More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0364 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0364  cytochrome P450  100 
 
 
413 aa  843    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0699807  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6889  cytochrome P450  58.27 
 
 
414 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2543  cytochrome P450  42.61 
 
 
405 aa  292  7e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2588  cytochrome P450  42.61 
 
 
405 aa  292  7e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.687766  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4150  cytochrome P450  40.56 
 
 
408 aa  279  5e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4339  cytochrome P450  41.09 
 
 
405 aa  277  3e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189726  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1782  cytochrome P450  40.73 
 
 
418 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1829  cytochrome P450  40.73 
 
 
418 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1764  cytochrome P450  40.73 
 
 
418 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124915  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2007  cytochrome P450  40.41 
 
 
404 aa  265  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0599  cytochrome P450  35.12 
 
 
425 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00925226  normal  0.145551 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1912  cytochrome P450  33.59 
 
 
426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.997168  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  37.63 
 
 
426 aa  200  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0631  cytochrome P450  31.92 
 
 
427 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0693761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5387  cytochrome P450  33.25 
 
 
418 aa  196  7e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.659302  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4706  cytochrome P450  32.94 
 
 
405 aa  190  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0622  cytochrome P450  36 
 
 
415 aa  182  8.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6307  cytochrome P450  32.51 
 
 
421 aa  179  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  32.51 
 
 
402 aa  175  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  32.64 
 
 
395 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  34.09 
 
 
399 aa  172  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  31.37 
 
 
402 aa  171  2e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  31.1 
 
 
402 aa  170  5e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  32.57 
 
 
417 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4343  cytochrome P450  32.33 
 
 
412 aa  166  9e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  34.14 
 
 
399 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1544  cytochrome P450  32.53 
 
 
418 aa  164  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  34.57 
 
 
395 aa  164  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4741  cytochrome P450  32.47 
 
 
413 aa  163  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  32.17 
 
 
398 aa  162  8.000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  33.24 
 
 
394 aa  162  8.000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  33 
 
 
398 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3446  cytochrome P450  33.03 
 
 
424 aa  162  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3656  cytochrome P450  34.19 
 
 
418 aa  161  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300661  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  32.34 
 
 
402 aa  161  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  32.24 
 
 
398 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_003296  RS01740  putative cytochrome P-450-like monooxygenase oxidoreductase protein  30.03 
 
 
398 aa  160  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  30.95 
 
 
388 aa  160  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  32.61 
 
 
400 aa  159  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  30.2 
 
 
412 aa  158  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1785  cytochrome P450  30.35 
 
 
405 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1766  cytochrome P450  30.35 
 
 
405 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333614  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1832  cytochrome P450  30.35 
 
 
405 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  31.43 
 
 
411 aa  158  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1892  cytochrome P450  29.85 
 
 
396 aa  158  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  32.43 
 
 
401 aa  157  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  32.38 
 
 
417 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3576  cytochrome P450  30.99 
 
 
439 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0425  cytochrome P450  32.18 
 
 
406 aa  157  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0314572  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5052  cytochrome P450  31.33 
 
 
416 aa  157  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.491584 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  30.57 
 
 
405 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2913  cytochrome P450  32.75 
 
 
396 aa  156  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1606  putative cytochrome P450  28.88 
 
 
418 aa  156  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  32.88 
 
 
420 aa  155  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3155  cytochrome P450  30.41 
 
 
422 aa  156  8e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.66527  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1796  cytochrome P450  32.05 
 
 
413 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.222543  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  30.03 
 
 
407 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1843  cytochrome P450  32.05 
 
 
413 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.491191  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  30.03 
 
 
407 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1777  cytochrome P450  32.05 
 
 
413 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  33.75 
 
 
411 aa  155  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  35.07 
 
 
412 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  34.48 
 
 
409 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  31.97 
 
 
418 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  35.17 
 
 
406 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  30.03 
 
 
407 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  34.48 
 
 
404 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1836  cytochrome P450  30.58 
 
 
399 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  36.72 
 
 
417 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1302  cytochrome P450  31.96 
 
 
420 aa  155  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0894605 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  32.45 
 
 
414 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3772  cytochrome P450  35.48 
 
 
418 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1580  cytochrome P450  33.77 
 
 
415 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0380124  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  32.49 
 
 
405 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  36.83 
 
 
410 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3631  cytochrome P450  31.25 
 
 
399 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  31.41 
 
 
410 aa  153  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4829  cytochrome P450  31.28 
 
 
435 aa  153  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.956879  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1010  cytochrome P450  29.85 
 
 
428 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1037  cytochrome P450  29.85 
 
 
416 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0986307  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1027  cytochrome P450  29.85 
 
 
416 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.810593 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  31.35 
 
 
404 aa  153  7e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  31.35 
 
 
404 aa  153  7e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1932  cytochrome P450  30.83 
 
 
399 aa  153  7e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525859  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3029  cytochrome P450  31.29 
 
 
433 aa  153  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.89024  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4175  cytochrome P450  31.22 
 
 
400 aa  152  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498623  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3596  ferredoxin  30.24 
 
 
782 aa  152  8.999999999999999e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1860  cytochrome P450  33.33 
 
 
459 aa  152  8.999999999999999e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  31.35 
 
 
404 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0813  cytochrome P450  33.12 
 
 
427 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  29.67 
 
 
401 aa  152  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2772  cytochrome P450  32.61 
 
 
427 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.434969  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1870  cytochrome P-450 hydroxylase  29.3 
 
 
400 aa  151  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2612  cytochrome P450  29.62 
 
 
408 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143454  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  31.58 
 
 
401 aa  151  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  31.58 
 
 
419 aa  151  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4029  cytochrome P450  32.15 
 
 
398 aa  151  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  32.62 
 
 
408 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2742  cytochrome P450  32.61 
 
 
427 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0172964  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  32.35 
 
 
412 aa  151  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>