246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1376 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1376  ATP-dependent protease peptidase subunit  100 
 
 		 181 aa  363  1e-100  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0253561  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1030  20S proteasome A and B subunits  77.97 
 
 		 181 aa  289  2e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00131886  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0690  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.78 
 
 		 180 aa  280  9e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.516291  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1974  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.44 
 
 		 180 aa  279  2e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0765  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.22 
 
 		 180 aa  278  3e-74  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1336  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.22 
 
 		 180 aa  278  4e-74  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0756  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.22 
 
 		 180 aa  275  2e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.140977  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1221  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.45 
 
 		 177 aa  273  1.0000000000000001e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.622952  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1001  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.22 
 
 		 180 aa  270  1e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1062  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.06 
 
 		 181 aa  257  8e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0842173  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0788  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.5 
 
 		 178 aa  208  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1541  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.65 
 
 		 175 aa  208  3e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1981  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.6 
 
 		 176 aa  205  4e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0677  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.44 
 
 		 182 aa  203  1e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5624  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.48 
 
 		 180 aa  202  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.71 
 
 		 183 aa  202  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0694  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.89 
 
 		 182 aa  202  3e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1226  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.75 
 
 		 176 aa  201  5e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0176208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0017  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.07 
 
 		 178 aa  199  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2014  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.55 
 
 		 187 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0410  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.37 
 
 		 183 aa  197  5e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.312402  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4128  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.54 
 
 		 183 aa  197  6e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  hitchhiker  0.00000056265 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0485  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.91 
 
 		 185 aa  197  6e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00182784 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1323  20S proteasome A and B subunits  56.25 
 
 		 179 aa  196  1.0000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07560  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.02 
 
 		 181 aa  196  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  3.22808e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1556  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.11 
 
 		 181 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.910696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0116  20S proteasome A and B subunits  51.4 
 
 		 180 aa  194  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.940208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3599  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.49 
 
 		 187 aa  194  5.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000487409  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1203  ATP-dependent protease peptidase subunit  50.29 
 
 		 184 aa  194  8.000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0203  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.24 
 
 		 178 aa  193  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0358827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0908  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.44 
 
 		 181 aa  192  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2697  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.27 
 
 		 179 aa  193  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247123  decreased coverage  0.00024653 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2112  ATP-dependent protease peptidase subunit  51.69 
 
 		 204 aa  193  1e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0810  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.89 
 
 		 194 aa  193  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0074  ATP-dependent protease peptidase subunit  51.69 
 
 		 181 aa  192  2e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0256  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.45 
 
 		 176 aa  191  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5464  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.45 
 
 		 176 aa  191  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0644  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.45 
 
 		 186 aa  192  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.820486  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1459  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.78 
 
 		 181 aa  191  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0655  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.45 
 
 		 186 aa  190  8e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.147587 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2541  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.7 
 
 		 188 aa  190  9e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3764  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.76 
 
 		 174 aa  190  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000856229  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2482  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.25 
 
 		 180 aa  189  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000211786  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.36 
 
 		 174 aa  189  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0930  ATP-dependent protease peptidase subunit  51.45 
 
 		 182 aa  189  2e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0149  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.51 
 
 		 186 aa  189  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0303  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.41 
 
 		 190 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1099  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.17 
 
 		 182 aa  189  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.36 
 
 		 174 aa  189  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4103  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.36 
 
 		 174 aa  189  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4376  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.84 
 
 		 183 aa  188  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0818  ATP-dependent protease peptidase subunit  51.72 
 
 		 176 aa  188  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2179  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.37 
 
 		 176 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00206199  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2720  20S proteasome A and B subunits  52.87 
 
 		 179 aa  189  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.211023 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1105  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.25 
 
 		 180 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000745772  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1997  ATP-dependent protease peptidase subunit  51.69 
 
 		 180 aa  188  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0533  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.02 
 
 		 176 aa  188  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0030  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.8 
 
 		 179 aa  187  5e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0600  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.33 
 
 		 172 aa  187  5e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.059342  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0623  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.3 
 
 		 206 aa  187  5.999999999999999e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3877  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.25 
 
 		 180 aa  187  7e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000521125  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3928  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.25 
 
 		 180 aa  187  7e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00131744  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3872  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.25 
 
 		 180 aa  187  7e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0375524  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.25 
 
 		 180 aa  187  7e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19554  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3571  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.25 
 
 		 180 aa  187  7e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000211087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3589  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.25 
 
 		 180 aa  187  7e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000154758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3968  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.25 
 
 		 180 aa  187  7e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000710132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3842  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.25 
 
 		 180 aa  187  7e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.01545e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1315  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.25 
 
 		 180 aa  187  7e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  unclonable  7.14384e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3653  ATP-dependent protease peptidase subunit  51.69 
 
 		 180 aa  187  8e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00119552  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1208  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.94 
 
 		 182 aa  186  1e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0782  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.35 
 
 		 182 aa  187  1e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.639301  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2545  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.14 
 
 		 196 aa  186  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4191  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.02 
 
 		 174 aa  186  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1587  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.17 
 
 		 180 aa  186  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.48223 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3713  ATP-dependent protease peptidase subunit  50.28 
 
 		 176 aa  186  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0839  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.57 
 
 		 184 aa  186  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0375  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.33 
 
 		 174 aa  186  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2000  ATP-dependent protease peptidase subunit  51.43 
 
 		 184 aa  185  3e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.299358  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0121  ATP-dependent protease peptidase subunit  51.7 
 
 		 184 aa  185  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.57821  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4792  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.73 
 
 		 176 aa  185  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000178392 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03517  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.6 
 
 		 174 aa  185  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.839153  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2080  ATP-dependent protease peptidase subunit  51.43 
 
 		 184 aa  184  4e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.431313  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2340  ATP-dependent protease peptidase subunit  50.28 
 
 		 179 aa  184  4e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0674072  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0056  ATP-dependent protease peptidase subunit  51.45 
 
 		 177 aa  184  4e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1029  ATP-dependent protease peptidase subunit  52 
 
 		 174 aa  185  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000258699  unclonable  0.0000000048858 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2987  ATP-dependent protease peptidase subunit  50.28 
 
 		 189 aa  185  4e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0441  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.33 
 
 		 174 aa  185  4e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2248  ATP-dependent protease peptidase subunit  50.87 
 
 		 185 aa  184  5e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0114  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.02 
 
 		 176 aa  184  6e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3781  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.94 
 
 		 174 aa  184  7e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.171501  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  51.96 
 
 		 193 aa  184  7e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2991  ATP-dependent protease peptidase subunit  51.4 
 
 		 181 aa  184  8e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3797  ATP-dependent protease peptidase subunit  51.45 
 
 		 176 aa  183  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4369  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.33 
 
 		 172 aa  183  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0127  ATP-dependent protease peptidase subunit  50.86 
 
 		 184 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.298064 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3436  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.33 
 
 		 182 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.834588  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0531  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.33 
 
 		 174 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00786303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1117  ATP-dependent protease peptidase subunit  50.29 
 
 		 182 aa  183  1.0000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3982  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.57 
 
 		 175 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>