141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0904 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0904  cytochrome c, class I  100 
 
 		 120 aa  248  1e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2365  cytochrome c class I  30.34 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.956584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1873  putative cytochrome c  36.92 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.490249  normal  0.677809 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0149  cytochrome c class I  32.47 
 
 		 287 aa  54.7  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481052  normal  0.118184 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  34.21 
 
 		 213 aa  53.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2881  cytochrome c, class I  36.92 
 
 		 103 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  25.2 
 
 		 216 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  32.38 
 
 		 207 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  32.38 
 
 		 207 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  32.38 
 
 		 207 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  27.1 
 
 		 217 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3091  cytochrome c class I  35.38 
 
 		 273 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.994793  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  31.43 
 
 		 207 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0629  cytochrome c, class I  32.05 
 
 		 102 aa  50.4  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  31.43 
 
 		 207 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  31.43 
 
 		 207 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  31.43 
 
 		 207 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  28.23 
 
 		 202 aa  49.7  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  35.11 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2739  cytochrome c, class I  32.91 
 
 		 218 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  34.72 
 
 		 206 aa  50.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5803  cytochrome c class I  33.72 
 
 		 179 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  0.316784 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  38.46 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0623  cytochrome c family protein  35.38 
 
 		 208 aa  49.7  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000405798  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  34.18 
 
 		 207 aa  50.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  30.39 
 
 		 318 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  30.33 
 
 		 209 aa  48.9  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  32.94 
 
 		 205 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  35.44 
 
 		 200 aa  48.9  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8118  cytochrome c class I  28.26 
 
 		 270 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  34.34 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  32.99 
 
 		 206 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6830  cytochrome c, class I  32.05 
 
 		 292 aa  48.9  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0812003  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0952  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 192 aa  48.5  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000198815  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0543  cytochrome c family protein  35.38 
 
 		 208 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0567  cytochrome c family protein  35.38 
 
 		 208 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4451  cytochrome c class I  33.78 
 
 		 168 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.676804  normal  0.145709 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0618  cytochrome c, class I  35 
 
 		 212 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  32.58 
 
 		 207 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  27.88 
 
 		 216 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4237  cytochrome c class I  32.81 
 
 		 262 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00192123  normal  0.323742 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4048  cytochrome c family protein  33.85 
 
 		 208 aa  47.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1185  cytochrome c, class I  31.82 
 
 		 215 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  23.62 
 
 		 216 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0519  cytochrome c family protein  32.31 
 
 		 208 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003031  cytochrome c4  33.85 
 
 		 203 aa  47.4  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  33.71 
 
 		 108 aa  47  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3432  cytochrome c family protein  32.31 
 
 		 208 aa  47  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.402335  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  32.58 
 
 		 207 aa  47  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  29.52 
 
 		 206 aa  47  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0250  cytochrome c4, putative  30.85 
 
 		 253 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603849  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0064  putative cytochrome C precursor  35.29 
 
 		 222 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215607  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0916  cytochrome c  30.85 
 
 		 253 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  32.08 
 
 		 102 aa  47  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  29.9 
 
 		 207 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3607  cytochrome c family protein  32.31 
 
 		 208 aa  47  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0102183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2656  cytochrome c, class I  33.85 
 
 		 213 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.964453  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0687  cytochrome c class I  36.49 
 
 		 225 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2381  putative cytochrome c4  30.85 
 
 		 249 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336933  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0737  putative cytochrome  30.85 
 
 		 253 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0750  putative cytochrome  30.85 
 
 		 249 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2462  putative cytochrome c4  30.85 
 
 		 249 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0312  putative cytochrome c4 precursor  26.79 
 
 		 193 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717329 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1108  hypothetical protein  27.83 
 
 		 248 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  36.49 
 
 		 191 aa  45.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2696  putative cytochrome c4  30.85 
 
 		 234 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2697  cytochrome c, class I  34.33 
 
 		 236 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0751  cytochrome c, class I  31.25 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000617346  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2057  cytochrome c, class I  34.33 
 
 		 254 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380399  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2668  cytochrome c, class I  34.33 
 
 		 254 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5760  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 266 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0609  cytochrome c4, putative  32.84 
 
 		 253 aa  45.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4249  putative cytochrome subunit of sulfide dehydrogenase  29 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.22639 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2409  cytochrome c-552  35.38 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  28.57 
 
 		 205 aa  44.7  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0629  cytochrome c, class I  34.33 
 
 		 236 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1859  cytochrome c family protein  30 
 
 		 324 aa  44.7  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.886955  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2593  cytochrome c, class I  34.33 
 
 		 229 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.412189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2721  cytochrome c, class I  34.33 
 
 		 229 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3028  class I cytochrome c  36.92 
 
 		 103 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135761  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  27.55 
 
 		 205 aa  44.3  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  30.12 
 
 		 205 aa  44.3  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  39.06 
 
 		 237 aa  44.3  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  30.43 
 
 		 223 aa  44.3  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0288  cytochrome c class I  36.92 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1634  cytochrome c class I  31.08 
 
 		 153 aa  43.9  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0670  cytochrome c553  30.53 
 
 		 205 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.680454  normal  0.316567 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2741  cytochrome c, class I  27.16 
 
 		 218 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0698392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5996  cytochrome c, class I  32.84 
 
 		 236 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.203421 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2793  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 379 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0531198  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1530  cytochrome c class I  32.31 
 
 		 209 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  26.02 
 
 		 206 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2984  pyoverdine biosynthesis protein PvcD  35.82 
 
 		 218 aa  42.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5418  cytochrome c, class I  35.38 
 
 		 200 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  24.69 
 
 		 224 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0524  cytochrome c, class I  36.11 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32530  putative cytochrome c  22.58 
 
 		 217 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.274349 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2756  putative cytochrome c  21.51 
 
 		 217 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170388  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3308  cytochrome c class I  31.34 
 
 		 243 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3894  cytochrome c553-like protein  31.34 
 
 		 271 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.299257 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>