36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1952 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1952  hypothetical protein  100 
 
 		 1538 aa  2912    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131034  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  36.47 
 
 		 4480 aa  108  6e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2849  RTX toxin-like protein  44.12 
 
 		 1092 aa  105  8e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  39.89 
 
 		 2042 aa  85.9  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1920  hypothetical protein  33.08 
 
 		 3834 aa  84  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  29.12 
 
 		 3089 aa  82.4  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  38.18 
 
 		 2802 aa  81.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.96 
 
 		 3699 aa  80.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  41.48 
 
 		 2192 aa  79.7  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  36.96 
 
 		 2503 aa  77.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  36.96 
 
 		 3699 aa  76.3  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  41.23 
 
 		 2207 aa  72  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  30.07 
 
 		 3227 aa  72  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  35.1 
 
 		 3066 aa  71.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  35.71 
 
 		 3544 aa  69.7  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  34.25 
 
 		 3477 aa  67.4  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0699  structural toxin protein RtxA  30.77 
 
 		 7679 aa  64.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0681  structural toxin protein RtxA  28.26 
 
 		 7919 aa  62.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0279  cadherin domain/calx-beta domain-containing protein  33.33 
 
 		 5899 aa  62.8  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0272  hypothetical protein  29.48 
 
 		 783 aa  61.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.654602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3452  hypothetical protein  30.26 
 
 		 282 aa  60.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1002  TEK signal peptide protein  38.89 
 
 		 569 aa  58.9  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00217229 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  45.68 
 
 		 1848 aa  58.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  31.77 
 
 		 2927 aa  57.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1000  TEK-like protein  43.36 
 
 		 517 aa  55.8  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0278094 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3174  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  29.48 
 
 		 2715 aa  55.5  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1081  hypothetical protein  35 
 
 		 521 aa  53.9  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2021  hypothetical protein  26.97 
 
 		 296 aa  53.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000885135  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01455  cell wall associated biofilm protein  35.96 
 
 		 3089 aa  50.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0345  hypothetical protein  32.5 
 
 		 724 aa  49.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2157  hypothetical protein  27.41 
 
 		 268 aa  49.3  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0555  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  31.52 
 
 		 1426 aa  49.3  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  22.48 
 
 		 3427 aa  47  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3581  hypothetical protein  28.91 
 
 		 757 aa  46.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.09299  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3305  hypothetical protein  31.54 
 
 		 604 aa  46.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.153336  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4809  putative acid phosphatase protein  29.49 
 
 		 709 aa  45.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.761675 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>