231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1614 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1614  phosphoglyceromutase  100 
 
 
491 aa  1015    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.108207  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1838  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  60.12 
 
 
496 aa  630  1e-179  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000122266  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0563  phosphoglyceromutase  60.41 
 
 
487 aa  625  1e-178  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1044  phosphoglyceromutase  58.57 
 
 
486 aa  592  1e-168  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000497143  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1593  phosphoglyceromutase  55.71 
 
 
487 aa  573  1.0000000000000001e-162  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.102232  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1360  phosphoglyceromutase  54.38 
 
 
487 aa  569  1e-161  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.467829  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0460  phosphoglyceromutase  54.27 
 
 
492 aa  562  1.0000000000000001e-159  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0484  phosphoglyceromutase  54.66 
 
 
492 aa  560  1e-158  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.771416  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1510  phosphoglyceromutase  54.25 
 
 
492 aa  555  1e-157  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0268  phosphoglyceromutase  53.66 
 
 
492 aa  552  1e-156  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0120  phosphoglyceromutase  47.27 
 
 
513 aa  474  1e-132  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0265  phosphoglyceromutase  47.12 
 
 
513 aa  452  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1508  phosphoglyceromutase  47.92 
 
 
512 aa  453  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1298  phosphoglyceromutase  48.12 
 
 
512 aa  455  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00238199  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0133  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  45.44 
 
 
516 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0246  phosphoglyceromutase  45.54 
 
 
516 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  46.92 
 
 
513 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000777024  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3203  phosphoglyceromutase  47.04 
 
 
512 aa  436  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000345113  unclonable  3.7174500000000003e-23 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0257  phosphoglyceromutase  45.35 
 
 
516 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0257  phosphoglyceromutase  45.54 
 
 
516 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.359629  normal  0.907394 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0222  phosphoglyceromutase  45.92 
 
 
516 aa  432  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  46.61 
 
 
514 aa  433  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15800  phosphoglyceromutase  45.91 
 
 
512 aa  434  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0071307  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3594  phosphoglyceromutase  45.54 
 
 
512 aa  435  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901518  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3611  phosphoglyceromutase  46.34 
 
 
510 aa  434  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.055696  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2988  phosphoglyceromutase  46.05 
 
 
516 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00782111  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0309  phosphoglyceromutase  45.56 
 
 
514 aa  429  1e-119  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0235931  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1492  phosphoglyceromutase  43.64 
 
 
507 aa  428  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.392134  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4127  phosphoglyceromutase  46.69 
 
 
512 aa  428  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2259  phosphoglyceromutase  46.23 
 
 
511 aa  426  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1815  phosphoglyceromutase  43.64 
 
 
507 aa  428  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.638605  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0135  phosphoglyceromutase  45.49 
 
 
516 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1837  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  43.71 
 
 
510 aa  424  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.906856  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0235  phosphoglyceromutase  45.15 
 
 
516 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0167  phosphoglyceromutase  44.35 
 
 
505 aa  422  1e-117  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.414873  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0343  phosphoglyceromutase  45.75 
 
 
504 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0555548  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  43.51 
 
 
515 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2016  phosphoglyceromutase  44.97 
 
 
515 aa  419  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0100245  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0093  phosphoglyceromutase  44.98 
 
 
511 aa  422  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.784712  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5029  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  44.21 
 
 
525 aa  419  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0723  phosphoglyceromutase  45.78 
 
 
509 aa  421  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3731  phosphoglyceromutase  45 
 
 
506 aa  421  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1011  phosphoglyceromutase  44.62 
 
 
532 aa  419  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4375  phosphoglyceromutase  45.26 
 
 
510 aa  421  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07160  phosphoglyceromutase  44.75 
 
 
518 aa  417  9.999999999999999e-116  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000681979  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  43.37 
 
 
511 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  43.37 
 
 
511 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1404  phosphoglyceromutase  45.36 
 
 
512 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00187376  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1527  phosphoglyceromutase  44.62 
 
 
540 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0384  phosphoglyceromutase  45.45 
 
 
504 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67770  phosphoglyceromutase  43.31 
 
 
515 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.842673 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2264  phosphoglyceromutase  43.91 
 
 
532 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3774  phosphoglyceromutase  46.11 
 
 
512 aa  413  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000507492  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3858  phosphoglyceromutase  46.11 
 
 
512 aa  415  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0805243 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04670  phosphoglyceromutase  43.17 
 
 
511 aa  412  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2546  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  44.2 
 
 
532 aa  413  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1914  phosphoglyceromutase  45.04 
 
 
518 aa  415  1e-114  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0561  phosphoglyceromutase  42.45 
 
 
521 aa  413  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00179134  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16361  phosphoglyceromutase  44.62 
 
 
540 aa  415  1e-114  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2315  phosphoglyceromutase  43.91 
 
 
532 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.619962 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4246  phosphoglyceromutase  43.46 
 
 
510 aa  412  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0255535 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1764  phosphoglyceromutase  42.57 
 
 
505 aa  413  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  42.57 
 
 
511 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3207  phosphoglyceromutase  45.73 
 
 
513 aa  410  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00207704  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  43.66 
 
 
509 aa  410  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0333  phosphoglyceromutase  42.54 
 
 
508 aa  409  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0676803  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2574  phosphoglyceromutase  45.11 
 
 
514 aa  410  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.597659  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1956  phosphoglyceromutase  43 
 
 
521 aa  410  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.029965  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0436  phosphoglyceromutase  44.74 
 
 
504 aa  412  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15521  phosphoglyceromutase  43.85 
 
 
541 aa  411  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16241  phosphoglyceromutase  44.22 
 
 
540 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27440  phosphoglyceromutase  42.2 
 
 
511 aa  405  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0409  phosphoglyceromutase  43.37 
 
 
511 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.518325 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0891  phosphoglyceromutase  44.94 
 
 
490 aa  406  1.0000000000000001e-112  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12103  2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase  43.37 
 
 
506 aa  407  1.0000000000000001e-112  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.208635  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0046  phosphoglyceromutase  42.8 
 
 
525 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4021  phosphoglyceromutase  42.57 
 
 
513 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0140  phosphoglyceromutase  45.31 
 
 
511 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1776  phosphoglyceromutase  43.2 
 
 
523 aa  407  1.0000000000000001e-112  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.403948  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5327  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  42.15 
 
 
510 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4885  phosphoglyceromutase  42.15 
 
 
529 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2959  phosphoglyceromutase  43.65 
 
 
512 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000558659  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1223  phosphoglyceromutase  43.51 
 
 
517 aa  403  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2164  phosphoglyceromutase  41.55 
 
 
545 aa  402  1e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0638745  normal  0.146059 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4716  phosphoglyceromutase  43.85 
 
 
511 aa  404  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000025941  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4623  phosphoglyceromutase  42.94 
 
 
512 aa  402  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.947003  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2757  phosphoglyceromutase  42.83 
 
 
506 aa  403  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.263811  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2506  phosphoglyceromutase  43.23 
 
 
507 aa  403  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0060  phosphoglyceromutase  42.63 
 
 
513 aa  405  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3166  phosphoglyceromutase  43.31 
 
 
519 aa  402  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0799  phosphoglyceromutase  42.43 
 
 
510 aa  404  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.862146  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0123  phosphoglyceromutase  42.51 
 
 
514 aa  402  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1196  phosphoglyceromutase  42.45 
 
 
506 aa  399  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0723  phosphoglyceromutase  43.31 
 
 
533 aa  401  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.191053  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0475  phosphoglyceromutase  42.37 
 
 
507 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1234  phosphoglyceromutase  44.44 
 
 
523 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.774717  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0379  phosphoglyceromutase  43.52 
 
 
504 aa  401  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3698  phosphoglyceromutase  41.7 
 
 
514 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3023  phosphoglyceromutase  42.11 
 
 
516 aa  400  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.634479  decreased coverage  0.00447978 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3806  phosphoglyceromutase  42.63 
 
 
514 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.823885 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>