More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0663 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0663  histidine kinase  100 
 
 		 432 aa  865    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.435845  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0234  ATP-binding region ATPase domain protein  48.41 
 
 		 436 aa  390  1e-107  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0979  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.44 
 
 		 406 aa  329  6e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000424013  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1692  histidine kinase  43.6 
 
 		 402 aa  324  2e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00187821  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0243  histidine kinase  42.48 
 
 		 413 aa  321  1.9999999999999998e-86  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.804109  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0746  histidine kinase  45.4 
 
 		 378 aa  280  4e-74  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1232  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 		 479 aa  109  9.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.68 
 
 		 462 aa  107  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3355  histidine kinase  26.97 
 
 		 455 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0504  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.8 
 
 		 450 aa  103  7e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  28.74 
 
 		 501 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3013  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 		 485 aa  100  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.701782 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3591  sensor histidine kinase  29.63 
 
 		 449 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148051  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3012  histidine kinase  24.91 
 
 		 473 aa  99.8  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.250655  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5327  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 		 480 aa  99  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.446982 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5020  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.54 
 
 		 474 aa  98.6  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.323054  normal  0.120297 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3512  sensor histidine kinase  25.46 
 
 		 457 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1840  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.87 
 
 		 478 aa  96.3  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1695  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 435 aa  96.3  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 		 454 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2031  sensor histidine kinase  25 
 
 		 435 aa  96.3  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.465234  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1893  sensor histidine kinase  25.08 
 
 		 457 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1027  histidine kinase  24 
 
 		 477 aa  95.1  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128931 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3018  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 		 454 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2714  sensor histidine kinase  25.83 
 
 		 454 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3038  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.2 
 
 		 454 aa  94  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2754  histidine kinase  24.12 
 
 		 491 aa  93.6  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2674  two-component sensor histidine kinase  26.13 
 
 		 471 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3625  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.44 
 
 		 439 aa  92.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2755  sensor protein qseC  24.83 
 
 		 454 aa  92.4  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3339  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 		 472 aa  92.4  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.184807  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1232  sensor histidine kinase  25.36 
 
 		 448 aa  91.7  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.258987  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3125  sensor protein QseC  24.57 
 
 		 457 aa  91.7  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4694  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.39 
 
 		 513 aa  91.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.49 
 
 		 469 aa  91.3  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1640  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 		 467 aa  90.9  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.135956 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2323  histidine kinase  26.23 
 
 		 497 aa  90.5  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2936  putative transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  22.78 
 
 		 500 aa  90.1  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1338  sensor histidine kinase  26.96 
 
 		 452 aa  90.5  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.117372  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3301  histidine kinase  24.12 
 
 		 439 aa  90.5  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0784  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.8 
 
 		 481 aa  90.1  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.46 
 
 		 452 aa  90.1  7e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18640  sensory histidine protein kinase,two-component  27.88 
 
 		 472 aa  90.1  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1373  sensor protein qseC  27.91 
 
 		 478 aa  89.4  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622972  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1313  sensor protein  27.91 
 
 		 478 aa  89.4  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000254318  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.84 
 
 		 436 aa  89.7  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31140  sensory histidine protein kinase  27.24 
 
 		 412 aa  89.4  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0370261  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2491  histidine kinase  25.08 
 
 		 472 aa  88.6  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147009  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2676  two-component sensor histidine kinase  26.17 
 
 		 471 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0470919  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1039  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 		 1259 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2702  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  23.31 
 
 		 443 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2596  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.15 
 
 		 457 aa  88.6  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3333  histidine kinase  24.71 
 
 		 468 aa  89  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 446 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0126885  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1803  sensor histidine kinase  27.57 
 
 		 450 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43373  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1397  Signal transduction histidine kinase  25.24 
 
 		 513 aa  87.4  4e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000010063  hitchhiker  4.02057e-23 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0137  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.25 
 
 		 438 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2011  sensor histidine kinase  24.1 
 
 		 459 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.62576e-42 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  27.45 
 
 		 459 aa  87.4  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000458656  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1833  sensor histidine kinase  24.1 
 
 		 453 aa  87.4  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1807  sensor histidine kinase  24.1 
 
 		 453 aa  87.4  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000147416  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1976  sensor histidine kinase  24.1 
 
 		 453 aa  87.4  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00238966  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3963  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  23.73 
 
 		 487 aa  87  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.921338  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  24.61 
 
 		 471 aa  86.7  7e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1731  Signal transduction histidine kinase  23.7 
 
 		 366 aa  86.7  7e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000205849  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.51 
 
 		 469 aa  86.7  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 		 446 aa  86.7  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000501512  normal  0.872654 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0135  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  25.44 
 
 		 455 aa  86.7  8e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0665221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1170  heavy metal sensor kinase family protein  26.6 
 
 		 454 aa  86.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1451  histidine kinase  23.02 
 
 		 440 aa  86.7  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.495687  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4830  two-component regulatory system sensory histidine kinase  27.82 
 
 		 457 aa  86.7  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00276208  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2060  sensor histidine kinase  24.4 
 
 		 453 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000124716  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  24.61 
 
 		 471 aa  86.3  9e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1205  heavy metal sensor kinase subfamily  26.6 
 
 		 454 aa  86.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1286  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 441 aa  85.9  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0460995  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1790  sensor histidine kinase  24.1 
 
 		 453 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000385463  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  24.38 
 
 		 478 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1054  heavy metal sensor kinase subfamily  26.6 
 
 		 454 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.28 
 
 		 488 aa  85.9  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0125  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.95 
 
 		 438 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0421257 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13770  signal transduction histidine kinase  26.78 
 
 		 586 aa  85.5  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3218  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 441 aa  85.9  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0024043  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2571  histidine kinase  25.25 
 
 		 489 aa  85.9  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673908 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1159  heavy metal sensor kinase subfamily  26.6 
 
 		 454 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.433807 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1598  histidine kinase  25.36 
 
 		 487 aa  85.1  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0705  sensor histidine kinase  26.59 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.23 
 
 		 465 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1481  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 		 446 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0335199  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  24.77 
 
 		 477 aa  85.5  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3785  histidine kinase  24.5 
 
 		 438 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.5 
 
 		 438 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.592748 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2327  histidine kinase  25.68 
 
 		 467 aa  85.5  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.205174 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  25.97 
 
 		 471 aa  85.1  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1190  heavy metal sensor kinase subfamily  27.09 
 
 		 454 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.39 
 
 		 509 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  23.17 
 
 		 526 aa  84.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0159  histidine kinase  21.79 
 
 		 496 aa  84  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1920  putative two-component sensor  26.34 
 
 		 445 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24130  signal transduction histidine kinase  24.33 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0242619  decreased coverage  0.00839844 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1156  histidine kinase  22.38 
 
 		 441 aa  84.3  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>