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.120859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2986  monooxygenase FAD-binding  28.54 
 
 		 611 aa  149  9e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87314  predicted protein  32.23 
 
 		 606 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.002805 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7439  2,4-dichlorophenol hydroxylase  27.29 
 
 		 585 aa  146  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  33.16 
 
 		 481 aa  145  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05044  conserved hypothetical protein  25.85 
 
 		 619 aa  142  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.163159 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07251  conserved hypothetical protein  27.27 
 
 		 581 aa  138  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.261689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  30.61 
 
 		 506 aa  134  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  30.85 
 
 		 505 aa  134  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  32.51 
 
 		 529 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6165  monooxygenase FAD-binding protein  28.7 
 
 		 520 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  33.08 
 
 		 498 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  28.8 
 
 		 537 aa  131  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  28.8 
 
 		 537 aa  131  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  28.8 
 
 		 537 aa  131  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  31.62 
 
 		 553 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  30.35 
 
 		 518 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  29.56 
 
 		 493 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1650  hypothetical protein  29.97 
 
 		 502 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  27.91 
 
 		 537 aa  127  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  27.57 
 
 		 511 aa  127  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2298  monooxygenase, FAD-binding  25.96 
 
 		 580 aa  127  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0352446  hitchhiker  0.0088842 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1624  hypothetical protein  29.2 
 
 		 502 aa  127  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.459087  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3372  monooxygenase FAD-binding protein  31.38 
 
 		 553 aa  127  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1717  hypothetical protein  29.2 
 
 		 502 aa  126  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.587948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  30.71 
 
 		 477 aa  126  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.36 
 
 		 552 aa  126  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3750  monooxygenase, FAD-binding  31.2 
 
 		 511 aa  126  9e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0581872  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1658  hypothetical protein  28.94 
 
 		 502 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  31.82 
 
 		 546 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  29.13 
 
 		 486 aa  125  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2111  monooxygenase, FAD-binding  31.54 
 
 		 511 aa  124  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.0054618  normal  0.499354 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  28.68 
 
 		 486 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3790  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.42 
 
 		 568 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3786  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.3 
 
 		 573 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3859  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.3 
 
 		 573 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  28.61 
 
 		 503 aa  121  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 541 aa  121  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  28.85 
 
 		 566 aa  120  4.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  28.24 
 
 		 475 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  29.66 
 
 		 506 aa  120  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  27.46 
 
 		 511 aa  120  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0725  monooxygenase FAD-binding  28 
 
 		 571 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490959  normal  0.227588 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  29.02 
 
 		 561 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0579  FAD-dependent oxidoreductase  27.68 
 
 		 558 aa  117  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2690  monooxygenase FAD-binding protein  26.41 
 
 		 519 aa  117  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0584184 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2401  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.45 
 
 		 569 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1656  hypothetical protein  30.51 
 
 		 508 aa  117  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.652016  normal  0.325297 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0623  monooxygenase FAD-binding  25.63 
 
 		 533 aa  116  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  30 
 
 		 488 aa  116  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4404  monooxygenase FAD-binding  28.46 
 
 		 565 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9228  hypothetical protein  31.48 
 
 		 504 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  26.92 
 
 		 559 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.135002 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>