More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_13000 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_13000  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 391 aa  773    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0875  thiolase  75.7 
 
 		 391 aa  592  1e-168  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7930  3-oxoadipyl-CoA thiolase  72.12 
 
 		 391 aa  539  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155909  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0626  acetyl-CoA acetyltransferases  70.36 
 
 		 391 aa  531  1e-150  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0380375  decreased coverage  0.00188207 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1013  acetyl-CoA acetyltransferases  69.92 
 
 		 404 aa  521  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0223058  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4593  acetyl-CoA acetyltransferase  67.34 
 
 		 404 aa  517  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3849  acetyl-CoA acetyltransferase  66.75 
 
 		 405 aa  511  1e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4073  acetyl-CoA acetyltransferases  67.86 
 
 		 399 aa  507  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0619  acetyl-CoA acetyltransferase  65.25 
 
 		 407 aa  503  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23240  acetyl-CoA acetyltransferase  64.62 
 
 		 400 aa  488  1e-137  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0554052  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  58.75 
 
 		 402 aa  435  1e-121  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0164  acetyl-CoA acetyltransferase  57.36 
 
 		 394 aa  426  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1582  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  56.83 
 
 		 424 aa  422  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1323  acetyl-CoA acetyltransferase  58.94 
 
 		 402 aa  424  1e-117  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.158351 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  54.39 
 
 		 401 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0492  acetyl-CoA acetyltransferase  54.36 
 
 		 402 aa  413  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  55.42 
 
 		 403 aa  413  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  55.05 
 
 		 398 aa  413  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2156  acetyl-CoA acetyltransferase  57.04 
 
 		 404 aa  406  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.744792  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0115  acetyl-CoA acetyltransferase  55.27 
 
 		 384 aa  407  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.286312  normal  0.0707668 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3063  acetyl-CoA acetyltransferase  53.13 
 
 		 408 aa  390  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 398 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  49.75 
 
 		 398 aa  384  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  49.12 
 
 		 399 aa  381  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3048  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.75 
 
 		 403 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214699  normal  0.389192 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1554  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.62 
 
 		 402 aa  379  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1370  acetyl-CoA acetyltransferase  55.01 
 
 		 399 aa  381  1e-104  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.59343  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7640  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.5 
 
 		 402 aa  375  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202781  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0879  Acetyl-CoA C-acyltransferase  55.5 
 
 		 401 aa  377  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6183  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.12 
 
 		 401 aa  375  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2457  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.12 
 
 		 400 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0514  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.5 
 
 		 402 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.201521  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2825  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.62 
 
 		 401 aa  378  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2258  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.12 
 
 		 401 aa  372  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1484  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.12 
 
 		 401 aa  372  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1582  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.12 
 
 		 401 aa  372  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3268  acetyl-CoA acetyltransferases  51.88 
 
 		 409 aa  373  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4433  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.5 
 
 		 401 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2248  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.87 
 
 		 401 aa  369  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0780819  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1122  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.62 
 
 		 401 aa  370  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2064  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.87 
 
 		 400 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.664786 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1017  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.75 
 
 		 400 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.473484  hitchhiker  0.0000869499 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1231  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.37 
 
 		 400 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000042843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0320  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.25 
 
 		 402 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0301  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.62 
 
 		 401 aa  371  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179307  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3492  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.89 
 
 		 397 aa  369  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.141414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20220  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.37 
 
 		 405 aa  369  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2698  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.5 
 
 		 404 aa  371  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.398036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38200  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.4 
 
 		 401 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3361  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.37 
 
 		 400 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100968 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1359  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.48 
 
 		 401 aa  365  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4307  3-oxoadipyl-CoA thiolase  52.75 
 
 		 399 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4887  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.87 
 
 		 401 aa  367  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589853 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0222  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.63 
 
 		 400 aa  367  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0698438 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1205  acetyl-CoA acetyltransferase  47.37 
 
 		 400 aa  366  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000642816 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2616  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.5 
 
 		 406 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232956 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0525  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.25 
 
 		 402 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.859351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2398  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.52 
 
 		 404 aa  366  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.681376  normal  0.0712183 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02790  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.89 
 
 		 401 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0219063 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3565  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.25 
 
 		 400 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00704584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1812  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.25 
 
 		 400 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0384  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.25 
 
 		 400 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.816364  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0314  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.89 
 
 		 401 aa  364  1e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0482  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.25 
 
 		 400 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.807592  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02905  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.09 
 
 		 402 aa  363  2e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0932  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.25 
 
 		 405 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00352947  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0542  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.25 
 
 		 400 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0885765  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1490  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.25 
 
 		 400 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.159653  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0798  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.25 
 
 		 400 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5587  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.75 
 
 		 400 aa  363  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0263  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.62 
 
 		 400 aa  364  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2126  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.75 
 
 		 400 aa  364  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3669  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51 
 
 		 400 aa  363  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2115  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.25 
 
 		 400 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.749553  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1902  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.25 
 
 		 405 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.19346  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0635  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.25 
 
 		 405 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211029  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3574  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.25 
 
 		 405 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.887338  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2136  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53 
 
 		 401 aa  363  2e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.324266  hitchhiker  0.00675242 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2901  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.75 
 
 		 400 aa  363  3e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00482281  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4811  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.37 
 
 		 401 aa  363  3e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.346578 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6117  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.12 
 
 		 401 aa  363  4e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0867  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.75 
 
 		 402 aa  363  4e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.865704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4011  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52 
 
 		 399 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0170191 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2196  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.86 
 
 		 400 aa  362  6e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3547  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52 
 
 		 405 aa  362  6e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.008459  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1696  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.36 
 
 		 400 aa  362  7.0000000000000005e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.142195 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1034  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.5 
 
 		 400 aa  361  1e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0157191  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0917  acetyl-CoA acetyltransferase  54.86 
 
 		 412 aa  361  1e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0636  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.75 
 
 		 400 aa  361  2e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2485  acetyl-CoA acetyltransferase  51.09 
 
 		 411 aa  360  2e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.397708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5022  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.37 
 
 		 399 aa  360  2e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751086  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05285  acetyl-CoA acetyltransferase  45.77 
 
 		 404 aa  360  3e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3718  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52 
 
 		 400 aa  360  3e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33538  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0659  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.88 
 
 		 401 aa  360  3e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.993676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2629  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.78 
 
 		 406 aa  359  4e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.577515  normal  0.0691319 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3665  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.25 
 
 		 400 aa  359  5e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0598  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.5 
 
 		 400 aa  358  7e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.319983  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4336  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.49 
 
 		 402 aa  358  7e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.834663 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3944  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.88 
 
 		 402 aa  358  7e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0822503  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0302  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.63 
 
 		 401 aa  358  8e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.480832  normal  0.217803 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>