More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0183 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0183  methyltransferase type 11  100 
 
 
223 aa  450  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0293588  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0198  methyltransferase type 11  78.24 
 
 
217 aa  319  3e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0695927  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0373  Methyltransferase type 11  53.69 
 
 
222 aa  142  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  39.68 
 
 
228 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.88 
 
 
215 aa  98.6  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2683  methyltransferase type 11  36.99 
 
 
220 aa  88.2  8e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2559  methyltransferase type 11  31.72 
 
 
228 aa  84  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  39.83 
 
 
295 aa  79.3  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 
227 aa  78.2  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3419  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.05 
 
 
299 aa  76.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1339  methyltransferase type 11  29.85 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2428  methyltransferase type 12  35.95 
 
 
225 aa  77  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  38.94 
 
 
282 aa  75.5  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1591  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.6 
 
 
221 aa  74.3  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  33.33 
 
 
202 aa  74.7  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  36.07 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1475  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.11 
 
 
221 aa  74.7  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576982  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  40.16 
 
 
257 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  34.59 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  34.59 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  36.57 
 
 
269 aa  72.4  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  32.28 
 
 
286 aa  71.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 
275 aa  71.6  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  35.22 
 
 
282 aa  70.9  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  32.69 
 
 
263 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  36.59 
 
 
274 aa  70.1  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6814  Methyltransferase type 11  31.72 
 
 
219 aa  70.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  31.35 
 
 
272 aa  70.1  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  29.94 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2671  SAM-dependent methyltransferase  31.71 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2710  methyltransferase type 11  29.87 
 
 
219 aa  69.3  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0189478  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  32.93 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  37.29 
 
 
295 aa  68.6  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  28.76 
 
 
199 aa  68.2  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  35.34 
 
 
273 aa  68.2  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  40.87 
 
 
457 aa  68.2  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  33.77 
 
 
276 aa  67.8  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  32.08 
 
 
278 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  41.75 
 
 
252 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0673  methyltransferase type 11  36.22 
 
 
253 aa  67  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  33.78 
 
 
268 aa  67  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  35.54 
 
 
281 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  35.94 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.38 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2596  Methyltransferase type 11  26.83 
 
 
311 aa  65.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1312  methyltransferase type 11  33.6 
 
 
303 aa  66.2  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.117711  hitchhiker  0.0001856 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.79 
 
 
269 aa  65.9  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1955  methyltransferase type 11  37.8 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  29.05 
 
 
214 aa  65.5  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1190  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.2 
 
 
272 aa  65.5  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 
254 aa  65.1  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2539  Methyltransferase type 11  30.48 
 
 
237 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.459192  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.07 
 
 
207 aa  64.7  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  32.48 
 
 
213 aa  64.7  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0101  Methyltransferase type 11  37.3 
 
 
272 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  34.96 
 
 
266 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 
254 aa  64.7  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
187 aa  64.7  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  28.45 
 
 
221 aa  64.3  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  35.07 
 
 
253 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
348 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  30.95 
 
 
269 aa  63.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  33.56 
 
 
319 aa  63.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  29.85 
 
 
259 aa  63.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2133  methyltransferase type 11  30.23 
 
 
262 aa  63.2  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.917807  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3864  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 
305 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1588  Methyltransferase type 11  28.89 
 
 
224 aa  63.5  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.666171  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3913  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 
305 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.100491  normal  0.248183 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1676  putative methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine (SAM)-MTase protein  33.02 
 
 
268 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.921474  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  27.82 
 
 
201 aa  63.2  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  33.14 
 
 
291 aa  63.2  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2782  methyltransferase type 11  39.6 
 
 
234 aa  63.2  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320592  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1462  methyltransferase type 11  34 
 
 
209 aa  63.5  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2248  demethylmenaquinone methyltransferase  36.89 
 
 
250 aa  62.8  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16301  methyltransferase  37.14 
 
 
357 aa  62.8  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.346442 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2889  methyltransferase type 11  36.22 
 
 
273 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000212071 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3788  type 11 methyltransferase  29.03 
 
 
306 aa  62.4  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3130  hypothetical protein  33.33 
 
 
305 aa  62.4  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1204  generic methyl-transferase  32 
 
 
363 aa  62.4  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  30.94 
 
 
266 aa  62.4  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11434  methyltransferase  33.91 
 
 
274 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00184811  normal  0.364084 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  31.36 
 
 
285 aa  62  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  33.08 
 
 
309 aa  62.4  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  34.67 
 
 
310 aa  62.4  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1056  methyltransferase type 11  32.11 
 
 
221 aa  62  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.270016  normal  0.802402 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1015  Methyltransferase type 11  38.24 
 
 
213 aa  62  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371605  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  37.31 
 
 
305 aa  61.6  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
255 aa  61.6  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  37.14 
 
 
226 aa  61.6  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04625  arsenic methyltransferase Cyt19, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G15020)  27.27 
 
 
282 aa  60.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  36.89 
 
 
239 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4655  Methyltransferase type 11  36.76 
 
 
310 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2269  methyltransferase type 11  29.32 
 
 
240 aa  61.2  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.541668  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  31.37 
 
 
235 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0842  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.71 
 
 
235 aa  61.2  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3305  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5925  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.43 
 
 
248 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  36.89 
 
 
239 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  32.14 
 
 
236 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>