215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_25470 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_25470  hemolysin A  100 
 
 
276 aa  537  9.999999999999999e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5441  hemolysin A  76.21 
 
 
268 aa  358  8e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2828  hemolysin A  65.22 
 
 
275 aa  335  7e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3012  hemolysin A  66.79 
 
 
265 aa  328  4e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2383  hemolysin A  63.31 
 
 
271 aa  313  1.9999999999999998e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4074  hemolysin A  63.27 
 
 
272 aa  310  2e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198624  normal  0.017914 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2013  hemolysin A  63.37 
 
 
269 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0478155 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3509  hemolysin A  60.87 
 
 
268 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0906767 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1902  hemolysin A  63.88 
 
 
281 aa  299  3e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.485461  hitchhiker  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6058  hemolysin A  60.93 
 
 
272 aa  297  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3290  hemolysin A  60.87 
 
 
269 aa  297  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2951  hemolysin A  59.42 
 
 
269 aa  296  2e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.781583  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2995  hemolysin A  59.42 
 
 
269 aa  296  2e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0689354  normal  0.521171 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2966  hemolysin A  59.42 
 
 
269 aa  296  2e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.173623 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11709  cytotoxin|haemolysin tlyA  57.45 
 
 
268 aa  292  5e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.198254  normal  0.144006 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2034  hemolysin A  60.79 
 
 
266 aa  291  8e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1911  hemolysin A  63.88 
 
 
281 aa  287  2e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.258384 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1751  hemolysin A  57.95 
 
 
329 aa  286  4e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00952938  hitchhiker  0.000670381 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4439  hemolysin A  61.54 
 
 
272 aa  285  5e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.114534  normal  0.104243 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3160  hemolysin A  62.5 
 
 
291 aa  284  9e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0320918  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5431  hemolysin A  64.13 
 
 
296 aa  281  9e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.390939 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2480  hemolysin A  64.92 
 
 
279 aa  278  5e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127708  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3027  hemolysin A  58.84 
 
 
266 aa  278  7e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2169  hemolysin A  60.36 
 
 
268 aa  264  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00065154  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3149  hemolysin A  58.33 
 
 
270 aa  254  9e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.074979  normal  0.927501 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2357  hemolysin A  54.61 
 
 
276 aa  242  3.9999999999999997e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347309  normal  0.0122275 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1515  hemolysin A  55.97 
 
 
271 aa  239  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000301327 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1247  hemolysin A  55.65 
 
 
267 aa  238  1e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.68471 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1516  hemolysin A  55.74 
 
 
270 aa  236  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.559805  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22150  hemolysin A  53.88 
 
 
318 aa  231  8.000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.324984  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1657  hemolysin A  58.92 
 
 
286 aa  229  5e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0477677  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1340  hemolysin A  54.98 
 
 
348 aa  210  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0901  hemolysin A  44.81 
 
 
269 aa  205  5e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000212028  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0956  hemolysin A  48.97 
 
 
277 aa  206  5e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2510  hemolysin A  43.27 
 
 
266 aa  204  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000179539  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04661  rRNA methyltransferase  46.77 
 
 
267 aa  202  6e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1028  hemolysin A  46.59 
 
 
274 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18631  rRNA methyltransferase  44.44 
 
 
264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.281535  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0994  hemolysin A  44.05 
 
 
264 aa  199  6e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.199053  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2072  hemolysin A  41.3 
 
 
271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.759279  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1786  hemolysin A  41.3 
 
 
271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.465576  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0476  hemolysin A  48.08 
 
 
281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.763875  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13650  predicted rRNA methylase  53.09 
 
 
281 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2200  hemolysin A  48.81 
 
 
268 aa  196  3e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0318  hemolysin A  48.39 
 
 
264 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.996063 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4423  hemolysin A  45.38 
 
 
266 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15831  rRNA methyltransferase  44.84 
 
 
271 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6777  hemolysin A  47.58 
 
 
282 aa  194  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1455  hemolysin A  49.42 
 
 
265 aa  194  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0732885  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0556  hemolysin A  47.24 
 
 
272 aa  194  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4361  hemolysin A  44.57 
 
 
266 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3711  hemolysin A  43.38 
 
 
270 aa  193  3e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3836  hemolysin A  40.96 
 
 
284 aa  192  4e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.63638 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0183  hemolysin A  39.26 
 
 
248 aa  191  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1693  hemolysin A  41.47 
 
 
276 aa  190  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256356  hitchhiker  0.00423085 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0827  hemolysin A  39.37 
 
 
270 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1239  hemolysin A  42.06 
 
 
267 aa  189  4e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0904508  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2037  hemolysin A  44.9 
 
 
250 aa  189  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00330226  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1216  hemolysin A  42.06 
 
 
267 aa  189  4e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000350473  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0184  hemolysin A  46.37 
 
 
273 aa  189  5e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3487  hemolysin A  41.37 
 
 
269 aa  187  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000887252  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1541  hemolysin A  41.2 
 
 
266 aa  187  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16661  rRNA methyltransferase  40.08 
 
 
270 aa  187  1e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.186835  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1124  hemolysin A  47.13 
 
 
310 aa  187  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16431  rRNA methyltransferase  42.13 
 
 
270 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1899  hemolysin A  40.07 
 
 
270 aa  187  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000632481  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1058  rRNA methylase  44.76 
 
 
252 aa  186  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00176712  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0319  hemolysin A  45.34 
 
 
272 aa  186  5e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16541  rRNA methyltransferase  40.08 
 
 
270 aa  185  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.435905  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1557  hemolysin A  39.07 
 
 
270 aa  185  8e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0798  putative rRNA methylase  46.69 
 
 
257 aa  185  8e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2026  hemolysin A  46.15 
 
 
267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1825  hemolysin A  44.08 
 
 
242 aa  184  2.0000000000000003e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0615885  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  46.75 
 
 
367 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2620  hemolysin A  48.15 
 
 
264 aa  183  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3862  hemolysin A  45.24 
 
 
267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.199718 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0252  hemolysin A  41.83 
 
 
282 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0935  hemolysin A  37.5 
 
 
264 aa  182  6e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1772  hemolysin A  43.55 
 
 
279 aa  181  8.000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1419  hemolysin A  46.19 
 
 
240 aa  181  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4511  hemolysin A  39.64 
 
 
272 aa  180  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06540  hemolysin A  38.1 
 
 
272 aa  180  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000376214  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1397  hemolysin A  43.78 
 
 
276 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1079  hemolysin A  41.18 
 
 
268 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241342  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1661  hemolysin A  47.92 
 
 
252 aa  179  4e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0132682  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0679  ribosomal RNA large subunit methyltransferase J  40.96 
 
 
267 aa  179  4e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0583  hypothetical protein  39.84 
 
 
270 aa  179  4.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4468  hemolysin A  44.86 
 
 
252 aa  179  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660096  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2669  hemolysin A  45.64 
 
 
251 aa  179  5.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116474  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2318  hemolysin A  39.84 
 
 
277 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0086  hemolysin A  44.76 
 
 
246 aa  177  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.162277  normal  0.205136 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14230  hemolysin A  49.81 
 
 
280 aa  177  2e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0377174  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1510  hemolysin A  43.21 
 
 
271 aa  176  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2654  hemolysin A  44.72 
 
 
257 aa  176  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1289  hemolysin A  37.45 
 
 
269 aa  175  7e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.403831  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1580  hemolysin A  44.76 
 
 
257 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0893  hemolysin A  39.23 
 
 
268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00179005  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0782  hemolysin A  43.28 
 
 
247 aa  173  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.705494  normal  0.486416 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3080  hemolysin A  46.06 
 
 
287 aa  172  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0907  hemolysin A  41.82 
 
 
270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>