155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1026 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1026  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 199 aa  411  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591967 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  31.67 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  23.77 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  26.79 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  30 
 
 		 163 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3376  alkylhydroperoxidase  32.35 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4008  hypothetical protein  27.91 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  29.73 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  29.73 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1903  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.17 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2411  alkylhydroperoxidase  22.95 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  31.48 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1900  carboxymuconolactone decarboxylase  30.5 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.429889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1211  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.71 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501081  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1900  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.71 
 
 		 150 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1369  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.71 
 
 		 150 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1098  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.04 
 
 		 152 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.574019 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1057  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.71 
 
 		 150 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0811  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.71 
 
 		 150 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1219  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.71 
 
 		 150 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  29.27 
 
 		 145 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.68 
 
 		 180 aa  53.9  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0996  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.97 
 
 		 283 aa  53.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.353647  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.97 
 
 		 153 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0021  alkylhydroperoxidase  31.86 
 
 		 157 aa  53.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.19 
 
 		 159 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  26.97 
 
 		 145 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30 
 
 		 155 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0022  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.43 
 
 		 156 aa  52  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  29.57 
 
 		 152 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.22 
 
 		 159 aa  51.6  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  23.13 
 
 		 159 aa  51.6  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  28.04 
 
 		 157 aa  51.2  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.2 
 
 		 153 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.42 
 
 		 153 aa  51.2  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.42 
 
 		 145 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1874  alkylhydroperoxidase  28.7 
 
 		 149 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  23.03 
 
 		 159 aa  50.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5624  alkylhydroperoxidase  27.59 
 
 		 167 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  26.05 
 
 		 159 aa  50.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0598  putative carboxymuconolactone decarboxylase  28.74 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.17953  normal  0.124387 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  27.1 
 
 		 145 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.27 
 
 		 159 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2104  alkylhydroperoxidase  28.7 
 
 		 149 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  27.27 
 
 		 159 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1913  alkylhydroperoxidase  26.85 
 
 		 149 aa  50.4  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.42 
 
 		 145 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3196  alkylhydroperoxidase  29.77 
 
 		 167 aa  50.1  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25 
 
 		 159 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  27.27 
 
 		 159 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3517  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.33 
 
 		 143 aa  49.7  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0891  carboxymuconolactone decarboxylase  26.82 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.911286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2015  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.85 
 
 		 149 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.419604  hitchhiker  0.00248557 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2657  hypothetical protein  25.95 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2331  alkylhydroperoxidase  26.85 
 
 		 149 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  31.19 
 
 		 143 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  25.47 
 
 		 145 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2448  alkylhydroperoxidase  26.85 
 
 		 149 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.19874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  24.77 
 
 		 152 aa  49.3  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5435  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  24.83 
 
 		 159 aa  48.9  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1929  alkylhydroperoxidase  27.78 
 
 		 149 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2501  alkylhydroperoxidase  28.93 
 
 		 140 aa  49.3  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2551  alkylhydroperoxidase  28.93 
 
 		 140 aa  49.3  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  24.79 
 
 		 163 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.27 
 
 		 150 aa  48.9  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  24.35 
 
 		 159 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2061  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.85 
 
 		 151 aa  48.9  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0013  alkylhydroperoxidase  27.52 
 
 		 158 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  26.17 
 
 		 145 aa  48.9  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  28.32 
 
 		 145 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0021  alkylhydroperoxidase  27.52 
 
 		 158 aa  48.5  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.106747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2331  alkylhydroperoxidase  26.85 
 
 		 149 aa  48.5  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.224128  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.01 
 
 		 143 aa  48.5  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.315709  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.17 
 
 		 145 aa  48.5  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0027  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.57 
 
 		 157 aa  48.5  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.456012 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  24.53 
 
 		 145 aa  48.1  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  26.17 
 
 		 145 aa  48.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  26.17 
 
 		 149 aa  48.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3108  alkylhydroperoxidase  31.25 
 
 		 159 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.45 
 
 		 159 aa  48.1  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  28.97 
 
 		 159 aa  48.1  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  27.59 
 
 		 154 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  28.21 
 
 		 170 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4099  alkylhydroperoxidase  25.83 
 
 		 157 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  25.23 
 
 		 145 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.17 
 
 		 145 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.46 
 
 		 154 aa  47  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  24.14 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  25.48 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  24.3 
 
 		 145 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  24.3 
 
 		 145 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  24.3 
 
 		 145 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.91 
 
 		 151 aa  47.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  29.91 
 
 		 151 aa  47  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  27.91 
 
 		 153 aa  46.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  24.14 
 
 		 163 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1184  alkylhydroperoxidase  28.32 
 
 		 154 aa  47  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000438605 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  26.17 
 
 		 145 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  24.3 
 
 		 158 aa  46.2  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  24.3 
 
 		 145 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>