More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_01760 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_01760  family 3 adenylate cyclase  100 
 
 
494 aa  954    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.817284 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1395  putative adenylate/guanylate cyclase  41.9 
 
 
536 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.966002 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5395  putative adenylate/guanylate cyclase  42.06 
 
 
532 aa  306  7e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0939703 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4881  putative adenylate/guanylate cyclase  41.63 
 
 
528 aa  295  1e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0270875 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5181  putative adenylate/guanylate cyclase  41.63 
 
 
528 aa  295  1e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0517978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4795  adenylate/guanylate cyclase  41.63 
 
 
528 aa  295  1e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4184  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  45.5 
 
 
524 aa  287  2.9999999999999996e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.924655 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13674  transmembrane protein  40.16 
 
 
549 aa  287  4e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0475504 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3875  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  41.38 
 
 
499 aa  276  6e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4050  histidine kinase HAMP region domain protein  41.16 
 
 
514 aa  273  6e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11345  adenylate cyclase  37.53 
 
 
541 aa  268  1e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0024164  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2183  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  43.26 
 
 
539 aa  267  4e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000625001  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0577  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  40.37 
 
 
504 aa  265  1e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11351  adenylate cyclase  40.27 
 
 
567 aa  261  3e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.959564 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3854  putative adenylate/guanylate cyclase  37.81 
 
 
540 aa  259  7e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296872  hitchhiker  0.00729431 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3942  putative adenylate/guanylate cyclase  37.81 
 
 
540 aa  259  7e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0593664  normal  0.0915565 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3868  adenylate/guanylate cyclase  37.81 
 
 
540 aa  259  7e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0820885  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2336  putative adenylate/guanylate cyclase  38.05 
 
 
536 aa  259  8e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.469037 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11350  adenylate cyclase  38.11 
 
 
558 aa  256  7e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000457389  normal  0.631682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4309  putative adenylate/guanylate cyclase  37.18 
 
 
536 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.68042 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4265  putative adenylate/guanylate cyclase  39.95 
 
 
488 aa  248  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1200  histidine kinase HAMP region domain protein  40.1 
 
 
570 aa  240  4e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.265792  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0786  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  39.48 
 
 
539 aa  237  3e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2382  putative adenylate/guanylate cyclase  38.14 
 
 
488 aa  226  6e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.627426  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3760  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  36.92 
 
 
522 aa  225  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.244119  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3816  putative adenylate/guanylate cyclase  41.1 
 
 
486 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.206497 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3904  putative adenylate/guanylate cyclase  41.1 
 
 
486 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0256204  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3830  adenylate/guanylate cyclase  41.1 
 
 
486 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11346  adenylate cyclase  49.76 
 
 
217 aa  171  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.306360000000001e-28  normal  0.760848 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  34.41 
 
 
636 aa  150  4e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  33.68 
 
 
487 aa  131  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5211  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  32.85 
 
 
529 aa  129  8.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  36.23 
 
 
500 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  27.78 
 
 
483 aa  127  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  28.04 
 
 
483 aa  127  7e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  31.58 
 
 
483 aa  122  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5302  putative adenylate cyclase  38.69 
 
 
431 aa  119  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  31.86 
 
 
284 aa  117  6.9999999999999995e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  34.12 
 
 
864 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  32.86 
 
 
585 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  29.86 
 
 
593 aa  113  9e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  28.31 
 
 
641 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  31.34 
 
 
860 aa  111  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3665  adenylate/guanylate cyclase  39.77 
 
 
439 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125818  normal  0.715111 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.02 
 
 
723 aa  110  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  34.45 
 
 
725 aa  110  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.02 
 
 
723 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  33.69 
 
 
735 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  32.86 
 
 
741 aa  108  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1795  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  39.2 
 
 
440 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.000135307  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1844  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  29.66 
 
 
725 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.266709 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  33.68 
 
 
746 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  30.88 
 
 
861 aa  105  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  37.14 
 
 
903 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.16 
 
 
611 aa  105  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  29.95 
 
 
614 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  32.42 
 
 
513 aa  104  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3461  adenylate/guanylate cyclase  35.52 
 
 
459 aa  104  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  32.11 
 
 
607 aa  103  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18180  putative Chase2 sensor protein  35.33 
 
 
582 aa  103  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000385352  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  31.48 
 
 
758 aa  103  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  26.86 
 
 
702 aa  103  9e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  30.19 
 
 
441 aa  102  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  31.6 
 
 
859 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2343  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  31.34 
 
 
465 aa  102  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  29.72 
 
 
431 aa  101  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  29.9 
 
 
744 aa  101  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  31.19 
 
 
734 aa  99.8  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  32.88 
 
 
645 aa  99.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  31.34 
 
 
667 aa  99.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2916  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.15 
 
 
575 aa  99  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0753379  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  28.94 
 
 
696 aa  99  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  33.94 
 
 
971 aa  97.4  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.8 
 
 
696 aa  96.7  9e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  28.94 
 
 
758 aa  96.3  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.83 
 
 
737 aa  96.3  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4571  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain protein  32.42 
 
 
546 aa  95.9  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.226096  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1802  adenylate/guanylate cyclase  34.32 
 
 
591 aa  96.3  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  35.67 
 
 
858 aa  95.9  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  28.97 
 
 
911 aa  95.5  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  33.79 
 
 
632 aa  95.5  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  30.64 
 
 
1207 aa  95.5  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0991  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.67 
 
 
703 aa  95.5  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358146  normal  0.0115754 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  28.51 
 
 
758 aa  94.4  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  33.02 
 
 
515 aa  94  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  28.57 
 
 
638 aa  93.6  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  39.31 
 
 
969 aa  93.2  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.63 
 
 
678 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1643  adenylate/guanylate cyclase  36.6 
 
 
536 aa  92.8  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292421  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  26.75 
 
 
701 aa  92.8  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1658  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.8 
 
 
577 aa  93.2  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791017  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  32.18 
 
 
665 aa  93.2  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.9 
 
 
758 aa  92.4  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  32.03 
 
 
651 aa  92.4  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.95 
 
 
757 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.66 
 
 
701 aa  92.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  31.94 
 
 
675 aa  92.4  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  33.51 
 
 
518 aa  91.7  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  28.44 
 
 
794 aa  90.9  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  37.66 
 
 
1160 aa  91.3  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>