31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2560 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2560  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  567  1e-161  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2748  hypothetical protein  86.75 
 
 		 316 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330993 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2749  hypothetical protein  51.85 
 
 		 353 aa  195  8.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000208383  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0318  hypothetical protein  48.62 
 
 		 343 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1174  hypothetical protein  42.59 
 
 		 321 aa  135  9e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1682  hypothetical protein  47.31 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.345642  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2457  hypothetical protein  39.04 
 
 		 326 aa  106  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1675  hypothetical protein  36.53 
 
 		 278 aa  95.1  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0305  hypothetical protein  32.94 
 
 		 314 aa  89  9e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0536  hypothetical protein  30.58 
 
 		 349 aa  81.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4166  hypothetical protein  34.62 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.237065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1073  hypothetical protein  28.67 
 
 		 330 aa  65.9  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.179281  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1301  hypothetical protein  27.84 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2879  hypothetical protein  30.36 
 
 		 339 aa  57  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5600  hypothetical protein  27.53 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4222  hypothetical protein  28.41 
 
 		 313 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5623  hypothetical protein  26.12 
 
 		 320 aa  53.1  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0083696  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0634  hypothetical protein  24.14 
 
 		 298 aa  53.1  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1744  hypothetical protein  23.74 
 
 		 302 aa  51.6  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0745  hypothetical protein  26.09 
 
 		 316 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2495  hypothetical protein  20.92 
 
 		 297 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000133938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0549  hypothetical protein  23.96 
 
 		 347 aa  46.6  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00564002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1410  hypothetical protein  23.67 
 
 		 347 aa  46.6  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.92034  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4504  hypothetical protein  27.63 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4413  hypothetical protein  20.48 
 
 		 326 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00830012  normal  0.663771 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0688  hypothetical protein  23.81 
 
 		 305 aa  43.5  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.700427  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0412  hypothetical protein  32.86 
 
 		 309 aa  43.9  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2204  hypothetical protein  24.07 
 
 		 297 aa  43.5  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0404  hypothetical protein  32.14 
 
 		 302 aa  43.5  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1794  hypothetical protein  24.5 
 
 		 319 aa  42.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.51439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0604  hypothetical protein  28.24 
 
 		 295 aa  42.4  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>