129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1622 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1622  2-nitropropane dioxygenase, NPD  100 
 
 
487 aa  973    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1611  2-nitropropane dioxygenase NPD  86.97 
 
 
485 aa  811    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0274193 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5685  2-nitropropane dioxygenase, NPD  62.08 
 
 
476 aa  560  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3653  2-nitropropane dioxygenase, NPD  57.94 
 
 
472 aa  490  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.042009  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1713  2-nitropropane dioxygenase, NPD  51.27 
 
 
475 aa  483  1e-135  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000796531  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0849  2-nitropropane dioxygenase, NPD  53.63 
 
 
505 aa  472  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.183629  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0981  2-nitropropane dioxygenase, NPD  52.67 
 
 
472 aa  473  1e-132  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.011325 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4298  2-nitropropane dioxygenase, NPD  49.68 
 
 
481 aa  460  9.999999999999999e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.15389  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2635  putative 2-nitropropane dioxygenase  49.26 
 
 
491 aa  459  9.999999999999999e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1446  putative 2-nitropropane dioxygenase  48.94 
 
 
486 aa  389  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00192568  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50353  predicted protein  41.41 
 
 
553 aa  385  1e-105  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0091  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.56 
 
 
382 aa  78.6  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0756  2-nitropropane dioxygenase NPD  25 
 
 
361 aa  72.8  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3317  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.88 
 
 
382 aa  67.4  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0405  2-nitropropane dioxygenase NPD  24.65 
 
 
376 aa  67  0.0000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0721  2-nitropropane dioxygenase, NPD  25.83 
 
 
363 aa  66.2  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.214896  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3641  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.25 
 
 
386 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1210  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  22.97 
 
 
370 aa  65.1  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0485  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  22.69 
 
 
365 aa  64.3  0.000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1249  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  22.78 
 
 
355 aa  63.5  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1676  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.89 
 
 
396 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0582286  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0406  2-nitropropane dioxygenase NPD  22.42 
 
 
357 aa  62.4  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.25833  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2272  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  25.99 
 
 
424 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.189277  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1158  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.63 
 
 
357 aa  61.6  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0552766 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6322  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26.28 
 
 
396 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1757  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26.28 
 
 
396 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1681  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26.59 
 
 
396 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3113  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.68 
 
 
352 aa  60.8  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2188  putative 2-nitropropane dioxygenase  27.22 
 
 
433 aa  60.1  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000766761 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0114  hypothetical protein  24.26 
 
 
402 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0610  2-nitropropane dioxygenase NPD  20.7 
 
 
417 aa  58.5  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1770  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.28 
 
 
396 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.763797 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0670  2-nitropropane dioxygenase NPD  22.17 
 
 
421 aa  58.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5053  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26.28 
 
 
396 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1279  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  23.68 
 
 
363 aa  58.5  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0434534  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1506  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.3 
 
 
396 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.186362 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1283  2-nitropropane dioxygenase NPD  24.7 
 
 
396 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.756319 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0619  oxidoreductase (2-nitropropane dioxygenase family)  22.93 
 
 
366 aa  57.4  0.0000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2083  2-nitropropane dioxygenase, NPD  23.78 
 
 
393 aa  57.4  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.683958 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0626  2-nitropropane dioxygenase, NPD  23.91 
 
 
419 aa  57.8  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1305  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  25.38 
 
 
396 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.302592  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2182  putative dioxygenase related to 2-nitropropane dioxygenase  24.39 
 
 
414 aa  56.2  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000148707  unclonable  0.000000279866 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2314  2-nitropropane dioxygenase  25.38 
 
 
396 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0779  2-nitropropane dioxygenase NPD  21.86 
 
 
418 aa  56.2  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1586  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  22.87 
 
 
373 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.385159  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1851  2-nitropropane dioxygenase NPD  22.73 
 
 
373 aa  56.6  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000135103  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1334  2-nitropropane dioxygenase, NPD  23.2 
 
 
414 aa  56.2  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.413147  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0103  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  25.38 
 
 
396 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2128  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  25.38 
 
 
396 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.364934  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2183  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  25.38 
 
 
396 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1062  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  25.38 
 
 
396 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0498  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  23.31 
 
 
363 aa  56.6  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.142021  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0649  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.81 
 
 
365 aa  55.8  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2873  2-nitropropane dioxygenase, NPD  23.37 
 
 
415 aa  55.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5061  2-nitropropane dioxygenase, NPD  24.09 
 
 
415 aa  55.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.877356  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1792  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  25.38 
 
 
396 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.34549  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0500  hypothetical protein  23.46 
 
 
419 aa  55.1  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.546917 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1164  2-nitropropane dioxygenase, NPD  23.71 
 
 
373 aa  55.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.121776  normal  0.303682 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1939  2-nitropropane dioxygenase NPD  22.43 
 
 
419 aa  54.3  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1061  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  23.12 
 
 
355 aa  53.9  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.992497  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1055  2-nitropropane dioxygenase, NPD  22.4 
 
 
361 aa  53.5  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.455716  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0188  hypothetical protein  21.63 
 
 
417 aa  52.8  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0706904  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1286  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  23.3 
 
 
363 aa  52.8  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000131785  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1025  2-nitropropane dioxygenase NPD  21.99 
 
 
366 aa  52.8  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1406  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  23.86 
 
 
363 aa  52.4  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  unclonable  0.00324657  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5565  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.54 
 
 
405 aa  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286036  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1140  hypothetical protein  34.75 
 
 
355 aa  52.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1945  putative 2-nitropropane dioxygenase  24.48 
 
 
396 aa  52.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00553543  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2755  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.27 
 
 
359 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0669905  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1184  2-nitropropane dioxygenase NPD  22.85 
 
 
414 aa  51.6  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0766  2-nitropropane dioxygenase NPD  21.53 
 
 
373 aa  52  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0843777 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2248  2-nitropropane dioxygenase NPD  22.99 
 
 
360 aa  51.6  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.69113  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2314  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.44 
 
 
396 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.16521 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4714  putative 2-nitropropane dioxygenase  32.82 
 
 
358 aa  51.2  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0455  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  23.58 
 
 
363 aa  50.8  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000000961366  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4565  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.99 
 
 
381 aa  50.8  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.190968 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3815  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.88 
 
 
314 aa  50.4  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1940  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.3 
 
 
348 aa  50.1  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0127053 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1135  hypothetical protein  33.63 
 
 
350 aa  49.7  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0977  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.55 
 
 
380 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.652012  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1538  2-nitropropane dioxygenase, NPD  23.45 
 
 
414 aa  48.9  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3371  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.03 
 
 
354 aa  48.9  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.940632  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4381  2-nitropropane dioxygenase NPD  22.49 
 
 
417 aa  48.9  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2392  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.76 
 
 
363 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.895701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3542  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.75 
 
 
361 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0130805 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0029  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.76 
 
 
346 aa  47.4  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.58495  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25780  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  40.68 
 
 
177 aa  47  0.0009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2972  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family  33.86 
 
 
359 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24605  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0152  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.43 
 
 
345 aa  46.6  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.174988  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2259  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.53 
 
 
371 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.392208 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0271  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.58 
 
 
365 aa  46.2  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0445  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.64 
 
 
349 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2277  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.58 
 
 
340 aa  46.6  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.88 
 
 
355 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3814  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.03 
 
 
349 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.88 
 
 
355 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3888  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.64 
 
 
349 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1803  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  23.67 
 
 
392 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0431  trans-2-enoyl-ACP reductase II  29.63 
 
 
321 aa  45.8  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4010  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.65 
 
 
349 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>