More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0500 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0035  molydopterin dinucleotide-binding region  37.63 
 
 		 953 aa  659    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.813982  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0027  molybdenum enzyme related to thiosulfate reductase and polysulfide reductase, large subunit  38 
 
 		 955 aa  656    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0352248  normal  0.101653 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1964  molybdenum enzyme related to thiosulfate reductase and polysulfide reductase, large subunit  38.25 
 
 		 952 aa  657    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.664709  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0500  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 1127 aa  2346    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0056  molydopterin dinucleotide-binding region  38.1 
 
 		 951 aa  645    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0511  molydopterin dinucleotide-binding region  38.55 
 
 		 994 aa  682    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0709241  normal  0.262694 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2173  nitrate reductase  37.91 
 
 		 1016 aa  663    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000388509 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0120  formate dehydrogenase  38.21 
 
 		 953 aa  667    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2934  formate dehydrogenase  37.14 
 
 		 953 aa  655    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1181  molybdopterin oxidoreductase  51.95 
 
 		 1073 aa  1199    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1020  molydopterin dinucleotide-binding region  36.95 
 
 		 977 aa  671    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.961186  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1793  formate dehydrogenase  38.91 
 
 		 1014 aa  657    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.546724  normal  0.0478269 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1612  molydopterin dinucleotide-binding region  35.26 
 
 		 967 aa  595  1e-168  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1988  molydopterin dinucleotide-binding region  30.48 
 
 		 1320 aa  275  4.0000000000000004e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.447837 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1062  molydopterin dinucleotide-binding region  30.34 
 
 		 1318 aa  274  6e-72  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.667972  normal  0.812016 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2605  twin-arginine translocation pathway signal  27.28 
 
 		 879 aa  249  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.746738 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0387  molybdopterin oxidoreductase  26.21 
 
 		 879 aa  226  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2276  molybdopterin oxidoreductase  29.81 
 
 		 807 aa  124  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1999  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.24 
 
 		 657 aa  122  3e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  25.17 
 
 		 722 aa  121  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2338  molybdopterin oxidoreductase  31.3 
 
 		 729 aa  121  7e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1335  molybdopterin oxidoreductase  31.9 
 
 		 928 aa  120  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.374333  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0447  molybdopterin oxidoreductase  24.09 
 
 		 731 aa  120  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2042  twin-arginine translocation pathway signal  32.38 
 
 		 930 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.607166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  31.03 
 
 		 734 aa  120  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1863  molybdopterin oxidoreductase  33.08 
 
 		 932 aa  119  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  26.32 
 
 		 730 aa  118  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1208  molybdopterin oxidoreductase  24.47 
 
 		 947 aa  118  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0265  molybdopterin oxidoreductase  25.27 
 
 		 764 aa  117  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.227459  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2768  molydopterin dinucleotide-binding region  30.07 
 
 		 898 aa  116  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.81742  normal  0.229258 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2374  Nitrate reductase  30.31 
 
 		 821 aa  115  4.0000000000000004e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.037868  normal  0.51028 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6214  molybdopterin oxidoreductase  26.98 
 
 		 978 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02090  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  25.9 
 
 		 734 aa  114  8.000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2001  molybdopterin oxidoreductase  26.54 
 
 		 978 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.754637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3221  molybdopterin oxidoreductase  26.55 
 
 		 973 aa  112  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.461579  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2533  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.27 
 
 		 1010 aa  112  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1509  Formate dehydrogenase  29.32 
 
 		 732 aa  112  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0682  hypothetical protein  29.51 
 
 		 731 aa  112  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.968625  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4573  molybdopterin oxidoreductase  30.39 
 
 		 677 aa  112  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2436  molybdopterin oxidoreductase  29.25 
 
 		 936 aa  111  6e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.982452  normal  0.336779 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1356  molybdopterin oxidoreductase family protein  26.05 
 
 		 973 aa  111  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2338  molybdopterin oxidoreductase  26.05 
 
 		 973 aa  111  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.941239  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2047  molybdopterin oxidoreductase family protein  26.05 
 
 		 978 aa  111  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3106  molybdopterin oxidoreductase  26.46 
 
 		 973 aa  111  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1445  molybdopterin oxidoreductase family protein  26.46 
 
 		 978 aa  111  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  29.73 
 
 		 729 aa  111  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0895  Nitrate reductase  31.13 
 
 		 711 aa  111  8.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.381214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0559  molybdopterin oxidoreductase  24.56 
 
 		 760 aa  111  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0166  Formate dehydrogenase  30.38 
 
 		 711 aa  110  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149305 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1914  thiosulfate reductase  29.84 
 
 		 761 aa  110  1e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.527644  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0555  molybdopterin oxidoreductase  24.56 
 
 		 764 aa  110  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1560  molybdopterin oxidoreductase  32.2 
 
 		 917 aa  110  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.444202 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2632  molybdopterin oxidoreductase  31.33 
 
 		 739 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.348569  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4524  molybdopterin oxidoreductase  26.05 
 
 		 978 aa  110  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.556057 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0059  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  25.7 
 
 		 953 aa  109  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2860  molybdopterin oxidoreductase  24.9 
 
 		 695 aa  109  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1801  molybdopterin oxidoreductase  28.11 
 
 		 961 aa  109  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1071  molybdopterin oxidoreductase family protein  25.67 
 
 		 973 aa  109  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0340  putative molybdopterin oxidoreductase family protein  26.39 
 
 		 969 aa  109  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1386  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE  27.91 
 
 		 799 aa  108  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2813  molybdopterin oxidoreductase  30.92 
 
 		 738 aa  108  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0608  molybdopterin oxidoreductase  24.2 
 
 		 760 aa  108  7e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.714014 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2718  molybdopterin oxidoreductase  30.92 
 
 		 737 aa  108  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3177  polysulfide reductase, subunit A  24.67 
 
 		 760 aa  107  9e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0531  molybdopterin oxidoreductase  24.78 
 
 		 764 aa  108  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  25.15 
 
 		 760 aa  107  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2348  molybdopterin oxidoreductase  28.8 
 
 		 663 aa  107  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.316134  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4227  molybdopterin oxidoreductase  33.08 
 
 		 817 aa  107  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0664  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  29.06 
 
 		 759 aa  107  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0650  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  30.22 
 
 		 759 aa  107  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  24.65 
 
 		 764 aa  107  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0723  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  29.06 
 
 		 759 aa  107  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0769  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  30.22 
 
 		 759 aa  107  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.447962  normal  0.969632 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0112  molybdopterin oxidoreductase  26.59 
 
 		 971 aa  106  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.101891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4940  molybdopterin oxidoreductase  26.59 
 
 		 974 aa  106  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.335021 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02420  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  27.47 
 
 		 824 aa  105  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1743  molybdopterin oxidoreductase  25.88 
 
 		 974 aa  105  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.216268  normal  0.286341 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  24.55 
 
 		 764 aa  105  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2562  formate dehydrogenase  29.48 
 
 		 720 aa  106  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0547  molybdopterin oxidoreductase  26.23 
 
 		 732 aa  105  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1628  molybdopterin oxidoreductase  29.3 
 
 		 691 aa  105  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0607  molydopterin dinucleotide-binding region  29.18 
 
 		 910 aa  105  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.408169 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0954  twin-arginine translocation pathway signal  31.66 
 
 		 927 aa  105  4e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.323124  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  24.75 
 
 		 764 aa  105  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0442  molybdopterin oxidoreductase  23.89 
 
 		 731 aa  105  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3092  molybdopterin oxidoreductase  29.6 
 
 		 791 aa  105  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2919  molybdopterin oxidoreductase  26.48 
 
 		 733 aa  105  6e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1382  molybdopterin oxidoreductase  28.68 
 
 		 678 aa  105  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0219675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0320  Formate dehydrogenase  26.19 
 
 		 700 aa  105  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1675  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  24.5 
 
 		 974 aa  105  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1588  molydopterin dinucleotide-binding region  27.71 
 
 		 945 aa  105  7e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0385421 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  30.71 
 
 		 708 aa  104  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  30.34 
 
 		 745 aa  104  8e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3287  molybdopterin oxidoreductase  23.11 
 
 		 695 aa  104  9e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4110  molybdopterin oxidoreductase  31.08 
 
 		 744 aa  104  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.220187  normal  0.43512 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0307  molybdopterin oxidoreductase  29.55 
 
 		 938 aa  103  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000512628  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1999  twin-arginine translocation pathway signal  29.03 
 
 		 760 aa  103  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3996  molybdopterin oxidoreductase  26.15 
 
 		 979 aa  103  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290267  normal  0.0213209 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1667  Formate dehydrogenase  24.67 
 
 		 704 aa  103  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.982617  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2297  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  25.05 
 
 		 798 aa  103  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000563804 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>