More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6987 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  100 
 
 
409 aa  825    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1860  cytochrome P450  51.98 
 
 
421 aa  350  3e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175723  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1867  cytochrome P450  49.63 
 
 
423 aa  331  1e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6190  cytochrome P450  46.67 
 
 
406 aa  331  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  45.11 
 
 
404 aa  291  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2663  cytochrome P450  41.02 
 
 
408 aa  291  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2480  cytochrome P450  41.1 
 
 
408 aa  288  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.59505  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  38.65 
 
 
407 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  38.65 
 
 
407 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  38.65 
 
 
407 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  39.75 
 
 
402 aa  252  7e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  39.02 
 
 
405 aa  252  9.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  43.01 
 
 
402 aa  249  4e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  37.67 
 
 
419 aa  249  5e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  38.13 
 
 
410 aa  249  6e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  41.6 
 
 
401 aa  246  6.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  36.74 
 
 
411 aa  244  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  38 
 
 
409 aa  243  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  36.8 
 
 
417 aa  243  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  38.93 
 
 
426 aa  241  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  35.77 
 
 
412 aa  239  4e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  36.36 
 
 
412 aa  238  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  35.79 
 
 
417 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  40.69 
 
 
418 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  35.99 
 
 
405 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  37.88 
 
 
417 aa  236  7e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  36.25 
 
 
407 aa  235  9e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  39.07 
 
 
398 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  36.45 
 
 
413 aa  233  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1816  cytochrome P450  36.92 
 
 
415 aa  231  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.393276  normal  0.302822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2115  cytochrome P450  40 
 
 
430 aa  229  5e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  34.6 
 
 
406 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  35.84 
 
 
408 aa  229  7e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  35.38 
 
 
409 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  42.19 
 
 
399 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  37.78 
 
 
410 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  40.98 
 
 
410 aa  227  4e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  36.13 
 
 
404 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  41.3 
 
 
412 aa  226  6e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0067  cytochrome P450  38.06 
 
 
423 aa  226  8e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  34.34 
 
 
406 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0677  cytochrome P450  38.84 
 
 
402 aa  225  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113337  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  36.2 
 
 
420 aa  225  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  39.93 
 
 
410 aa  224  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  39.44 
 
 
417 aa  224  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4666  cytochrome P450  41.21 
 
 
450 aa  224  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2495  cytochrome P450  38.01 
 
 
464 aa  223  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  40.06 
 
 
408 aa  223  7e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0160  cytochrome P450  36.74 
 
 
413 aa  222  7e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486467  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  37.08 
 
 
429 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  34.5 
 
 
405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4599  cytochrome P450  36.98 
 
 
417 aa  219  5e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.995024  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0433  cytochrome P450  35.8 
 
 
447 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0443  cytochrome P450  35.8 
 
 
447 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0122986 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  39.4 
 
 
408 aa  219  6e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  44.48 
 
 
400 aa  219  7.999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  35.87 
 
 
423 aa  219  7.999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0288  cytochrome P450  35 
 
 
444 aa  219  7.999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000866708  normal  0.107645 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  39.18 
 
 
402 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  40.9 
 
 
406 aa  218  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0600  cytochrome P450  34.6 
 
 
443 aa  218  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.441621  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0420  cytochrome P450  35.8 
 
 
447 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1726  cytochrome P450  37.66 
 
 
387 aa  217  2.9999999999999998e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  35.04 
 
 
411 aa  217  4e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  37.53 
 
 
388 aa  216  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  38.06 
 
 
416 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  38.07 
 
 
411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1259  cytochrome P450  41.74 
 
 
422 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310124 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1193  cytochrome P450  37.34 
 
 
390 aa  213  7e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11908  cytochrome P450 140 cyp140  36.02 
 
 
438 aa  213  7e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.818643 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1945  putative cytochrome P450  35.06 
 
 
442 aa  212  9e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  34.62 
 
 
412 aa  210  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  35.28 
 
 
411 aa  210  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  35.28 
 
 
411 aa  209  5e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  35.28 
 
 
411 aa  209  7e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  37.63 
 
 
400 aa  209  7e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  38.56 
 
 
411 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2331  cytochrome P450  35.86 
 
 
417 aa  208  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  35.58 
 
 
411 aa  207  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  35.58 
 
 
411 aa  208  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0597  cytochrome P450  35.53 
 
 
393 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.16463  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  35.58 
 
 
411 aa  207  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  35.58 
 
 
411 aa  207  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  40.13 
 
 
412 aa  206  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  35.28 
 
 
411 aa  206  5e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  35.28 
 
 
411 aa  206  8e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1946  cytochrome P450 hydroxylase  34.77 
 
 
393 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0674  cytochrome P450  41.27 
 
 
421 aa  205  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.544663  normal  0.200583 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  37.71 
 
 
414 aa  205  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  41.07 
 
 
418 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  40.71 
 
 
423 aa  204  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  35.68 
 
 
405 aa  204  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  34.66 
 
 
411 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5420  cytochrome P450  36.53 
 
 
468 aa  203  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  37.17 
 
 
402 aa  202  9e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  38.3 
 
 
414 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  35.25 
 
 
405 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  43.38 
 
 
398 aa  201  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  34.36 
 
 
400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  32.82 
 
 
402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>