More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3740 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3740  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 124 aa  247  5e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  51.09 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  51.09 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  50.57 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  50.57 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  48.91 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  55.71 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0892  ArsR family transcriptional regulator  54.67 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1791  ArsR family transcriptional regulator  50.63 
 
 		 96 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  43.86 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2068  ArsR family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.887596  normal  0.21575 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0944  ArsR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  50.57 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  51.16 
 
 		 116 aa  73.9  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  42.11 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  50 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  49.37 
 
 		 119 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3459  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  47.19 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0920  transcriptional regulator HlyU  46.34 
 
 		 98 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000331953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  55.84 
 
 		 94 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3751  transcriptional regulator, ArsR family  44.32 
 
 		 110 aa  70.1  0.000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  45.78 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  42.05 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  51.52 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  43.9 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2014  transcriptional regulator, ArsR family  43.9 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2699  transcriptional regulator, ArsR family  49.35 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  52.33 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1190  ArsR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00010661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1079  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 104 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3239  transcriptional regulator, ArsR family  45.12 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00078895  normal  0.52452 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3538  transcriptional regulator HlyU  45.12 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1151  ArsR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000355977  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1055  regulatory protein, ArsR  45.12 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584265  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1117  regulatory protein ArsR  45.12 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000362609  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1050  regulatory protein, ArsR  45.12 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000242354  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2961  ArsR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000318119  normal  0.703465 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3043  ArsR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000176438  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1095  ArsR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000620503  normal  0.070685 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3141  ArsR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177762  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  48.19 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1287  ArsR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 98 aa  67  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000165957  normal  0.329148 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3666  ArsR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2894  transcriptional regulator, ArsR family protein  42.68 
 
 		 98 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0578791  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3929  transcriptional regulator, ArsR family  52.24 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0854  regulatory protein, ArsR  52.11 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229848 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1306  ArsR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.680406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0793  regulatory protein, ArsR  46.75 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0205  ArsR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2570  transcriptional regulator, ArsR family  50.68 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1085  ArsR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0694077  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2727  regulatory protein, ArsR  41.46 
 
 		 98 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000369896  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1527  regulatory protein ArsR  54.29 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1540  transcriptional regulator, ArsR family  36.56 
 
 		 105 aa  63.5  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3640  transcriptional regulator, ArsR family  50.75 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2812  transcriptional regulator  40 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.158239 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1937  ArsR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004423  transcriptional activator HlyU  41.86 
 
 		 100 aa  62.4  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000188739  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5676  ArsR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  38.46 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0357  transcriptional regulator, ArsR family  39.58 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.175794 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1900  ArsR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428282  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0445  ArsR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0202  ArsR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0937  ArsR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 227 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0359  ArsR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1814  ArsR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.978602  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1404  ArsR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 93 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1683  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2105  ArsR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  41.03 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1182  regulatory protein, ArsR  45.88 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  50 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5186  transcriptional regulator, ArsR family  46.48 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251574  normal  0.286102 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  38.68 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4967  transcriptional regulator, ArsR family  41.76 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00976  hypothetical protein  45.59 
 
 		 101 aa  60.1  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1884  ArsR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172075 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  38.38 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0210  transcriptional activator HlyU  42.86 
 
 		 85 aa  59.7  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000976206  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1286  transcriptional regulator, ArsR family  46.38 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4255  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  32.99 
 
 		 106 aa  60.1  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0970362 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2606  ArsR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000101  transcriptional regulator ArsR family  35.42 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344497  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0576  transcriptional activator HlyU  42.68 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000103894  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3560  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.35 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1264  regulatory protein, ArsR  48.48 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  47.95 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  44.78 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4321  ArsR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1421  regulatory protein, ArsR  36.56 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3922  hypothetical protein  45 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.63414  normal  0.473928 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>