176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0676 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3866  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  100 
 
 
365 aa  729    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.559786  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0676  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  100 
 
 
365 aa  729    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4987  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  46.96 
 
 
367 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4739  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  46.69 
 
 
367 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4579  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase; selenocysteine synthase  46.96 
 
 
367 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5099  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  46.69 
 
 
367 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0918  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  45.08 
 
 
372 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5002  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  46.96 
 
 
367 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4598  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase; selenocysteine synthase  46.69 
 
 
367 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4959  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  46.69 
 
 
367 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0261  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  46.69 
 
 
367 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.262008  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4974  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  46.41 
 
 
367 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4697  hypothetical protein  44.14 
 
 
372 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.547246 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4847  hypothetical protein  43.87 
 
 
372 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.601246  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4688  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  46.41 
 
 
367 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4728  hypothetical protein  43.6 
 
 
372 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4792  hypothetical protein  43.87 
 
 
372 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4826  hypothetical protein  43.6 
 
 
372 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0430  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  42.74 
 
 
372 aa  299  6e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3153  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  42.09 
 
 
373 aa  298  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4375  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  42.9 
 
 
372 aa  297  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.417275 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3975  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  44.54 
 
 
369 aa  289  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.133901  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3993  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  44.81 
 
 
369 aa  289  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4098  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  44.54 
 
 
369 aa  288  9e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4161  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  44.54 
 
 
369 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60373  normal  0.579159 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4047  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  44.54 
 
 
369 aa  286  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0548491 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0105  hypothetical protein  42.69 
 
 
348 aa  279  5e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3272  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  43.96 
 
 
369 aa  278  8e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2990  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  37.02 
 
 
398 aa  241  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.625674  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5759  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  36.9 
 
 
398 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.646746  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6666  L-seryl-tRNA selenium transferase  36.13 
 
 
398 aa  222  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184749  normal  0.0169225 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5094  L-seryl-tRNA(ser) selenium transferase  36.81 
 
 
398 aa  216  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2704  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  35.61 
 
 
402 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249088  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0940  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  29.12 
 
 
400 aa  171  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1144  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  30.31 
 
 
388 aa  160  2e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.46182  normal  0.521262 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1021  Pyridoxal phosphate-dependent transferase  26.65 
 
 
407 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0099  L-seryl-tRNA selenium transferase  28.5 
 
 
406 aa  142  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.789274  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3964  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  29.62 
 
 
407 aa  136  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.741974  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3968  L-seryl-tRNA(ser) selenium transferase protein  28.74 
 
 
406 aa  135  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.456181  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2440  selenocysteine synthase (seryl-tRNASer selenium transferase)-like protein  28.74 
 
 
406 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0244624  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0175  Pyridoxal phosphate-dependent transferase  28.81 
 
 
411 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6463  selenocysteine synthase (seryl-tRNASer selenium transferase)-like protein  26.98 
 
 
414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0672  selenocysteine synthase  26.05 
 
 
462 aa  101  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3059  selenocysteine synthase  27.82 
 
 
483 aa  96.7  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00615002  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3060  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  27.34 
 
 
491 aa  92  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000814567  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2186  selenocysteine synthase  23.8 
 
 
475 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000130274  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2561  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  25.86 
 
 
470 aa  87.8  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0873  selenocysteine synthase  26.28 
 
 
468 aa  87  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3879  selenocysteine synthase  28.87 
 
 
468 aa  86.7  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.797755 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1646  selenocysteine synthase  24.94 
 
 
471 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000318162  unclonable  0.000000000338513 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3477  L-seryl-tRNA selenium transferase  27.86 
 
 
473 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.213454  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3766  selenocysteine synthase  25.87 
 
 
462 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0042  selenocysteine synthase  25.87 
 
 
462 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1311  selenocysteine synthase  28.01 
 
 
506 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000207864 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4115  selenocysteine synthase  25.87 
 
 
462 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1093  selenocysteine synthase  24.14 
 
 
473 aa  83.6  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0482  selenocysteine synthase  26.41 
 
 
489 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.112411  hitchhiker  0.001297 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4157  selenocysteine synthase  27.18 
 
 
478 aa  82.8  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.109282 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2085  selenocysteine synthase  26.89 
 
 
462 aa  82  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2373  selenocysteine synthase  26.72 
 
 
462 aa  82  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0140  selenocysteine synthase  25.9 
 
 
463 aa  80.5  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1162  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  24.38 
 
 
476 aa  79  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103584 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3796  selenocysteine synthase  28.17 
 
 
468 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.245945  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3919  selenocysteine synthase  25.37 
 
 
463 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.419812 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4267  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  26.09 
 
 
476 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000207221  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2477  selenocysteine synthase  26.64 
 
 
448 aa  77  0.0000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1740  selenocysteine synthase  23.57 
 
 
475 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.820555  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0481  selenocysteine synthase (seryl-tRNASer selenium transferase)-like protein  24.36 
 
 
511 aa  76.3  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11487  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0819  selenocysteine synthase  24.92 
 
 
461 aa  76.3  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0441  selenocysteine synthase  27.09 
 
 
491 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03446  selenocysteine synthase  29.55 
 
 
463 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0117  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  29.55 
 
 
463 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03397  hypothetical protein  29.55 
 
 
463 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4006  selenocysteine synthase  29.55 
 
 
463 aa  74.7  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4962  selenocysteine synthase  29.55 
 
 
463 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.922888  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3796  selenocysteine synthase  29.55 
 
 
463 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.915143  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4089  selenocysteine synthase  29.55 
 
 
463 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0122  selenocysteine synthase  29.55 
 
 
463 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0440  selenocysteine synthase  26.98 
 
 
491 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4068  selenocysteine synthase  25.27 
 
 
463 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3961  selenocysteine synthase  25.27 
 
 
463 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.498417  normal  0.481861 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4162  selenocysteine synthase  24.74 
 
 
462 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0760  selenocysteine synthase  25.08 
 
 
472 aa  74.3  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.306605  normal  0.694521 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3897  selenocysteine synthase  25.27 
 
 
463 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3883  selenocysteine synthase  25.27 
 
 
463 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.851696  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4006  selenocysteine synthase  25.27 
 
 
463 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.247282 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0301  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  24.75 
 
 
466 aa  73.9  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0090  selenocysteine synthase  23.61 
 
 
463 aa  73.6  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2867  selenocysteine synthase  23.12 
 
 
465 aa  72.8  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0108  selenocysteine synthase  26.32 
 
 
476 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0061  selenocysteine synthase  27.07 
 
 
462 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0506  selenocysteine synthase  26.15 
 
 
468 aa  72  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.487693  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0104  selenocysteine synthase  26.32 
 
 
476 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0109  selenocysteine synthase  26.32 
 
 
476 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2504  selenocysteine synthase  24.2 
 
 
470 aa  70.9  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0196405  normal  0.0690834 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4521  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  28.5 
 
 
472 aa  69.7  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0105  selenocysteine synthase  26.32 
 
 
473 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1608  selenocysteine synthase  26.13 
 
 
435 aa  69.7  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0237465  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0412  selenocysteine synthase  26.67 
 
 
491 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2392  selenocysteine synthase  24.45 
 
 
480 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.36039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>